Basic Information

Symbol
hsa_LPHN3_0008200
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0126733 hsa_circLPHN3_006 hsa-ADGRL3_0078
Host gene
LPHN3
Type of circRNA
Intron-Exon-Intron
Location (GRCh37)
4:62246746-62248907 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
4:61381028-61383189 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-488.50 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -535.58 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 525.57
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
...((((((....(((((((...(((((...((((((((((((((((.((((........))))....(((((((((((((((.(((.((.((((.(((......(((.........)))..))))))).)))))(((((.((...(((.......))).)).)))))......((((((...((((((((((........)))).)))))))))))).))))))).....))))))))...))))))))))........(((((((((.(((........((((.((.(.((.((((((((.(((((((.....((((((((..(((((.((((((((.((((........))))((.((((((((...(((....((((((........(((((((((.((((((((((...((((..((((...(((((((..(((((.(((..............((((((((...((((((((((((((((((.(((..((((((((....))))))))..((((((..(((..(((..(((.(((((((((.....((((((.((..(((((..(((((.((((((....((((....))))(((((.....((((((((.((((((((.((((..(((((((....))).......)))).)))).))(((((.........)))))((((((((..............))))))))......(((((((.............((((.((((...(((.((((.((((..((((...)))).)))).)))))))..)))).))))..)))))))(((((((..(((((((...(((((((((((....))))))).)))))))).(((......)))..)))..)))))))......((((((.(((((((...........))))))))))))).)))))).))))))))..)))))((((((..............(((((((((.....))))))))))))))).)))))))))))..)))))..)).)))))).((((((((.......((((((........)))))).......))))))))..)))).)))))))).)))..)))..))))))((((((((....((((...))))((((((.((((((.((((.((((...(((((((((((..........))))))))))).....))))..................................((((.(((((((((((((....)))))))))))))))))......((((((.(((....(((((((((((....)))))))))))..)))...))))))..(((((((...)))).)))..)))).))))))))))))(((((((.((..(((((((((......)))))...)))).)).)))))))(((((........(((...(((((((...((((((...)))))).....))))))).....)))........)))))..)))))))).....................)))))))))))))..)))))))).))))))))..............))).))))))))))))...))))..))))...)))))...(((((((((........)))))))))((((((.((......)).))))))......)))))))))))))))))))).)))...)))))))).))....).))).)))).)))))..(((((..((((......))))..))).))((((((((......))))))))...........................(((((((((((((.......))))))...))))))).......))))).....)))....)))))))...........((..(((.((((((((((...)))))...))))).)))..)).)))))))((((((...))))))).))).)).))))........)))))))))))).)))))))))))((((((((.........(((....)))...........))))))))..((((((((...((((((((((((((((((............))))))))))))))))))......))))))))..)))))))..))))))..((((........)))).
Thermodynamic Ensemble Prediction
{{{((({{(,,..{{|||{{.,}||||(.,,((((((((((((((((.((((........))))....(((((((((((((((.,(({({.((({.{{{...,.,{|,.........}}|..|}}}})),})))|(((((.({...(((.......))).)}.))))),.....{{{(((,,.{(((((((((........)))).)))))))))))}.))))))),....})))))))...)))))))))))))}}...||||{((((,{,{,{,{,{{{{{{{{{({({{{{{{(({{{(,{({((({,{(((((..(((...(((({.((((((({.((((........))))((.((((((((...(((,((((...}}))},.{{.((((((((,,((((((((((...((((..((((...(((((({.,{{{{(,{{,........{((((((((({{.,,,...((((((((..(((({(((((((((((((((....}))))))).,..,,,(((((((((....((((((..((((((....,......{{((((((((((((((((.{.....{(((((....,,,.))}}}}..........,(({,..,(((.,{{...,{,{{{{...,))),..},,..},,,}|.{((((((((.{...,{,...,},|(((((((,,........},..)))))))}...(((((((({.,,,,,,.,{.,,.,,(({(((,,,,({(,({{{.{{||,.||{|,,,)))).)))).}))})))..}},,..}})}.))))))))).,.))))))))}..}.)))))))))))))))),}),.,}..)))))).))))))..))))).}))}..,,..,|,....,.||{|{{.{{{|{||,,.........}}}}}}}})))))}}|||{{......}}},.))))))}.}................{((((((((.....))))))))|((((((((.((..,(((((((((...,,.,{{{{{{.((((((((,....,,((((((.{......))))))..,,,,|))))}}|}..,..((((((.......,,..............)))))),,,...||||||}||||((((.((((((.((((.||{{...(((((((((((..........))))))))))).....,}}}|||.,,..........,,....,........,,.(((,{(((((((((((((....)))))))))))))))))......((((((.{{,....(((((((((((....)))))))))))..}}}...))))))..(({((({...}))).))),,)))).)))))))))}|((((((((.,,..(((((((((......)))))...)))).,,.))))))))))}}}},....}}}.{((((((((......)))))))))......)))))))))....)).)))))))),.))))..))))))))....,,.......,.{(((((((..........)))))))}.,,}))))))}.{{{{{....,|||},})}.)}}},)))))))...))))..))))...)))))...(((((((((........)))))))))((((((.((......)).))))))......)))))))))))))).,))...)))...)))))))).))....,.)))})))).})))).,.)))...)))))|.|||}|.,,{((({{{((((((((......))))))))...|||,.....,,,...........,(((((((((((((.....,,||||}}...}}}}}}}..........,....}|||||.||||,,.}}|}},......,{{{.{{{.((((((((((...)))))...))))).}}},,,},}}}},,|({{(({..,}}}}}}},}}}.}}})}}}|||}},,.}},}}})))})),}},))}))))),,||||,|}..}}}}.,}}},,}.,,.}}}}},..}}}}}}}}},,..((((((((..,((((((((((((((((((............))))))))))))))))))...,..))))))))..}})})}}|,||}}}}..{|||....,...}},,,
Forensic Context

No forensic context available.