Basic Information
Symbol
hsa_SETDB1_0000200
RNA Class
circRNA
Alias
hsa_circ_0014051
hsa_circSETDB1_002
hsa-SETDB1_0003
Host gene
SETDB1
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
1:150900180-150912450
UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
1:150927704-150939974
UCSC (hg38)
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-126.6 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-135.88 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
130.68
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((((......))))))(.(((((((((((((((........((.(((....))).)).((.(((((....))))).)).((((((..(((....(.(((((((((((((((.((((....)))).)).))))..)))).))))).)....)))...........((((((......))))))...))))))...((((((.(.(((.(((((.((.((((.....))))..)).))))).)))..).)))))).....))))))))))))).)).((((.......))))((((((...(((.((((.((((.(((...........((((.((((((((...(((((((((.((((((..((.((.((........))))...))....)))))).....)))))))))))))).))).))))..))).)))).)))).))).....)))))).)
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((((......))))))(.,,{{(((({{,(((((.(((({{((((,(,.,,|||....{(.(((((....))))).|}.{{(({(..({{....{.(((({{{{{{{((((.((((....)))).))}})))..,|||,||}}}.}....))}.....,.,,..((((((......)))))}...}))))).}}((((((.(.(((.(((((.{(.((((.....))))..}}.))))).)))..).)))))).,,.}),)))))))))),}))}|||,.,,,||,|||{((({({..,({{.|{{{.{(((.{{{,|,,....}}.{(((.((((((((...(((((((({.((((((.,((.{{.(({......,))})...)),}..)))))).....}))))))))))))).))).)))}.,)}}.||||.}}}},))).....}))))),)
Forensic Context
No forensic context available.