Basic Information

Symbol
hsa_LIN54_0005600
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0070260 hsa_circLIN54_003 hsa-LIN54_0002
Host gene
LIN54
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
4:83891480-83906029 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
4:82970327-82984876 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-216.40 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -236.90 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 248.18
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.((((((..((((((((((((((((.......((((.((((((((.(((...((((((((((((((..((((((.......((..(((((((.(((.....(.(((((((((((((......))))))).....)))))).)..((((..((((((......(((........((((.((..........)).)))).......)))......)))))).))))....((((((.((..(((..........((((((((....((((..((((.......(((((...(((............)))....))))).....))))..))))..)))))))))))...))..))))))........(((((((((((((((((....))))))........)))))))........))))..........))).))))).))..))...((((....))))..))))))))))).)).)))))))....)))...))))))))))))......)).)))...))).)))))))).....))))))(((((..((...((((.((((..(......)..))))..))))....))))))).((((...(((((((((...((((..((((((((((((..(((((........)))))))).............((.(((..((((((((...(((......)))...)))...)))))..))).))..((.......)).......(((((((((((((..(.(((((..((((((..............))))))))))).)..)).((((.......))))(((((((((.(((((..(((.(((((((................)))))))........)))....))))).)))...)))))))))))))))))...................))))))))).....)))).....)))))))))...)).)).......
Thermodynamic Ensemble Prediction
.((((((..(((((((((((((({{.......((((.((((((((.(((...((((({((((((({,,(((({(,,,....{(,.(((((({.,....,,.||(((((((((((((......}}))}))}}|}|}}}}}},,..,|||..|||||{,,|.|{(((.{({{.{(((,...}}}}.}}}).,}}|},,},.,,},}}}}...,,,}}}))}.})},.....,.,{(|{{..,,,....},}},.((((((((....((((..((((.......(((((.{.(((............)))....))))).....))))..))))..)))))))),.,{{{|...||||||........{{{{{{{{{{{((((({....}))))),,,,,,..}))))),.......,))))...........,..|||||,|}..|},,,(((,....}}}}..))))))})}}),))))))))))....)))...))))))))))))......}}.)))...))).)))))))).....)))))){{,{,..{({({((((,.{{{........,},.,.{{{,|||,,,,.,,.,,||,((,.{{{{{(((((((...({({..{(((((({((((..{((((........))))})))}............{(.(((..((((((((...(((......)))...}}},..}))))..))).}}..}|}}}....)}}..,,}}|((((((((({,,..,.(((((..((((((..............))))))))))).}.,|}.,{{,.......))},(((((((((.(((((..{{{.{((({((,....{{,,,..,...))}})}},......,}}}....))))).)))...))))))))))))))))},,,,,,...,,,.......,))}}}},,.....,)))..,},))}}}}}))...,,.})......,
Forensic Context

No forensic context available.