Basic Information
Symbol
hsa_LMTK2_0004900
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-LMTK2_0055
Host gene
LMTK2
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
7:97820926-97822526
UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
7:98191614-98193214
UCSC (hg38)
External Database
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-498.10 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-526.20 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
290.89
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((............((((((((..(((..................(((((..(((.(((.....(((((((.....(((((((((....)))).)))))..((((((.....)))))).)))))))....))))))..)))))...)))..))))))))............))))(((..(((..(((((((.(((....(((.((((((((((((((..((...(((((((((((((((((((((.(.....(((.(((((((........(((((((.((((..((....(((((((.(((((((((((((((...((((((....))))).)....))))))).....((..((((((((.(((((....((..((((((((....))))))))..))....))))).)).))))))....)).(((((..(.(((.....))).)))))).((((.((........))...))))....((((((.((((.............))))..))))))...)))))))).))........)))))....))..)))))).)))))....((....((((...))))....))...)))))))..))).....).))))))((((....))))(((.(((.((....)).))).))).)))))))))))))))...))(((.((.((((..................)))).)))))((((..(((((((((..((((....))))...(((((.(((..((((.(((.((((((....)))))).)))))))...))).))))).(((((..(((........((.((((((((.((.((((((........)))))).))..))))))))..)))))..)))))..........)))))))..((.(((((.(((((..((...(((((.((((((((((((.((((.....))))..(((((.......)))))..(((((((...((((....)))).....))))))).........((((((...))))))...........))))))))))))(((((((((.((......)).)))((((.((...........))))))....(((((((((..((.......(((.((.(((...))).)))))))..))))))))))))))))))))..))..))))).))))).))...))...))))..((((...(((.((.(((...((((...((((((.((......)).))))))...))))...))).)))))....))))(((((.....))))).((((......)))).........((((((....))).)))...(((((......)))))..)))))))).((((......))))...(((((.((.(((.....))).)).)))))...((((((..((((((.(((...(((((((.......)))))))....)))....))))))))))))....)))))).)).).....))))))))))..)))..((((((.((((((((((((.....)).)))((((((.............))))))))))))))))))).)))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((...,,,,,..,,((((((((..{({,..},}....,,,,,...(((((..(((.(((..,..(((((((.....(((((((((....)))).)))))..((((((.....)))))).)))))))....))))))..)))))...,,,..}}}}}}}|.,,..,,.....))))(((.,(((..(((((((.(((....{((.((((((((((((((..{,...(((((((((((((((((((((.(.....(((.(((((((.{,,{.,,(((({,(,{(((,.((,..,(((({((.((((((({(((((((...((((((....))))).)....))))))).....({..((((((((.(((((.,..((..((((((((....))))))))..)).,}.))))).)).))))))....}).(((((..{.(((.....))).}))))).||{{,|{..,,,...},.},)))}....{(((({,((((.............})))..})))))...}))))))).))..,,}}}.))))}....)),.))))}),)))))....((....((((...))))....))...)))))))..))).....).))))))((((....)))){((.(((.((....)).))).)),.)))))))))))))))..,},({{.{{.{{{(.,,{,,....,|||....||||.|||,},{{{..{{(((((((..((((....))))...,{{((.(({..((((.{((.((((((....)))))),))}))))...,},.)))),.(((((..(((........((.((((((((.(({{{{{({........)))))))),..))))))))..)))))..)))))..........)))))))..{{.{{{{{.|{{||,,{{,,,,,,,,.((((((((((((.{{((,....}}}}...}}},,.}......(((((((((((..{{{...,}).)))))))))))),{{,.........{{(({,...))))},...........))))))))))))(((((((((.(,......}}.}}}|,{{.,{,,,||..,,..},}}))}}},(((((((((..((.......{((.,,.{{{...,}),}}})}))..)))))))))})))))..,,,.,}}..))))),))))),}}|,.}}...}}))..((((...(((.((.(((...((((...((((((.((......)).))))))...))))...))).)))))....))))(((((.....))))).((((......)))).........((((((....))).)))...(((((......)))))..)))))))).((((......))))...(((((.((.(((.....))).)).)))))...((((((..((((((.(((,..(((((((.......)))))))..}.)))....))))))))))))....)))))).)).}.....))))))))))..))),.((((((,{((((((({,{(.....)}.})){(((((..{.,,....}}.))))))))))))))))))).)))
Forensic Context
No forensic context available.