Basic Information

Symbol
hsa_LMTK2_0005000
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-LMTK2_0051
Host gene
LMTK2
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
7:97820926-97822697 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
7:98191614-98193385 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-545.60 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -576.80 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 456.27
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((....(((((.(((((((((.(((((..................(((((..(((.(((.....(((((((.....(((((((((....)))).)))))..((((((.....)))))).)))))))....))))))..))))).......)))))((((.((..........((((((........(((.(((((.....(((.......)))..))))).))).(((((((((((((((((((((.(.....(((.(((((((........(((((((.((((..((....(((((((.(((((((((((((((...((((((....))))).)....))))))).....((..((((((((.(((((....((..((((((((....))))))))..))....))))).)).))))))....)).(((((..(.(((.....))).)))))).((((.((........))...))))....((((((.((((.............))))..))))))...)))))))).))........)))))....))..)))))).)))))....((....((((...))))....))...)))))))..))).....).))))))((((....))))(((.(((.((....)).))).))).)))))))))))))))..))))))..........)).))))..(((((..((((.(((..........(((((((..((((....))))...(((((.(((..((((.(((.((((((....)))))).)))))))...))).))))).(((((..(((........((.((((((((.((.((((((........)))))).))..))))))))..)))))..)))))..........)))))))...........))))))))))))......((((((((((((.((((.....))))..(((((.......)))))..(((((((...((((....)))).....))))))).........((((((...))))))...........)))))))))))).....((((.((......)).))))..))))))))))))))))))(((((..(((((((((..((.......(((.((.(((...))).)))))))..))))))))).............((((((((((((((((((((............((((...(((.((.(((...((((...((((((.((......)).))))))...))))...))).)))))....))))(((((.....))))).((((......)))).........((((((....))).)))...(((((......))))).............((.((((((......(((((.((.(((.....))).)).)))))...((((((..((((((.(((...(((((((.......)))))))....)))....))))))))))))....((((....))))(((((.((....)).))))).((((((.((((((((((((.....)).)))((((((.............)))))))))))))))))))....((((.((((((.(((....................))).)))))).))))...(((((((.((....................)))))))))(((.((.......)))))...)))))).))))))).))))..)))))))))))(((((.........)))))..)))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((....(((((.((((((((((((({{,..,.,....{.{{{{{.(((((..(((.(((..,..(((((((.....(((((((((....)))).)))))..((((((.....)))))).)))))))....))))))..)))))........{{((((((.,..}}}......|||||,..,,,,,.{{(,(((({.,...(((,{{..{,|||{{|}|||.|},,(((((({{{{|||{,||||{{,|},..}|||,|{||{||}|.||.,||||{,,|,||||}}((({{(({{(,,,.,{{{{{{,(((((((...((((((....))))).)....))))))).....,,.,((((((((.(((((.,..((..((((((((....))))))))..)).,,.))))).)).)))))).,,}))}||(((..,.{{{,,,..)))})))))){((((,,{{{{{{..,||,||}},|,,,.,{{{{|}|||{.},{,{,....{,||||{.},|||,...||||||||{||....|||.||||{,...||,.,|||||||}||}....((....((((...))))....))...}|||}||,.|||...},).)))}))|{{{.,,.))))}||.,{{.(({{,{||,,}|.,,..}}}))))))))))}}..}}}||}..|.,,,,..,}.}}}}.,||{,,..((((.{||.,...,....(({((({..{{{{,,..}}}}...,,,{{.{{{..((((.{((.((((((....)))))),))}))))...,,,.}}}}|.{{{{{..{{|........||.|{||||||.{{|||||,,.,,,,,,,)))}}}))}..}})))))),.,,}}}..})))).}},,.,}},))))))),..........,}}))}}}}},}....,.((((((((((((.{{((,....}|||...,,,,,.,,.....(((((((((((..{{{...,}).)))))))))))),{{{.........|{(({,...))))},...........)))))))))))).,,..{(((.({......}).)))),.))))))))))))))))))(((((..(((((((((..((.......{((.,,.{{{...,}),}}}))))..))))))))).............((((((((((((((((((((.{,....,....((((...(((.((.(((...((((...((((((.((......)).))))))...))))...))).)))))....))))(((((.....))))).((((......)))).........((((((....))).)))...(((((......))))).............((.((((((,,,...{((((.{(.{{|,.,,,|||,|}.||||,...||||{(..((((((.((({,.(((((((.......)))))))..}.}))....}}}}|||||}}}..,,|||{.,,||},{(((((.((....)).)))))}((((((,{(((((({{,{{.....}}.}}}{(((((..{.,,....}}.))))))))))))))))))).,..((((.((((((.(((....,...............))).)))))).))))..,|||||||.|{{{{{,{{,{,,.....})},},)))}))))|}}}|........,,.,...)))))).)))))))))}}),.}))))))))))(((((.........)))))..)))))
Forensic Context

No forensic context available.