Basic Information

Symbol
hsa_chr19_0396100
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-KLK3_0027
Host gene
KLK3
Type of circRNA
Intergenic-Intergenic
Location (GRCh37)
19:51362958-51363723 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
19:50859702-50860467 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-267.90 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -283.08 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 200.59
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Forensic Context

No forensic context available.