Basic Information

Symbol
hsa_LPHN3_0022700
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0069862 hsa_circLPHN3_032 hsa-ADGRL3_0013
Host gene
LPHN3
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
4:62775278-62813994 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
4:61909560-61948276 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-231.70 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -251.50 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 350.39
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(.....(((((......(((((...((((.(((((....)))))....((..((((......))))..))((((((......(((((((((((((.....)))).)))..))))))..)))))))))).)))))))))))((((((.(((.(((.......(((((((((..((((((((.....(((((......)).)))(((((...)))))...((((..(((....)))..)))).........(((((((.((((...(((((((.....((.(((.(.((..((((.((((...(((.(((((.(....)))))).)))...)))))))).(((.((((((((((((((((((..((((..(((.((...(((.((((((.(........).)))))).)))..)).)))))))..)).)).))))))...(((((.((((.....))))..)))))......((((...)))))))))))).))))).).))).))......)))))))....)))).)))..))))...(((.(.((((..((.((((((...)))...(((((........))))).))).)).)))).).))).(((((((.(((.((((((((...........((((((((((((..((((.(((.(((((((((((((((((((.....(((....)))...)))))))..))))...))))))))...((((((..........))))))))).))))......................(((((((...))))))).).)))))))))))............)))))))).)))..))))))).....((((((..(((.....))).))))))..........)))))))))))))))))......))).)))..))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((...((,(({...((({(.,{..{{.{((...{(((((((((({,{{..((((......))))..}|{(((({.,,.,.{{({({(((((((,,...}}}}||}}..}}}}}}..|||.,|},||.}}})}}}}}}|{{{|,|,|||}||{|....,.,,{||||||,,{((({(({.,...{{|||......|||}}}((((|...))))),,.{({(..{{{....)))..))))},....,,.||||}})))))|..,)))}}....}}}}},,|..,.}}}..}}}.))...))))((..,,((..((({{((({,(((((((((((({{{(....,,(((((((((.(((((((((((((,,,.....,{(,,((((((,({{.{{{{.,.||||||,,,,..,|{|||||{|{.||,||,|||,,,,..(((({.{(((.....)))}..))))).....,{{|{{{{|{{|,,.,,.|,.|||||||||}|||,.......,...))|..,}))),|,..||||.,|,{,..,|||||||,|||,||{{...,},,,.,||||},,,,,,,,)))},}||.}},}}||{.{|{|.{((((({,((({,,,|||||}}.}}},}}}},}}|||||||}}.}|||}}|||,(((((((((((({((((((.....{{{....,}}...)))))))..))))..,)))))))}...,{{{{,..........||||||.|{.((..........}))).)))))}...{((((((...))))))}.,.}}})))}}))))))))))))).))))))))|((({{...)))))}....((((((..{{{.....})).))))))..........}...}))))))))).))}.}})))))))))..)),,))
Forensic Context

No forensic context available.