Basic Information

Symbol
hsa_SETDB1_0002800
RNA Class
circRNA
Alias
hsa_circ_0014056 hsa_circSETDB1_011 hsa-SETDB1_0012
Host gene
SETDB1
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
1:150915039-150919488 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
1:150942563-150947012 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-216.1 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -228.7 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 227.58
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((((.((((..(((((.(((........((((..(((((..(((((((((.....(((.........)))............((((((((((..((((...))))..))))..((((....))))(((..(.........)..)))....((((....)))).....)))))))))))))))..))))).))))........(((((((..(((((.(((.......))).)))))..))))))).((((...((...(((....)))..)).))))(((..((((......))))..)))..))).)))))........))))))))))((((((......)))))...((((((((((((.(((...((((.((..(.(((.......))).).)))))).....))).))))))).)))))..((((((((((.(.(((....))).)))))).)))))..(((((.((((.((((.....)))).(((((....))))).((((((...))).))).).))).)))))((((.((((.((((.((((((((((((.(((((((......))))...))).))))))(((((.....((((........)))).....(((((((......)))))))(((((...)))))....)))))....(((.(((.((.....))..)))))).)))))).))))...))))..)))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(,.((((({(({,{.((({(((,.......((({..((({(,,({{{{{{||||.|,|||...{{((..,,..,.,...........,,(((((..((((...))))..))))}}|||}}}}.})})|||}}|}........}..|||....{{{{,,..,..,,,.....,))}}}))))))}..}))}}.))}),}..,...(((((((..(((((.(((.......))).)))))..))))))).|||,.......,(((((((..(((.{((((((...((.((((((.,.(((..((...(({..{(((({{...,,||..,,)}}},,.,,,...,}))))).)))))..))).,,.)))))))).))))))}.)))..)))))))}((,{,(((((......{||{{((((||.{{|,,..((((((((((.(.(((....))).)))))).))))).{|{{|{.{{{{,,{{(,,...||}}.{{,,|,...}))))}|{||{,..,},}.})).}|))).))))),|||}||{,.{|||}|||||,{{{{||,||{{|||......}}||,,|}}}.}}))))||{{{.....,(((,.,,..,.}))).,}..(((((((......)))))))(((((...)))))....,,|||{..{({({({(.,{.....})..)),})),}}))))}))},...)|||....)))
Forensic Context

No forensic context available.