Basic Information
Symbol
hsa_DNAJC6_0007700
RNA Class
circRNA
Alias
hsa_circ_0113910
hsa_circDNAJC6_005
hsa-DNAJC6_0003
Host gene
DNAJC6
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
1:65830318-65860715
UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
1:65364635-65395032
UCSC (hg38)
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-562.6 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-594.97 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
398.16
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(.((......((((....)))))))(((((.(((((((((.((.((((...(((..(((((((((((((((.((((((((((....))))))).....((((.........))))((((((((((((((...(((......((((..((((((..((((((((((.......)))).))).)))..((((((((((...(((((((((......((((((..((((((.....(((((..(((((((((((..(((...))).)))))....)))))).((((((((..........(((((....(((((((((((.(((((....(((((....)))))...((((((.(((((..(((..(((((((((....(((((((...))))))).......((((((.(((.(((((...........)))))))).))))))...((((...((((((((.(((....(((((((..((.((((((............(((.(((((....(((((.((((((..................((((...)))).(((.((((.....))))..))).)))))).)))))...)))))..))).(((.....)))(((((...(((.((.((....)))).))))))))..))))))))..))))))).((((.((((..(((..(((((.((.((..(.(((((.((((((........)))))).)).))).)..)).)).)))))..))).))))))))...............)))..))))))))))))...(((((((.((........((((...))))....)))))))))(((((.(((....))).)))))..((((((......))))))......)).))))))))))))))).))))))..))))).)))))))........))))..(((((.((((((.....)))))).........)))))......(((((((..(((((....(((((((.(((.((...(.(((((.........)))))).)).))).))))))).....))))).))))))).....((((((....(((..........)))....)))))).....))))).....)))))))))))))))))))(((.(((((((....((((...............))))....))))))).)))................))))))........)))))))))(((....(((((((((((((..........)))))....)))))))).....))))))))).)))).((((((.((((((((.........((((((((.....(((((.........))))))))))))).(((..((((((...))).)))..))).((((.(.(((((...((((((((.((........)).)).....(((((((.((((..(((.((((.......))))..)))..)))).))).))))...........)))))))))))...).))))((.(((.((((......(((....))).......))))))).))))).)))))))))))......)))))))))))))....)))))))))))))).......((((((....))))))..............))).))))).)))))((((.(((...............))))))).(((((((((..((............)).))))))))).........((((((((..((((((((((......))))....))))))..)))..))))))))))..))).....)))).)).))))).)))).)))...))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(.((..,...{{{{....)))})))(((((.(((((((((.(({((((...(((..(((((((((((((((.((({((((((....))))))}.....{(({..,......)))}(((((((((((((((({({,.....}}{(((........)}}}..,(((((({((((.......{(((.((((.((((((({...(((((((((,,{{{{{(((((((((,.(((((.((((((.((,.(((((.((.((..(((((({....}))))))..)}..}}.)}}}},,......(((((((((.((((.(((............(((((....))))),(((((.(((((.,........,..)))))....,(((((((...)))))))...........)))))))).))))...))))),,)))((....)).)))))).....))))).,})))))))}..{{{{{||.,||,)))|}))))))}.))))))))..)))).})}}.......)))}.})))))),}}}|{((((((((((((((....,.((((.....)))).,,||{{{(,,.{{(,|{{{{||||,.,|...,{(,{,...,,(((((...(((.((.((....)))).))))))))....,,,,,,{{{{{{{|..((((.((({..(((..(((((.((.{(..{.{({,(|((((((........)))))).)).))).)..}}.)).)))))..))).)))))))).............,(..((((((((({{{(({(..((((({{{((...,....(((,...))))....)))))))))..))))).}},.}))))))))..)|(((((......)))))).,}.)})))))}.....,,{|((((((((((.((((((..(((((..........,....(((((.,,,,,,.....,)))))........{|||,,.....)}))......).))))).)))))))))}.,.((((.(((((((.........{{{((((((.((.....)).)))....)))))),..........((((((....(((.,......}.)))....)))))).))))))))))),....(((((........))))).,,(({{(((....((((,........,.....))))....})))))}..)))))).,..}.,,,,|||||......{((((((((.,.,,,,{..((((((,{{{(((((.......,..)))))),,(((({.{{{.((((....)))),||}((((((.{.(((((,....,,|.....((((((((.....(((((.,.....,.))))))))))))).(((,.((((((...)))},)),.)))..,,,...,((((...((((((((.((........)).)).{{,,(((({((,((((..(((.((((.......))))..)))..)))).))).))))..,}.,,....))))))))))).)))))).)))))),,,...})))))))))))..))}.,,))))))))))))))))).})))))))),|,....))))))...)))))))))))))))))))))).......((((((....))))))...},.........))).)))))},))))(((,{(((..,,......,....))))))),(((((((((..((............)).))))))))).........((((((((..((((((((((......))))....))))))..)))..))))))))))..))),.}}.,))),}).))))).)))).)))...))
Forensic Context
No forensic context available.