Basic Information
Symbol
hsa_SETDB1_0000300
RNA Class
circRNA
Alias
hsa_circ_0003439
hsa_circSETDB1_003
hsa-SETDB1_0001
Host gene
SETDB1
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
1:150900180-150913904
UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
1:150927704-150941428
UCSC (hg38)
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-156.6 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-168.65 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
129.82
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((((......))))))(...(((((((..(((((.((((((((((.((.(((......((.(((((....))))).)).((((((..(((....(.(((((((((((((((.((((....)))).)).))))..)))).))))).)....)))...........((((((......))))))...))))))...((((((.(.(((.(((((.((.((((.....))))..)).))))).)))..).))))))))).)).)))))))))).)))))((.....))((((.((((((...(((.((((.((((.(((...........((((.((((((((...(((((((((.((((((..((.((.((........))))...))....)))))).....)))))))))))))).))).))))..))).)))).)))).))).....)))))).))))((((....))))((((((((......(.((((.....(((..(....)..)))....)))).)......))).))))).)))))))..........)
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((((......))))))(,,.,{{{||{,.(((((.((((((((((.((.({{{,....{{.(((((....))))).|}.{(((((..({{....{.(((({{({{((((((.((((....)))).))}})))..,}}}.}}}}).}....))).......,...((((((......)))))}...)))))).}}((((((.(.(((.(((((.{(.((((.....))))..}}.))))).)))..).)))))).}}.)).)))))))))).))))),}..{((((,{(((((((({..,(({..,,,.,|}).,}},}))))))))}}{((,{({(((((...(((((((({.((((((.,((.{{.(({......,))})...}),)..)))))).....}))))))))))))).))).))}(((.((((((((.{..{({.....{{{....(((((((((((,({.{(((((.(((....))).))))},........,...,})))))))).)))}}}.....,.,),,).)))))))).)))........)
Forensic Context
No forensic context available.