Basic Information

Symbol
hsa_THAP9_0001700
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-LIN54_0050
Host gene
Lin54
Type of circRNA
Exon-Intergenic
Location (GRCh37)
4:83840649-83841173 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
4:82919496-82920020 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-99.50 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -110.58 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 153.00
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((..(((.((((...))))(((((((((((.(((.((....))))).))))))...)))))((((((((((((.....))))))))).....))).......(((...(((((((......)))))))...))))))..))((((.....(((((((..((((.....))))..((..(((((((((((((.....(((..(((((....))).))..)))....))))))).))...((((.(((((((((((((..((..(......)..))..))))..)))))..)))).)))).))))..))..(((((.((((((((((((((.((....(((((....))))).....((((.....((((.....)))).....))))(((((((....((((.........)))))))))))...)).)))))........((((((((((...(((........)))...))))))))))..))))))))).)))))((((.....)))).)))))))...))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
({{((({,(({{((.,{{(,{{({(((((({((({(.{,{{,,,)),)})})),},)),,||||{((((((({.....))))))))},.|..,,}|,...,}|||.||||||...,,,|{{{{,.||||,,||{{..(((((((((.,,((((..((((((({.....||||.{({..,,,{{((((((({.....(((..(((((....))).))..))}....})))))).}}...((((.(((((((((((((..((..,......}..))..))))..))))}.,)))).)))).))}}..}||,{{{{.,..{{,((((((.........))))))}}....,.)}},}))))))..))))..,,.))))))))),}},}}|,|||{{....,{,,....,,,,,||||,}}}}},..(((.{({..,.(((((.{(((((((((...{{{........})}...)))))))))).))))),,,))).))).((((.....)))),))),))))},},))
Forensic Context

No forensic context available.