Basic Information

Symbol
hsa_LPHN3_0031100
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0126780 hsa_circLPHN3_058 hsa-ADGRL3_0097
Host gene
LPHN3
Type of circRNA
Intron-Exon-Intron
Location (GRCh37)
4:62897160-62912694 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
4:62031442-62046976 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-606.00 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -663.40 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 672.31
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((((((...(((.((....)).)))....))))).......))))(((((((....((((..(((............))).)))).....))))).(((.((((((.(((((.......(((((((((.((........)).)))).))))).......))))).)))..))).)))((((((...(((((((.(((((((((((((..(((((....((.(((.((((((....((.(((((.......))))).))..))))))))).)))))))(((((((((((...)))))............)))))).((((...(((....))).))))..((((.((.........))))))................((((((((.((((((((((((((.....................)))))))))))))).((((((............(((.......))))))))).....(((((.(((............)))..))))).........)))))))))))))))))))))(((((.((((((((.((.....(((((((.(((....(((((((((..(((((....)))))................(((((((((((.....((((.(((.(((.....)))..))).).)))(((((((((....)))))).....)))....(((((((((......)))))..))))..((((..((((.(((((((.(((((.....(((...(((((...((((..(((((...((((........)))).)))))...)))).)))))...)))...........(((((.........))))).))))))))))))..))))..))))......)))))))))))..)))))))))....))).)))))))......)))))))))).).))))..(((((((.((((...(((((...(((((((((((((((.((.(((((.......((((.(((..((((((((((((...(((.(((..(((((((((................((((((.....((((((((((.......(((((.(((((....((((.(((((.(((((.((.((((.......)))).)).)))).............).)))))))))....)))))...)))))......((((((.....((.((((...((((((...)))))).(((((..((((((.((((((((((..((...))..))))))....((((((((((.((((..(((((((....(((((((((.((((((((.(((.......((.(((.................)))))..))).)))))))).)))))))))..(((...(((.((.....)).)))...)))(((((............)))))...(((((......))))).(((((((((..((((((((((((.((((((((......))))))))..)...)).)))))))))....((......)).)))))))))...)))))))..)))).))))))).))).....(((((((...............)))))))((((((.((((((((....((((.((((((((((..(.....((((((.......))))))..(((((..((((((((....))))....))))..))))).)..)))))))))).)))).....)))))))).))))))........(((((......(((((....((((((...(((((((.((((...(((.((((.(......).)))).))).))))....)))))))...))))))...)))))......))))).)))).))))))....))))).....)))).))......))))))(((((((((((.................)))).)))))))...............))))))))))..(((((.......))))).....))))))(((((((((.((((((((...........))))))))..(((((............)))))....((((((.((((..(((((.........(((((((.....((((((((........)))))))))))))))..))))))))).))))))))))))))).....(((.(((((.......))))).))))))))))))....))).)))...)))))))))))).))).))))........(((((((((..((((.(((......(((....(((...((((((..(((.(((((((((((((((((.(((((.((((..(((((..........)))))...)))).))))))))))..............)))))))..))))).)))..)))))).)))..)))....))).)))))))))))))(((((((..((......((((((((......))))))))..))..)))))))......(((((((......)))))))))))).))(((((.(((((..........((((..........)))).(((((..((((((((..........)))))))))))))...))))).)))))...((((((.((((((...........((((((...))))))...(((((((..............))))))).))))))...))))))))))))))))))..........((((((...))))))......)))...)))))))))......)))))))..................))))))).....))))))..))
Thermodynamic Ensemble Prediction
({(((((((,,.((({{(,...||.,,,....)}}}},.,||..,}})|||{|||,...||||||||,......||||..|||{||||..,{{},|||{{(({(({(((.(((((.......(((((((((.((........)}.)))).))))).......))))).)))..)}..)))|,||||}..|||{{{(.(((((((((((((.{(((((....({.(((.((((((....((.(((((.......))))).))..))))))))).}))))))}||||,(((((...)))))....,.,,,..{|||||,.,,{{|,|{|||,..,||.||,.,.((({{((.........))))))....,,.,|,......{(((({{{.{((((((((((((({{{,...........}}},..)))))))))))|||{((,,,,.}}}}},....{(((.......))))}}}})}}}.,{(({{,||||,.,.....,},}}}..}}))}.....|,,.))))))))}))))))))))))||....{(((((((.{{.....(((((((.(((....(((((((((,,(((((....))))}..,,............{((((((((((,{{...,((((((,((,.......(((.(((....)))))),,||,.})))))}.....,)))....{((((((((......)))))..}))}..((((..((((.(((((({,(((((....,{{{......,{...||||..,.||,.{((((((((((((.|........}.}))))....)))))))),,......,,..(((((.........))))).))))))))))))..))))..))))......)))))))))))..}))))))))....))).)))))))......}})))))))}...||||,.(({{{{{.||||,,.((((,..,((,((((((((((({.((.(((((.......,(({.(((..((((((((((((...(((.(((..(((((((((..........(({{..,((((({....((((((((((.......(((((.(((((....((((.(((((.(((((.((.((((.......)))).)).))))|,,.......,,,,.))))}))))....)))))...)))))......{{{{{{,...,{{{{{{,...,{{{{{,,,|}}}}},(((((..((((((.((((((((((..{,...|}..))))))....{{{(((((((.((((..(((((((..,.(((((((((.((((((((.(((.......{.{(((.................))}),..))).)))))))).))))))))).{(((...(((.((.....)).)))...)))|((((............}}}},..,{((((......))))}.{{{(((({{..((((((((((((.((((((((......))))))))..,...)).}))))))))....,{.,...,)),}})))))))...)))))))..)))).))))))).,,,.....(((((((,.........,....))))))){(((((.((((((((....((((.((((((((((..{.....((((((.......))))))..(((((,,{{{,((((....)))),}}}))))..}}}},.)..)))))))))).)))).....)))))))).))))))........{((((......(((({....((((((...(((((((.,{,,,{,(({.{{(({,,.......)))},}}}.,}}.....)))))))...))))))...)))))....,.))))).)))).))))))....)))))},...}}}}.}}......}}}}}|((((((({(({.................)))),})))))),.....,,,},....)))))))))}..{((((.......}||}}..,,{||,|||{,,,{|{||}{,||||||,,,,.,,....}}}}}}},..,{|{{|,,,.....,.,}}}}}},},|{{{{{,||||,,,{{{{|||,,,,..(((((((.....((((((((........)))))))))))))))..,}}},,,)))))))},}})))))),}))).|,|.{{{{{.,,,...})))).,,,)))))))))....))).)))...)))))))))))).))).)))},.....,.,((((((({.,((((.(((......(((....(((...((((((..(((.(((((,,,((((({((({(,,,{,(((({(((((,....{{...{|||||....,,)})))),)),,,.}}}}}}}},,}}})),))))).))))).)))..)))))).))),.)))....))).))))))))))))}{{(((((..{{.,,,,,{{((((((....,,}}}}}))}..}},.}}}}))}....,||||||||.,,,,,)}})))}))))).))(((((.(((((..........((((..........)))).(((((..((((((((..........)))))))))))))...))))}.)))))...((((((.((((((...........((((((...))))))...(((((((..............))))))).))))))...))))))}))))))))))).,,,.,,,,.|{((({,,,,,,},,......,}}...)},}}}}}},.....))))|}|.........,||||....)))))})}},,.)))),,.}}}
Forensic Context

No forensic context available.