Basic Information

Symbol
hsa_DNAJC6_0007900
RNA Class
circRNA
Alias
hsa_circ_0113911 hsa_circDNAJC6_007 hsa-DNAJC6_0017
Host gene
DNAJC6
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
1:65830318-65871816 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
1:65364635-65406133 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-718.9 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -760.68 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 566.94
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.((......(((((....)))))((((....))))(((((((.....)))..(((....((((((((((((.((((((((((....))))))).....((((.........))))((((((((((((((...(((......((((..((((((..((((((((((.......)))).))).)))..((((((((((...(((((((((......((((((..((((((.....(((((..(((((((((((..(((...))).)))))....)))))).((((((((..........(((((....(((((((((((.(((((....(((((....)))))...((((((.(((((..(((..(((((((((....(((((((...))))))).......((((((.(((.(((((...........)))))))).))))))...((((...((((((((.(((....(((((((..((.((((((............(((.(((((....(((((.((((((..................((((...)))).(((.((((.....))))..))).)))))).)))))...)))))..))).(((.....)))(((((...(((.((.((....)))).))))))))..))))))))..))))))).((((.((((..(((..(((((.((.((..(.(((((.((((((........)))))).)).))).)..)).)).)))))..))).))))))))...............)))..))))))))))))...(((((((.((........((((...))))....)))))))))(((((.(((....))).)))))..((((((......))))))......)).))))))))))))))).))))))..))))).)))))))........))))..(((((.((((((.....)))))).........)))))......(((((((..(((((....(((((((.(((.((...(.(((((.........)))))).)).))).))))))).....))))).))))))).....((((((....(((..........)))....)))))).....))))).....)))))))))))))))))))(((.(((((((....((((...............))))....))))))).)))................))))))........)))))))))(((....(((((((((((((..........)))))....)))))))).....))))))))).)))).((((((.((((((((.........((((((((.....(((((.........))))))))))))).(((..((((((...))).)))..))).((((.(.(((((...((((((((.((........)).)).....(((((((.((((..(((.((((.......))))..)))..)))).))).))))...........)))))))))))...).))))((.(((.((((......(((....))).......))))))).))))).)))))))))))......)))))))))))))....)))))))))))))).......((((((....))))))..............))).))))).)))))))))).......))))..(((.......)))(((((((((..((............)).))))))))).........((((((((..((((((((((......))))....))))))..)))..)))))........)).((((......((((((..(((((.((.(..((((((((.(((.((((((........))).))).)))((((((.((..((((..((((((((.......(((((((.((..(((((.........((((....))))(((..(((....)))..)))...)))))((((.....(((((..((((...)))).....)))))......))))....((((((..(((((((((((((......((.((((.((((.....)))))))).))...((((((.(((((((((((......)))).......)))...)))).)))))))))))).)))))))))))))....((((....))))...)).))))))).....))))))))....))))..))))))))...............((((.(((....))))))).))))))))..).))....))))).))))))........))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
({.,,....(((((....)))))|((({,,.||||(((((.(({{({(.,.(((..{{{((((((((((((.((({((((((....))))))}.....{(({..,......)))}(((((((((((((((({({,.....}}{(((........)}}}..,(((((({((((.......{(((.((((.((((((({...(((((((((,,{{{{{(((((((((,.(((({.((((((.((,.(((((.((.((..(((((({....}))))))..)}..}}.}}}}},,......(((((((((.((((.(((............(((((....))))),(((((.(((((.,........,..)))))....,(((((((...)))))))...........)))))))).))))...))))),,)))((....)).)))))).....))))).,})))))))}..{{{{{||.,||,)))|}))))))}.))))))))..)))).})}}.......)))}.})))))),}}}|{((((((((((((((....,.((((.....)))).,,||{{{(,,.{{(,|{{{{||||,.,|...,{(,{,...,,(((((...(((.((.((....)))).))))))))....,,,,,,{{{{{{{|..((((.((({..(((..(((((.((.{(..{.{({,(|((((((........)))))).)).))).)..}}.)).)))))..))).)))))))).............,(..((((((((({{{(({(..((((({{{((...,....(((,...))))....)))))))))..))})).}},.}))))))))..)|(((((......)))))).,}.)})))))}.....,,{|((((((((((.((((((..(((((..........,....(((((.,,,,,,.....,)))))........{|||,,.....)}))......).))))).)))))))))}.,.((((.(((((((.........{{{((((((.((.....)).)))....)))))),..........((((((....(((.,......}.)))....)))))).))))))))))),....(((((........))))).,,(({{(((....((((,........,.....))))....})))))}..)))))).,..}.,,,,|||||......{((((((((.,.,,,,{..((((((,{{{(((((.......,..)))))),,(((({.{{{.((((....)))),||}((((((.{.(((((,....,,|.....((((((((.....(((((.,.....,.))))))))))))).(((,.((((((...)))},)),.)))..,,,...,((((...((((((((.((........)).)).{{,,(((({((,((((..(((.((((.......))))..)))..)))).))).))))..,}.,,....))))))))))).)))))).)))))),,,...})))))))))))..))}.,,))))))))))))))))).})))))))),|,....))))))...)))))))))))))))))))))).......((((((....))))))...},.........))).)))))},))))||{,{({{..,,......,....))})})),(((((((((..((............)).))))))))).........((((((((..((((((((((......))))....))))))..)))..)))))}}}}}..})),.}}.,})),}).))))).}|{{{{{({,.,(({,,.,},|,|.,|||||,,......}}},,}),}}}{{((((.((..((((..((((((((.......(((((({.((..((((..{{....,.(((({{{{||{{{{,..,{|..,,,,},.})),..|||{{,,,,{{...(((((..((((...)))).....))))).}}...)))),...((((((..{((((((((((({....{(((.((((.(((...{{.{||||,{({{{.....{{|||||,,{..((((......)))).,,.}}}))))..))))))),))))))))).))))))}))))))....|))},}).,)).,,.)).))))))).,...))))))))....))))..))))))},{{..((({.......,,((.((({(,{{(,...,.))))))))})........,))))..,)).,,..,....,)))
Forensic Context

No forensic context available.