Basic Information

Symbol
hsa_chr9_0074000
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-LPAR1_0054
Host gene
LPAR1
Type of circRNA
Intergenic-Intergenic
Location (GRCh37)
9:113737726-113738557 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
9:110975446-110976277 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-178.20 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -196.77 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 198.94
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((..((...((((((((.(((.(((...)))))))))))).))....(((.....)))..(((((..(((....)))..((((((((..((((.......))))..))))))))...((((((((((.......(((.......)))......)))))))))).............((((.(.........((((((.(((((((((((.((((((((.((....))......(((((.((((.((...)).)))))))))............................))))))))...)))))))..(((((((((...(((.((((........)))).)))...)).))))))).......................)))).)))))).........)))))..(((..(..(((((((....)))).)))..)..)))(((((.........)))))..((((((((.((...((((...(((...((((....((((....((((....(((((((((((.(((..(((.(((....((((........(((..........))).......)))).....))).)))...))).)))))))))...............))...))))..))))..))))))).....))))...)).)))))))).)))))......((((((((((((((((((..((((..........((((((((....))))).)))...(((((....)))))......))))..))))).)).))))))..)))))..))..))).((.(((..((((......))))..))).)).
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((..((..{({((((((.(({,(((...)))))))))))).,)....{{(((({{{(({{,(,((({(({(((...},.((((((((..((((.......))))..))))))))...((((((((((.,,....,((.......,,}......))))))))))......,,.....||||,}}....,{{{((,{((,(((((,(,,..,{{,,.,,|}}}}}...,......{((((.((((.{{...)}.)))))))))............,}}..}}}})}...}}))}...}}.}.)))))))}}}||||{{,{,{,{{{{({(.,,,,...,)))))))}},..{({(({.,,..))))}}.{{.{{{........))),}))}},}........,,}},.,,{{{..,..(((((({....}))).)))..,..))}{((((.........)))))..((((((((.((...((((...(((...((((..,.((({....((({....{|(((((((((.(((..(((.(((.,,..,,..,.....,{{,........,.}}},,....,},,,..,..})}.)))...))).)))))))))...............},...))))..})))..))))))).....)))).,.)).)))))))).})}}}......((((((((((((((((((..((((.,.....,,.((((((({....))))).}}}...{((({....})))}......))))..))))).)).)))))}.,)))))..})..))).{{.(((..((((......))))..))).}}.
Forensic Context

No forensic context available.