Basic Information

Symbol
hsa_LRCH3_0005500
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-LRCH3_0200
Host gene
LRCH3
Type of circRNA
Intron-Exon-Intron
Location (GRCh37)
3:197545981-197555232 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
3:197819110-197828361 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-827.80 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -876.06 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 712.97
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.......((((.....))))(((((((.(((((((.((((((.((((....(((...(((.((((((...(((((((((((((...))))).(((.(..(((((.(((.....(((((...........((((((((......))))))))......((((..(((...)))..))))...((((((((((..((..((..(((.(((((.((((((((((...............((((((..((((.(((((..........))))).)))).))))))((((.(((((((.((((((.((((.(.(((((((...))))))))))))))..((((((((((((((((((((.(((((((((((((((((((((..((((((((((.((((.(((((((((..((((((((.(((.(((((((.(((..((...((((((................((((((((..((..(((....)))..))..))))))))..(.(((((((.((((.((((..((((((....(((.....)))..(((((..(((((((.((..((((....))))))))))))).)))))..))))))..)))).(((........))).........))))))))))).)((((((..(((((...))))))))))).......((((...(((((((..(((....)))..)))))))....))))(((((((.(((..(....)..))).)))))))...........((((((((((...))))))))))))))))...))..))).))))))).))).))))))))..))))))))).)))).))))))))))..))))))))))))))))))))).)))))))))))))))))))).....((((.....))))........((((((((....))))))))(((((((((...)))))))))..)))).))))))).))))..((((((..((((((((...))))..(((((((...((((((.((.((((((((((((......)))))))..................((((((((.(((((((.((((.....))))(((..(((....)))..))).....(((((((((.........(((((.((((((((.((((.....))))..)))))))).))))).(((.((((.((((((........))))))))))))).......................((((..........))))....))))))))))))))))...((((((...((.......))..)))))).((((((...((..(.(((((((((........)))..)))))).)..))...................(((........)))....))))))))))))))..))))).)).))))))...(((((((.....((((..(((.........((((.((((...((((((((...((((.((((..((.....))...)))).))))....))))))))..)))).))))..)))..))))......)))))))........))))))))))).))))))..........((((.((((..((.....))...)))).))))...((((((((..(((.(((((....))))))))..))).)))))))))))).))).)))))..))).))..))..)))))....)))))))))).....))).)))))..).)))..)))))))).......)))))))))...)))....((((.((((..((.....))...)))).)))).((((((.((....)).(((((((.(((..((((...((((..(((((....((((((.....(((.(((((...........((((.((((.....))))))))(((...((((((.((((((.((((((...))))))(((((......(((((.....(((((....))))).....))))).......)))))..(((((((((.((((((((.((((....))))..))).....))))))))))))))...)))))).))))))..)))..((((((.......))))))..))))))))((((((........))))))..((((((((....((((((.......))))))..))))))))..........(((((((((.....((.(((....)))))....)))))))))..(((((.......)))))..))))))...))))).((((((((....)))))))).......((((.(((((((((((....))).))))))))..)))))))).))))))).))))))).............((((.((((((((((.....)))).)))..))).))))(((.((((((((((...(((...((((((...((((((...(((((..(((((((.(((.....)))..)))))))))))).)))))).....))))))...)))(((((.....................)))))...........)))))))))).))).........(((((.(((......))))))))....((((...)))).........((((((((...........))))))))...((((((((((........))))))))))((((((((((...((((...))))...)))))))))).....))))))((....)).........((((.(..((......))..).)))).))))..)))))).))))))).)))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
,,(.{{{{..,},)),|{{{((((((({(((((((.((((((,((((,,..{{,...(((.((((((...(((((((((((((...))))).(((.{..(((((.(({,....(((((.{{.......{((((((((......)))))))}.,....((((..(((...)))..))))...(((,((((((..{{{{({..{({.(((((.(((((((((((,.............{(((((..((((.(((((..........))))).)))).)))))}((((.(((((((.((({((.{(((.{.(((((((...)))))))))))}))..((((((((((((((((((((.(((((((((((((((((((((..((((((((((.((((.(((((((((..((((((((.(((.(((((((.{{{..{(,,{(({((({...............{{{{{{{{.,||}.|||,,,,|||,.,..,|||||}},.,|}|||{{{{.||||.((((..((((((..,{(((,,...}||,{((({(,,({(((((.{{..((((....)))))))}})))),))}}}..))))))..)))).{{(,.......})}.........||}}}}}}}|}.,((((((,.{{((,...,})})))))))..,,...,{{,.,{(((((((..(((....)))..)))))))..,,.,}}{{{((({.{({..,....,,,)}}.}}|||||,.,,,.{{{{{(((({{{{{,..,)))))))))},))))),..}),,))}.))))))).))).))))))))..))))))))).)))).))))))))))..))))))))))))))))))))).)))))))))))))))))))).....((((.....))))........,(((((((....)))))))|(((((((((...))))))))),.}))).))))))).))))..((((((..((((,(({...,}}},,(((((((...{(((((.((.((((((((((((......)))))))..................((((((((.(((((((,(((,.....}))}|{{..{{{....)))..}}}.....(((((((((........,(((((.((((((((.((((.....))))..)))))))).))))),{{,{(({{{((((((........)))))))))))}},,,......,,...,}},.....((((..........))))....))))))))))))))))...{(((((....{.......}}..)))))}.((((((.,.((,,(.(((((((((........)))..)))))),),.))............,,,....,,{.,,,,...,))....))))))))))))))..))))).)).}))))}...(((((((..,,.((((..(((.........((((.((((...((((((((...((((.((((..,(.....})...)))).))))....))))))))..)))).))))..))}..))))..,,..)))))))........))))))))))).))))))....{{{..,(({{.((({...|,,..}})..,))}}.}|))...}||{{(((..(((.(((((....))))))))..))).)))))))))))).))).)))))..)}}.},,})}..)))))}.,{||,|||}}}},,...))).,})))}.},))}..))}}}})}...||..,}|}}}}}}...,}}|..,||||.||||.,,|,,..||}..,||,,.|||},,,|||.,||}..,}}.{{|{||{.{|{,.|||{...,,,,.,|{{{{....{{((((.....{{({(({,({,,..{{|...((({.((({...,.|)))))}){{{...{(((((.(((((({((((({...})))))||({{.....{(({{(.....(((({....})))).....}}}}}}}.....}}}},..{((((((((.(((((,{{.,,{{....}}}}..}}}.,,,.))))))))))))))...}))))).)))))}..||}..{({(((.......||}|}}..,}}},|{{((,{((,.......|||||}},||,{{{{{..,.||{{{{.......))))}),,))}}}},,.....,....(((((((((.....((.(((....)))))....))))))))).,||||{,|||}|,)}}})},))))))...))))}.((((((((....)))))))).....{{((((.(((((((((((....))).))))))))..)))))),,.))))))),))))))).............{(((.((((((((((....,)))).)}},.))).))))(((.((((((((((...(((...((((((,..((((((...(((((..(((((((.(((.....)))..)))))))))))).))))))...,,))))))...)))(((((.....................)))))...........)))))))))).))).,.......(((((.(((.....,)),)))))..,,{||,...,,,,.........((((((((...........))))))))...((((((((((.,....,,)))))))))}((((((((((...(((,...})))...)))))))))).{{{{{{{|.....))),})))}.....|,,,..,}}},,.,,,)),,.,}}}..}}}}..)))))).))))))).)))))))
Forensic Context

No forensic context available.