Basic Information
Symbol
hsa_LRBA_0044000
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-LRBA_0238
Host gene
LRBA
Type of circRNA
Intron-Intron
Location (GRCh37)
4:151923699-151925153
UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
4:151002547-151004001
UCSC (hg38)
External Database
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-425.00 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-452.36 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
331.51
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((((.((((((((((((..((((((........(((((((((((((((((.(((((((((.((((((((((..............................((.((.(((((.(((...(((..(((((((.(((.(((((....)))))))).)))))))......)))...).)).)))))))))..........(((........)))(((((((...))))))).(((((((((.(.((((((.(((.((....)))).).)))).)).).)))))...))))....((((((((((((((((.(((.(((.((((((((.((...((((....)))))).))))).)))...........((((....))))..)))))).)))).))))))))))))..............((((.((((..((.((.(((....)))))))..)))).))))...((......))..((((.(((....))).))))..)).))))))))(((..(((((........))))).)))..((((..((((..(((((.......))..)))....))))..))))(((.(((((.............))))).)))))))))))).))))))))))))))))).))))))..)))))))))))).))))))............(((((((((((....)).....((((((.....(((((((((....((((((((......))))))))...........(((((((...(((...((((.......))))...(((((((.((..(.((..(((((.....))).)))).)..)).)))))))(((((......)))))......(((((......((((..(((((((.((((((((((.(.......).)))))))))).))))).))..))))......))))).....)))..))))))).......................(((.(((....))))))....(((((((.(((((((((((.(.((.......)).)))))))..)))))...))))))).................(((((....)))))..((((((.(.((((((((.((((......(((((........))))))))).))))).))).))))))).)))).)))))..)))))))))).)))))..(((.(((((((.((..(((((.....((((.....)).)))))))..))..))))))))))....((((((..................)))))).................(((((((((((((.(((((..((((......((.(((......))).)).......)))).)))))))).((..(((..(((.....))).)))..)).........................))))))))))...........
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((((.(((((((((((({.((((((,,......(((((((((((((((((.(((((((((.(((((((({{..............................,,,{,,((({(.(((.{.(((..(((((((.(((.(((((....)))))))).)))))))...,..)))...).}}.)))))})}}..........,..........}}|(((((((...))))))),(((((((((.(.((((((.(((.((....)))).).))))},).}.)))))...))))....((((((((((((((((.(((.(((.((((((((.,,..{((((....)))))}.)))))}}))..........,{(({....)))),.)))))).)))).)))))))))))).,......,.....((((.((((..((.((.(((....)))))))..)))).))))...,,......}}.,((((.(({....})).))))..)).)))))))),,(,,(((((........))))).}))}.((((..((((..((({{.......))..)))....))))..)))).{{.{{{({.............)))),.))}))))))))).))))))))))))))))).}))))).,)))))))))))).))))))....,..,.,.||||{{{{({{{....}}.|,..(((({{.....{{{{{||{{....((((((((......))))))))...........(((((((...(((,..{{(({{,,.,,}}}},|,((({{{|,|||,,.{|,||||{{.....}}|,||||,}..||,}||||}}{{{{{..,.,.})))),.,,.,(((((.,....((((..(((((((.((((((((((.(.......).)))))))))).))))).))..))))....,.)))}).....}}}..})))))}......................,((({{,,,|,,}}}},,....(((((((.(((((|({{((.{.|(|....}})),))))))).,}))))...))))))).........,,,,....(((((....)))))..((((((.(.((((((((.((((......(((((........))))))))).))))).))).))))))).}}}}.)}})).,)))})))}},.}}},.,.{((.(((((((.,{..({{{,...,{((({.....)).)))))))..,...)))))))))|,,{,((((((..................)))))}..........,,,,.....{{{{..,,,)))}....,,,,|,.........((({{{......}))}}}....}}}}}}}}......,,..,,,..,,({{{{{||..|||...........................,})))))))||||{...,}}},.
Forensic Context
No forensic context available.