Basic Information

Symbol
hsa_LIN54_0006000
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0070261 hsa_circLIN54_002 hsa-LIN54_0004
Host gene
LIN54
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
4:83900036-83906029 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
4:82978883-82984876 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-189.80 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -206.51 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 212.67
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.((((((..((((((((((((((((.......((((.((((((((.(((...((((((((((((((..((((((.......((..(((((((.(((.....(.(((((((((((((......))))))).....)))))).)..((((..((((((......(((........((((.((..........)).)))).......)))......)))))).))))....((((((.((..(((..........((((((((....((((..((((.......(((((...(((............)))....))))).....))))..))))..)))))))))))...))..))))))........(((((((((((((((((....))))))........)))))))........))))..........))).))))).))..))...((((....))))..))))))))))).)).)))))))....)))...))))))))))))......)).)))...))).)))))))).....))))))((.....))...((((..(.......)..)))).......((.(((((.((((((((..(((..(((((((.(((.......))).))((((..(((((........)))))))))............((.(((..((((((((...(((......)))...)))...)))))..))).))..)))))....)))..))))))))...))))).))..(((((..((((((..............)))))))))))...((..((((.......))))..))....((....))..
Thermodynamic Ensemble Prediction
.((((((..(((((((((((((({{.......((((.((((((((.(((...((((({((((((({,,(((({(,,,....{(,.(((((({......,,.||(((((((((((((......}}))}))}}|||}}}}}},,..,|||..|||||{,,|.|{(((.{({{.{(((,...}}}}.}}}).,}}|},,},.,,},}}}}...,,,}}}))}.})},.....,.,{(|{{..,,,....},}},.((((((((....((((..((((.......(((((.{.(((............)))....))))).....))))..))))..)))))))),.,{{{|...||||||........{{{{{{{{{{{((((({....}))))),,,,,,..}))))),.......,))))...........,..|||||,|}..|},,,(((,....}}}}..))))))})}}),))))))))))....)))...))))))))))))......}}.)))...))).)))))))).....)))))){(.....||...((({..(,........,)))}.......((.(((((.((((((((..(((..(((((,,..,{.,,,..{({{({,{{((..{((((........))))}))))....,,,,....((.(((..((((((((...(((......)))...})),..}))))..))).))..)))))....)))..))))))))...})}}}.}}..,(({{..{(((((..............)))))|||||}||.((..,{{{..,....)))),.}}.}}.}}.})))).,
Forensic Context

No forensic context available.