Basic Information

Symbol
hsa_SETDB1_0005200
RNA Class
circRNA
Alias
hsa_circ_0014064 hsa_circSETDB1_021 hsa-SETDB1_0011
Host gene
SETDB1
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
1:150921598-150923957 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
1:150949122-150951481 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-352.1 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -367.24 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 229.57
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((((...((.(((.((((.(((...((((((((...(((...)))....))))))))...))).........(((((.((.(((.(((((((((.(((((((((.......((((((((((((.................))))))))...((((((.((.(((....))).)).)))))))))))))))).((........))..(((.....)))..))).))))))))).)))...(((((.((..((((.(((((....))).))..))))....)).)))))..((((......))))..................)).))))).)))).)))))))))))(((..........(((((((((((((...(((........)))..)))))))).)))))(((((((((((((..(((..(((((...((((((....))))))....(((((((((((((((.......).)))........)))))..))))))...))))))))..)))))........))))))))..(((((..............)))))((((.(((((((((..........)))....)))))).))))..........(((((((((.(((((((((((((((((((.(.((((((...((((((..((...........))..)))..)))...)))))).)..)))))..(((((.((((((......))))))))))).........((((((((........(((.....)))......))))))))..(((..(((((((.......(((((((((...)))))))))......(((((...)))))..........))))))).))).((((....(((((......)))))..)))).........(((.(((((((...((..(((((((((.(((((((........))).)))).))).......))))))..)))))))))...)))...))))))................((((...))))....)))))))).))).))))))......)))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((((...((.(((.((((.(((..,((((((((...{{(,..}}}...,)))))))}...))).....|||.((((,....|||,(((((((((.(((((((((.,,....,,,,((((((((.................))))))))...((((((.((.{((....))}.)).)))))))),,)))))).((,.....,.))..(((.....)))..))).))))))))).}||,..{{||{{({,,{{{{.(((((....}}).)}..})))..,,)),))))...((((,.....)))).......|.....,....))}),,,,.)))).)))))))))))(((..........(((((((((((((...(((........)))..)))))))).)))))(((((((((((((..(((..(((((...{(((((....}))))}....(((((((((((,,({,......,.,,},....,},)))))..))))))...))))))))..)))))........))))))))..(((({.......,......})})}((((.((((((,{{.,,.,.....})}..,.)))))).))}),,........(((((((((.(((((((({{{{,{((({{.(.((((((,..((((((,.((,,,........||,,|}|.,|},,|||,}}}),),.}}}}}..{((((.((((((......))))))))))),,,,.|,,,((((((((........{,,.....}))......))))))))..(({,.{{{|||{.....,,(((((((((...))))))))}......(((((...)))))......,...))}}}}}.}}).((((....(((((......)))))..)))).,...,|||{{,.(((((((...((..(((((((((.(((((((........))).)))).))).......})))))..))))))))),,,||.,,,}|}|||{,..............,|||},.))})..,.)))))))).))).))))))......)))
Forensic Context

No forensic context available.