Basic Information

Symbol
hsa_LPAR1_0006300
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-LPAR1_0031
Host gene
LPAR1
Type of circRNA
Intron-Intron
Location (GRCh37)
9:113771428-113772620 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
9:111009148-111010340 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-205.40 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -230.95 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 335.14
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(...)(((..(((((((((((.(((....((((((.(((.((((((.((((((((.(((((..(((((..(........).)).)))...))))).))...))))))...........(((((..........))))).....)))))))))))))))......((((((((((((((((((..((((...((((((....))))))..)))).))))))))..........))))....))))))...(((((.((...((......))....)).)))))............((((((((((((((((((((((....)))))))))))))))))))))).(((((((..((((((..((((((.......((((.(((....))).))))..........((((((....)))))).(((((((((((.((((((((((((.((..(((((((.......)))).)))..))))))).....((((................))))..((((((.....)))))).(((((((.(((.(((((.......................(((((......)))))...(((((((((((..(((((((((((((......))))))))..)))))........((((...)))).......................((((((........))))))(((((((((....(((((.....))))).(((((((((((((..........((((..........))))................(((((((((.............(((((......))))).(((.......)))............)))))))))((((((((.....))).)))))((((((((((.....)))))))).)).....)))))))))))))(((((((..........)))))))...))))))))).........((((((((....(((.........)))...)))))))).......((((..(((.((((((.((....((((......))))..)).)))))).....)))..)))))))).))))))).......)))))...))).))))))).....))))))))))))))))))..(((...)))))))))..)))))).))))))).)))))))...)))))))....)))
Thermodynamic Ensemble Prediction
{...|(((..(((((((((((.(((....((((((.((,,((((((.,{{{(({(.(((((..(((((..(........}.))},))...)))))|)}|..|||||}.....,},,,.{((((..,.......))))).....)))))))))))))))...{.{{,{{{{{,,,((((((((..((({.,.((((((....}))))),.}))}.)))))))),,||,,.,|||{({,....,|{||,,.((({(,({...{|......))....}}.))))).....}}}},.,((((((((((((((((((((((....)))))))))))))))))))))}.{((((((..((((((..(((({{.....,,{(({.{((....))),))))..........((((((....)))))).(((((((((((.((((((((((({{((..(((((((.......))))},))..))))))).....((((................)))).{(((((({..((({...,}||,{{{|,|||}||{{{{{{{,(((((((({....{{{{,(((((......))))}..{(((,,(((((({,(((((((((((((......))))))),},)))))...,{{{{(({....|,||{{,.....,.,........||,.((((((........)))))).||,}}|||||,.(((((.....)))))..|||||,,{||{,...,.,,,,{(({,.{{{.,,,,,|||.......,,,........|||||||,...........,,{{|||,,...,},}}}.}},......................||||||.},((((((((.....)))}}}))),,|}}}}|.......,,||))}}|||.,,,.}))))))))))))}))}..)))}.......}}))))))))).)))},))}},......{(((((((....(((.........)))...)))))))}.......((((..(((.{{{(({.((...,((((......))))..)).)))}),.....)))..)))).,,.,|||,,|,.......},},,,}}),}.||,,,,,.},..)))))))))))))))))).,(((...}))))))))..)))))).))))))}.)))))))...)))))))....}))
Forensic Context

No forensic context available.