Basic Information

Symbol
hsa_LRP1B_0011900
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0117444 hsa_circLRP1B_081 hsa-LRP1B_0155
Host gene
LRP1B
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
2:141200073-141272341 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
2:140442504-140514772 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-610.90 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -658.75 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 845.52
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((.((((.((.(((((((((..........)))))(((......)))........((((((((..((...(((((((.(.(.((((.(((((((.(((..(((.((((((((((((((.(((.......((((.((.(((((.....))))).)))))).....(((((((((..(((........)))((((.((((((.......))))))))))(((((((.....)).)))))..)))))).)))............(((.........)))...(((((.(.(((((..((((.(((........)))))))..))))).))))))......(((((.(((.(((.((..((((((((((((.(((.(....).))).)))))).((..((((((((((...))))).(((((((((((((...((((((....).)))))...))))))....))))))).....)))))..))..((((.((((.((.....)).)))).)))).((((.(((..((.(((((.(((((((..((((((((...(((...(((.......)))...)))))))).)))..)))))))))))).))))).))))......(((((....((((.....(((...(((.....)))...)))))))...)))))....((((((...(((((.(((((((.............)))))))(((...)))...))))).)))))).........((((...((((((((.((((((.((((.....)))).))..)))).).)))))))...)))).))))))..)).)))))).)))))..((((.((.....))))))....)))))))).))))....))))).)))..))).....((((((((..((((.((.((((((((.((.............((((.(((((((.(((((((.....((((...(((((((((((((((((((.(((......(((((....))))).((((((.((((...)))).))))))..((((.((((((((((((((((.......))))).........(((((.((((..((..(((........)))...))..))))))))))))))).))))).)))).....(((......)))(((...)))....(((..(((((((.((......)))))))))))).((((((.....(((..(((((.....)))))))).....((.(((((((((..((((((((((...(((((((((((.(((.....))).))))))))))).....))))((((((((((.(((......))).))(((((...(((.((((((......)))))))))((((((...(((((........))))).))))))))))).(((((.(((((.......)))))..)))))))))))))..))))))...)))))...)))).))...............))))))...))).)))))))))))).(((.....))).(((((((..(((.....)))))))...))).((((((........((((((((.((.....))))).)))))........)))))).......(((((((.((((...((.........))..)))))))))))......))))))).....)))).....))))))).))))))).))))......((((.(((......)))(((..((.((.(((((((..(((...(((.(((.(((((((.((((((....(((((((..((((((.(((.((((......((((...........)))).......)))))))...)))).))...)))))))..((.((.(.((.((....)).))).)).)).))))))........)))))))...))))))...)))))))))))).))...)))((((.(((((........))..)))))))....((((.(((.(((.(((((.............(((((..((....))..)))))(((((.......)).)))......))))).))).)))))))................)))).......)))))))))).)).)))))))))))).)))))))....)))))).)))))))...))..)))))))))))).)).)))).))((((...((..((((((.((((((.((.((........)))))))))).)).))).)..)).....))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((.((((.((.{({{(((((,{,.....},)))))|{{,.....}}}.....,..((((((((..{(,..(((((((.{.{.(({(((((((((({{(,,((({,(((.{(((({{,,,(((,,....,||{{.{{,||||{,,,..)))}),)))}||{....{{{((((((..(((........)))((((.((((((.......)))))))))){((((((.....))}}})))..)))))).)}),.}}}.......{{{|||{,|.....,}}}))))|}},|{{{......|}}|)))}}}}},}||{{{|.{|||{|{(({{{,{{.{,(((((((...((((((....))))))))))))}||,,.,,|}|,||,||||}}||||,.||}|,{((({{{,||,{.((((((({(((((...{{{(((,,,.|,|||}}...}}}}}}..,,|||||}|{(((..((({{,,...((((.(((,.,,..,,,))}),,,.))})}}}},.)))},((.{((({{(((((((..{{((({{{..,|||..,||||{,{{,{|||||,}|||}|||.|}}..}}}}}}}}}))).))}},||{|||,.{{{{{{..||||||||.....,,,,,{({({{{,..{{.,{{(,,|{|||,|}}}|..|,|{{||{.,,(((((,(((((((..,........,,))))))),||,..||,...}}})).}}}}|||,..,,,((((({{.,{(({{,{,,|{{{||{(((({{,{{|,||{||{{|}|,.,,}|||,,|{{{.,.((.(((....))).)),.)})),,},|(((({(...........,.}}.})))}..))))})},....,}|{|||{{||{{,,,.,.,.,,,,.,|||{.,,.,|||||.}}}}}...,}},..,,}}},|}}}|||||,||,||||,,,..,,.....||}|||||||{,{{(((((.((({{{{{.(((((....}}}}}.,{{{{{,{(((,{,||||{}||||}.,((({.{{{{{|||{{{{((,(,,,,...|||||||,..,||,{{|{{,{||,..||,.,||},,..,.{|{{{{{{.{{{{||||.|{||||,|{{,|||.,}||.....,{{,,,.,,}}|(((...))),....,,..{(((((,,((......))))))))},},,,,.,,..,,,,,,}}}.}})}}{(((((..{((((((...))))))})))))}..((((.......)))}...}))}}}))...}}))))))}|||},,.},,.,||||||||||||||,.|||}}.,..)))})}}}||{||,(((.((((((......)))))))))}}}})))).)||||...{{{{{||,}},))}}}},}))))}})))}}||||....,||}}}}|..|||,.|{,|{|||{{{||,||..{{{{{{{{.{{{((,,..........{{{{{{||{{{{{{|||{||,|||||||||.,{{.....}}}.|||((((..(((.....)))})))...,,|.((((((..,.....((((((((.((.....))))).))))).......,)))))).......(((((({{((((,,.,,.,.......,),.)))))))))))......{||,,,,..,},}}))}}))),}))}}))))))},..,.,,......}))})))))}.....|{(,...))}.,.(((((((..{((...(((.(((.(((((((.((((((..,,{{(((({.,,{((((,,{,,{(((,,{.{.{{{{,,,|,,.,...,}},.,{{|,.}}||||}...}}}}.)},}}))))}}}}.|||{{.{,((.((....)}.}}}.}},}}.)))))}........)))))))...))))))...)))))))))),))))}.)))),}}}}..}}..}}}}}}}))).)),}}}}..,|{{{{||,|,})},|||||.,}},.}},.,}}}|||}}}}}}))}}}}}}))))}}}}|.,,},,}}}||||,.....{{|..{|,|..((((....,{.......}}..))))..}.))..))))))),.},}),,,,.,},,})).}))))))}.,..)))))),))))))).,,})..)))))))),))).)).)))).))((((.{,((..((((((.((((((.{(,{(........)))))))))).)).))).)..))..}}.))))
Forensic Context

No forensic context available.