Basic Information

Symbol
hsa_SETDB1_0004600
RNA Class
circRNA
Alias
hsa_circ_0014061 hsa_circSETDB1_018 hsa-SETDB1_0017
Host gene
SETDB1
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
1:150919362-150923957 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
1:150946886-150951481 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-393.8 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -410.21 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 328.69
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(..((((...((.(((((((((........(((((((......)))))))(((((...)))))...........(((.(((.((..((((.....(..((((..((((.(((....)))......((((((((...((.(((.((((.(((...((((((((...(((...)))....))))))))...))).........(((((.((.(((.(((((((((.(((((((((.......((((((((((((.................))))))))...((((((.((.(((....))).)).)))))))))))))))).((........))..(((.....)))..))).))))))))).)))...(((((.((..((((.(((((....))).))..))))....)).)))))..((((......))))..................)).))))).)))).)))))))))))))...........(((((((((((((...(((........)))..)))))))).)))))......))))..))))..)...))))..)).))).)))..))))))))).)).)))).((((......))))(((((..((((((.....(((.(((.(.(((((....((((......))))))))).))))))).......))))))..)))))((((.(((((((((..........)))....)))))).))))..........(((((((((.(((((((((((((((((((.(.((((((...((((((..((...........))..)))..)))...)))))).)..)))))..(((((.((((((......))))))))))).........((((((((........(((.....)))......))))))))..(((..(((((((.......(((((((((...)))))))))......(((((...)))))..........))))))).))).((((....(((((......)))))..)))).........(((.(((((((...((..(((((((((.(((((((........))).)))).))).......))))))..)))))))))...)))...))))))................((((...))))....)))))))).))).)))))).)((...))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((,(,.,{(({(({((((((......{{((((,{{...{{{||||||,(((((...)))))......{{{{{(,,.((((,({(,((({....({.{(({.{((({.((({,..,,,......((((((((...((.(((.((((.(((,.,((((((((...{{(,..}}}...,)))))))}..,))),....|||.((((,....|||,(((((((((.(((((((((.,,....,,,,((((((((.................))))))))...((((((.((.{((....))}.)).)))))))),,)))))).((,.....,.))..(((.....)))..))).))))))))).})),..||||{,{{,.{(({.(((((....}}).)}..})))..,,)),))))...{{((,.....)))).......,.........,})|}.,...)))).)))))))))))))...........(((((((((((((...(((........)))..)))))))).))))),,{,.,||||.,}}},..,|,}}}),,,))}|||,}}}.}})),,,,,,.,,.))))},.}|}}...}))))||,||}}.|||||}}....}}}||},||{((((..,,((((......}}}||||||{|,,,|{{,,.....))}},,}}))))){(((.(((((({{{,{,.,.....})}..,.)))))).)))},....,,,,,(({{{,|||,||||{{{||||,,|{{{{{.{,{{(((({,,({{(((,.((.....,,,...)),.)}}.,}},,}}},}}}),),.)))))..{((((.((((((......))))))))))}.)))}))))|,{,||||}}}}}}}}}}}}}}}})},.}}}}.|||,||||..(((..(((((((.......(((((((((...)))))))))......(((((...)))))......,...))))))).}}).((((....(((((......)))))..)))).,...,{{{{{,.(((((((...((..(((((((((.(((((((........))).)))).))).......))))))..))))))))),{{{{.,,,||,{((({...............})))}.)).),,,,|||}|||}.}}},)),))).)|}}.}))
Forensic Context

No forensic context available.