Basic Information
Symbol
hsa_LPAR1_0006000
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-LPAR1_0032
Host gene
LPAR1
Type of circRNA
Intron-Intron
Location (GRCh37)
9:113768145-113768891
UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
9:111005865-111006611
UCSC (hg38)
External Database
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-198.40 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-213.34 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
165.12
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
..(((((((((......))))))))).....(((......((((((((.((.(((.......((((((.(((((((((...........))))))).)).))))))(((((.(((...((....((((.........))))....))...))).)))))..(((((((((((.......(((((.((((((((((((.(((((................(((((..((.(((..((((..(((((((((..............(((((((....))))))))))))))))..)))).)))))..))))).(((((......)))))(((((((....))))))).(((((.............)))))))))).))))))).))))).)))))((((....))))(((((((((((.....(((((((.((.....)).)))))))....((((.(....).)))).....))))))).)))))))))).)))))....((((((((((.(((......((((.......((((((((........))))))))..........((((..(((((...(((((((.(((.........))).)))))))((((((........))))))..(((((.((((.(((((.(((((((......))))..))).))))).))))..))))).)))))..))))..))))))).))))))))))...))).))))))))))....)))...
Thermodynamic Ensemble Prediction
..(((((((((......)))))))))...,.(((.,....((((((((.((.(((..{,...,.,{{{,{.{{{,((({...}}},..{(((((((((((((|,,.(((((.(((...((....((((.........))))....))...))).))))).,,(((((.((((((..,,.(((((.((((((((((((.(((((........,,{{....(((({..((.(((..((((,.((((((({,.............,(((((((....)))))))))))))))),.)))).)))))..))))).,,,,|},,...}}}},((((((,....})))))}.(((((..,.......}..)))))))))).))))))).))))).))))),(({....}))|(((((((((((.....(((((((.((.....)).)))))))....,{{{.{....|,}}},.,,,.))))))).))))}..............(((.....)))...,,,.)))))).))))}..((((((((........)))))))).,)))))))))))))}.(((({({((({(((.{{{,........,},.}}}}|||((((((.,,|...,))})}}.,|||{||||(({((((,.,||}||||..,.,,)))))))))),.,.{|||{{{,{((|.(((((...))))).}))),))))))),},,})),))).))))))))))....)),,,}
Forensic Context
No forensic context available.