Basic Information

Symbol
hsa_LRP1B_0005100
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0117435 hsa_circLRP1B_093 hsa-LRP1B_0226
Host gene
LRP1B
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
2:141079532-141093407 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
2:140321963-140335838 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-207.70 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -222.83 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 194.69
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
..........((((.((((.......((((((((..((((((((((.(((........(((((((((((((((....)))).))))))))))).......))).))))....))))))..(((((((((((.(((....(((....(((((((((((((.(((((((.............((((((((......))).)))))((((....(((((......)))))..))))))))..))).))))))).)))))).(((((((((...((.((((..(((((...(((((((....)))))))....................((((((......)))))).........(((....))).....(((((.......))))).)))))..)))).)).)))))))))...((((((.....((((((((((....)))....(((((..((((..((((.....)))).)))).))))).))))))).....)))))).(.(((.......))).)....((((((....)))))))))...)))..))))))))))).((((((((((((((((...(((((....))))).)))).....(((......)))............(((((....)))))((((((.(((((....))))).)))))).((((((((((..(((....)))..)))))))))).))))))))).....)))..))))))))......)))).))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
({{{{{....,....,{{,.,.}}}}||((((((,((.,(((((({((((........(((((((((((((((....)))).)))))))))))..,,,...(((((((((((((({{{,{(((({(,((((.....|||(,,.{|{(((((((((((((.(((((((,{,,....,....((((({((......)}}.))))),{{{....(((((......)))))..,)),))))..))).))))))).)))))),((((((,,....,{.((((..,{||||.,(((((((....|||}}}}.........||,{{{{{{{{((((((......))))))....,,}}}|||....||,.....||((({{.,,.{{{|||.||((({{,,|(((....))))))))))||||{{..},,||{|||||||}.,,,,}....(((((..((((..((((.....)))).)))).))))).})}))}}.,},,)))))).,.,||},...,})),})}}}}}|||||,,,..,,})))},.))))))))).)))))..}}}...,,.,,..{{,{{,{,({..,..}})))}},|,,,,.,..|||...,,,..))))..,)))))}(((((....)))))((((((.(((((....))))).)))))).((((((((((,,(((....))).,)))))))))).........,,,,..,||,.}}))}})),}..}}))))}}}))
Forensic Context

No forensic context available.