Basic Information

Symbol
hsa_LRCH3_0005400
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-LRCH3_0089
Host gene
LRCH3
Type of circRNA
Intron-Exon-Intron
Location (GRCh37)
3:197544346-197547301 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
3:197817475-197820430 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1098.90 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -1150.52 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 625.58
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((((.....)))).)))((..(((((((((.((.(((((.......)))....)).)).)))))))))....(((.....)))(((......)))(((((((.(((((((((..((((((((.........((((((......))))))........((((((((...((((((.(((((((........))))))).))))))....((((.(((((((((((....((((((....))))...))....)))))))))))..)))).............))))))))((((((..(((((.((((((......(((((((.((........((........)).......)).)))))))....))))))..(((((((..((((((((((((((((((((.(..(((((((((((((((((.((((((((((((((((((.((.(((((((((((((((((((((((((.(((((((..(((((.((..((((((((((((((((((((((..(((((((((((((((((..(((((((((.(((((.(.((((...(((((((.((((((((((((((((((((((..((((((((((((((((((((((((((((((.(((((((((.((((..(((..((((................)))).(((((((..((((............((..((((((.((..(.((((.((((((((((........))))))).((((((.((((((...))))))...)))))).((((((.......))))))..))).)))).)..)).))))))..))((((.(((((((.....))))))).))))(((((((((....((((((.((((((.(((........))).))))))..((((..(((.((((....)))).)))..))))))))))((((.(((((((((((..............))))..))))))).))))......((((((..(((((....(((((((.((((....(.......)....)))).))))))))))))....))))))....(((((((....)))))))...))))))))))))).))))))).....((((((...((..(((.(((.((.....))))))))..))...((((.((((.........))))..)))).............((((((((((((.......(((((((((...((((((((((.....................))))))))))))))).)))).......((((((.....))))))((((.((.....)).)))).((((((.........)))))))))))))))))).))))))..)))..)))).))))))))).))))))))))))))))))))))))))))))..)))))))))))..))))))))))).)))))))...)))).).))))).)))))))))..)))))))))))))))))))))))))))))))))))))))..)).)))))..))))))).))))))))))))))))))))))))).)).)))))))))))))))))).)))))))))))))))))..).))))))))))))))))))))..))))))))))))..))))))(((((((((((((((((((..((((((.(((((..((....(((..(((((.......)))))......)))((((....))))))..))))).))))))..)))).......((((((((......))))))))......((((..(((...)))..))))...((((........))))........((....))............))))))))))))))).(..(((((..........)))))..)........)))))))))))))))))......((.((((.(.(((((((...))))))))))))))..((((((((((((((((((((.(((((((((((((((((((((..((((((((((.((((.(((((((((..((((((((.(((.(((((((.(((..((...((((((................((((((((..((..(((....)))..))..))))))))..(.(((((((.((((.((((..((((((....(((.....)))..(((((..(((((((.((..((((....))))))))))))).)))))..))))))..)))).(((........))).........))))))))))).)((((((..(((((...))))))))))).......((((...(((((((..(((....)))..)))))))....))))(((((((.(((..(....)..))).)))))))...........((((((((((...))))))))))))))))...))..))).))))))).))).))))))))..))))))))).)))).))))))))))..))))))))))))))))))))).)))))))))))))))))))).....((((.....)))))))))))......((((((((((((..((((((((((...))))))))))............(((((((((.......))).))))))...(((.(((...((((....))))))).)))(((((((......))))))).........(((((..((.(..((((..((((...((((.....))))(((..(((....)))..))).....(((((((((.........(((((.((((((((.((((.....))))..)))))))).))))).(((.((((.((((((........))))))))))))).......................((((..........))))....))))))))))))).))))..).))..))))).......))))))))))))....))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((((((.....}}}}.}}}{({.(((((((((.((.,{{{{.,,,...,,),,..}}.)).))))))))).,..(((.....))){{,.,,,,,,||(((,(((,(((((((((..((((((({.,,,.{{{.((((((......)))))).}}}..}}|(((((({...((((((.{((((((........))))))}.))))))....,{{{.{((((((((((....((((((....)))}..,))....))))))))))}..,,,.....,........,}}}}}},((((((..(((((.((((((...,,.{{(((((.{(..,,..,.,{.....,..,},.,,...}},}}}}}},,|||}))))}..(((((((..((((((((((((((((((((.(..(((((((((((((((((.((((((((((((((((((.((.(((((((((((((((((((((((((.(((((((..(((((.((..((((((((((((((((((({{{{((((((((((((((((((..(((((((((.(((((.(.((((...(((((((.((((((((((((((((((((((..((((((((((((((((((((((((((((((.(((((((((.((((..(((...,.,{{{{{,,,..{{{{{,{{{{,,{{{{((,.,,,,,,,,........((..((((((.,(,,.{((((.((((((((((........))))))).((((((.((((((...))))))...)))))).{{{{{{.......}}}}}}..))).))))}).,)}.))))))..))((((.(((((((.....))))))).)))).,,{,,,{(,,.{(({{(({,{{,,({(((,.,,,,..}},,||||,|{.|,.,.,}},))})},)))))).,))))))),}}}}||}|,|{,{((((,{{{{(.{{{,{{{,,,,{{{{,,..||||||,.,|||,,..|{((({((.,((((,....{{{||||,{||,,||,|....,,,,....}}}),|||}}}}})))),...}}}}},....(((((((....))))))).,,}}}}||||||}}}|||||,.,.}}}.||{{{|,|||,|,,{{||||||{||,,,.}})))}},})).,,.}}|,,|||,......}|}|}},,,|},...},.,..}}}.((((((((((({...........(((((...((((((((((.....................))))))))))))))).||||{{{....,,{{||,,,,,)}},,,((((.{,.....,}.)))).((((((.........))))))}))))))))))).)))))}..)))..)))).))))))))).))))))))))))))))))))))))))))))..)))))))))))..))))))))))).)))))))...)))).).))))).)))))))))..)))))))))))))))))))))))))))))))))))))))..)).)))))..))))))).))))))))))))))))))))))))).)).)))))))))))))))))).)))))))))))))))))..).))))))))))))))))))))..))))))))))))..))))))((((((((((((((,((((..((((((.(((((..((...,({,..{(({{.......})))).,|,..}}}{({{....))))))..))))).))))))..)))).....,{((((((((.,....|||},.,,,}....{{{{..{{{,,,|||,,}}}}...((((........))))........||,,,,))..})))))),.,))))))))))))))).{..(((((.{{....,,.)))))..}........)))))))))))))))))|}}.,.((.{(((,(,{{{{{||,..)))))))))}|||}..((((((((((((((((((((.(((((((((((((((((((((..((((((((((.((((.(((((((((..((((((((.(((.(((((((.{({..{(,,,(({(((,...............{{{{{{{{.,||}.|||,,,,|||,.,,.,||||}}},.,|}|||{{{{.||||.((((..((((((..,{(((,,...}||,{((({(,,({(((((.{{..((((....)))))))}})))),))}}}..))))))..)))).{{(,.......})}.........}}}}}}))}}}.,((((((,.{{((,...,}}})))))))..,,...,{{,.,{(((((((..(((....)))..)))))))..,,.}}}{{{((({.{({..,....,,,)}}.}}|||||,.,,,.{{{{{(((({{{{,,..,)))))))))},)))))...)),,))).))))))).))).))))))))..))))))))).)))).))))))))))..))))))))))))))))))))).)))))))))))))))))))).....{(((.....)))),,,,,,,..,,,,((({{{{|||||,,{(((((({((...}}})))))},......,,{{{,{{{||||{{..,,,,,)))},}))}},,,(((.(((...((({....})))))).)))(((((((......)))))))..,,.....(((((..((.,..((({.,(((({,,(((,.....}})}|{{..{{{....)))..}}}.....(((((((((........,(((((.((((((((.((((.....))))..)))))))).))))),{{,{(({{{((((((........)))))))))))}},,,......,,...,}},.....((((..........))))....)))))))))))))})))),,,.)}..)))))....,..}))))}}}}})}..,,))
Forensic Context

No forensic context available.