Basic Information

Symbol
hsa_LPHN3_0016600
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0069860 hsa_circLPHN3_020
Host gene
LPHN3
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
4:62598472-62863983 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
4:61732754-61998265 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-789.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -841.24 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 735.12
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
............((((..((((......))))..))))........(((((..(((((((((((((........).)))))(((.((...)).))).(((((.(((.........))).))))).)))))))...)))))...((((.(((((.(.((...(((((....)))))..((((((((((....(((((.....(((((.(((((.....(((((((((((((...(((..((((((.(((((((...(((((((....)))))))..((((....((((........))))....)))).(((.((.((..(((((((((((.((((((((((.((.(((.(((((((....(((((((........)))))))....((((.((((((((((((..((........)).)))).))....))))))...))))........)))))))(((((.(....).)))))....((((...((....))....))))....))).))..))).)))))))...((((((((((((..(((((......((((.(.(((((((((((((......)))))))).)))))..).)))).)))))...))))....)).))))))((((((((...((((.((.......)).))))...))))))))..)))))))..)))).)))))))....(((.(((.(((.((((....((((((....((......((.((.((((((....((((...))))..)))))).)).))...))..))))))...)))).))).)))..)))))))))).))........))))..)))..))).)))))))))).....)))))............(.((((((((..((((((((((((....))))(((((((((((..........(((((.((((((((...........(((((((((((((.................(((((((((((((((..((.(((....))).))(((((........))))).((((((((...(((((((...((((((.((((.(((..........((((((((...))))))))))).))))))))))...((....)).)))))))......))))))))(((((.(((((((((((((((((.((((((((..((((((((........))))))))...(((((((..((((.((((((...)))))).)))).....(((((.(((((.(((((((.(((((((............(((((((..((((((.((.....((((((.....(((((....)))))........((((......))))...(((((...(((..(((.........)))..)))..)))))))))))...))))))))...))))))).....))))))).))).))))..))))))))))...(((((((....))))))).....)).))))).)))))))).))..)))..(((((((((((.(.(.(((((.......((((((((.....(((((((..((((..(((((((.(((....(((.(.((.(((....((..((((.((((.((((((((((((((((....(((((((.(((.(((((((((((((..........(.(((((((((((.((((...(((((((.......((...(((((.(((..(((......(((((.((((.....))))..)))))........((((...((....))...)))))))))))))))...)).....(((......(((...((((.((((..(((.(((((((((........))))...)))))))))))).)))))))....)))(((.((((..((((((.((((...))))))).))).)))).))).))))))).))))))))).(((((((((((((((((((.....(((....)))...)))))))..))))...))))))))...................((((((.((.((..........)))).))))))...(((((((...)))))))...)))))).)))))))))))))).))))))))((((((...))))))....((((((..(((.....))).)))))).........))...)))))))))).))).)))))))))))..))..)))...(((((...(((((.((......)))))))...)))))((((((.((....((((.(((.(((....((((((.((...(((...........)))....)).))))))....))).))).))))..))))))))..)).))))....)))))))))))))).))))))).......))))..)))).......))))).)).))).)))))))).)))))))).))))..)))))...)))))))))))))))..))))..)))))..))))))))))))))))).)))))...)))))))))))))))))))))).)((((....)))))))))..(((((((.(((((.....((((((....((((...((((((((((((...)))))))))).))...))))..))))))..)))))))))))))))))((((((..(((........))).))))))..........)))))))...)))...(((((..(((.((((((((....)))))))).))))))))...((((((..(((....)))..)))))))).).))))).))))(((((...)))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
........,,,,((((..((((......))))..)))).|,,,,..(((((..(((((({,{({{{.....,|,|,|||||{{{.,{,..,}.))),(((((,({,..,,.....,},.))))).)))))))...)))))...((((.(((((.{,((...(((((....))))}..|||{((((((....(((((.....(((((.(((((.....(((((((((((((...(((..((((((.(((((((..((((((((((,..,,,,|||||({,,,,,((,({{{{{...}|||.{{{|||,{.(((((.,...,.{(((,,,{(({{...,}}}...,})),.||,||||,.|.(((((((........)))))))....{(({.,,{||{||||||.}|}}}}.,},.,..))))})}||,,||||||,.,||||........,,|||..{((((,{,,,.},}}}||,.}||,.{,,...((((((((((((((..(((.(((..(((,,,.{......,.)})))..))).}))))))}.,)))))))))..,}})}}|{|{|{|{|.,(((.......|}}})}}),))}}|,..|,{{{{{(,,.{,.({..{..(((((((((...((((.((.......)).))))...)))))))))..)..)),},,}},...)))))},.,|||.|{{,|||,||||....({((((....{{,,,,,.{{|||,{{{{{,....{{{{,,.))))..}}}))),})},},}})}.}))}}}}...)})),})),))),,)).))))))).))........))))..)))..))),,))))))))).....))))).........,,{(.({{{(({..{(((({{({{(((...,))))(((((((((((..........(((((.((((((((...........((((((((({(((,{,...,,.......|,{((((((((((((({..((.(({....})).)}{((((........))))).((((((((...(((((((...((((((.((((.(((..........((((((((...))))))))))).))))))))))...{{....}).)))))))......))))))))(((((.(((((((((((({{,((.((((((((..{(((((((........))))))))...,((((((,,((((.((((((...)))))).))))..,,.((((,,(((((.((({(((.(((((((............(((((((..((((((.((..,.,((((((.....(((((....))))),...,,..((((......))))...{{((({..{{,..|||,..,,||.,})}..})),.))))))))))),..))))))))...))))))).....))))))).))).)))}..))))))))))...(((((((....))))))).,...)).))))}.)))))))).))..,}}..(((((((((((.(.(.(((((.......((((((((.....(((((((..((((..((((((,{(((....{{(,(,((,{{({{,,((..((({{((({,((((((((((((((((....,,(((((((((.(((((((((((((........,{{,{{{({{({(((.{{({...({({{{,.....,{({,{{(({{,,{{{,,{{{,,....(({{{.{(((.....))}}..))))),....,{{,{((({{(,,..,,.,,.|||||||||}|||,,..........|||..,}}}|{,...||||.,|,,..,,|}|||||.}||.,||,...,},},.,}))}}}}}}}},.)))},||,.,,}|}{{{.{(({,,{(((({{((({...|||}))}.))).})}),))),)})}})).}}}}}}}||,(((((((((((({((((((.....{{{....,}}...)))))))..))))..,)))))))}...,{{{{,..........||||||.|{.({..........}))).)))))},,,{((((((...)))))),.,.,,}}}),}))))))))))))).))))))))((((((...))))))....((((((..{{{.....})).)))))).........,,...}))))))))).))).)))))))))))..))...))},.{{{{{,,{((({{.||,,,,,.}}})))}.,,)))))((((({{((....((((.(((.(((....((((((.((...(((...........)))....)).))))))....))).))).))))..))))))))..}}.}}))....)))))))))))))).))))))).......))))..)))).......))))).)).)))},))))))).)))))))).))))..)))))...})))))))))))))),.)))},.)))))..))))))))))))))))).)))))...))))))))))))))))))))}}.,((((....)))))))))..(((((((((((((.....((((((....((((.,.((((((((((((...)))))))))).))...))))..))))))..))))))))))))))))|{((({{..{((........))}.))))))},.....,,.)))))))...}},...{{{{{..{{{.((((((({....}))))))).}}},,}},...((((((..(({....)))..))))))}}.,.))))).)))){((({...))))}
Forensic Context

No forensic context available.