Basic Information

Symbol
hsa_LRP1B_0012000
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0117445 hsa_circLRP1B_079 hsa-LRP1B_0072
Host gene
LRP1B
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
2:141200073-141274580 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
2:140442504-140517011 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-641.60 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -692.78 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 881.51
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
...........(((....))).............((((((.(((.((....(((((((..........((((.((((((((.((...((((....(((((...(((((........))).))...)))))....))))(((((..........)))))..........(((..(((..((((((((..((...(((((((.(.(.((((.(((((((.(((..(((.((((((((((((((.(((.......((((.((.(((((.....))))).)))))).....(((((((((..(((........)))((((.((((((.......))))))))))(((((((.....)).)))))..)))))).)))............(((.........)))...(((((.(.(((((..((((.(((........)))))))..))))).))))))......(((((.(((.(((.((..((((((((((((.(((.(....).))).)))))).((..((((((((((...))))).(((((((((((((...((((((....).)))))...))))))....))))))).....)))))..))..((((.((((.((.....)).)))).)))).((((.(((..((.(((((.(((((((..((((((((...(((...(((.......)))...)))))))).)))..)))))))))))).))))).))))......(((((....((((.....(((...(((.....)))...)))))))...)))))....((((((...(((((.(((((((.............)))))))(((...)))...))))).)))))).........((((...((((((((.((((((.((((.....)))).))..)))).).)))))))...)))).))))))..)).)))))).)))))..((((.((.....))))))....)))))))).))))....))))).)))..))).....((((((((..((((.((.((((((((.((.............((((.(((((((.(((((((.....((((...(((((((((((((((((((.(((......(((((....))))).((((((.((((...)))).))))))..((((.((((((((((((((((.......))))).........(((((.((((..((..(((........)))...))..))))))))))))))).))))).)))).....(((......)))(((...)))....(((..(((((((.((......)))))))))))).((((((.....(((..(((((.....)))))))).....((.(((((((((..((((((((((...(((((((((((.(((.....))).))))))))))).....))))((((((((((.(((......))).))(((((...(((.((((((......)))))))))((((((...(((((........))))).))))))))))).(((((.(((((.......)))))..)))))))))))))..))))))...)))))...)))).))...............))))))...))).)))))))))))).(((.....))).(((((((..(((.....)))))))...))).((((((........((((((((.((.....))))).)))))........)))))).......(((((((.((((...((.........))..)))))))))))......))))))).....)))).....))))))).))))))).))))......((((.(((......)))(((..((.((.(((((((..(((...(((.(((.(((((((.((((((....(((((((..((((((.(((.((((......((((...........)))).......)))))))...)))).))...)))))))..((.((.(.((.((....)).))).)).)).))))))........)))))))...))))))...)))))))))))).))...)))((((.(((((........))..)))))))....((((.(((.(((.(((((.............(((((..((....))..)))))(((((.......)).)))......))))).))).)))))))................)))).......)))))))))).)).)))))))))))).)))))))....)))))).)))))))...))..)))))))).))).)))))..)))))))).))))..((((.((((((.((......))))))))..)))))))))))..)).))).))))))..
Thermodynamic Ensemble Prediction
...........(((....))).............((((((.(((.((....(((((((,,.......,((((({.{((({(((({.,,(({((((.,((({{({,((({.{{{{(((((,{{.({{,((((({{((.,{(({(((,..{{((({,{{{((({{,,,{|||.....,},))))),,.))))}),}}))))))||,||{|||||{{{{(({{(.{(((({(({.{{{(({,{{{(({,{....,{(((.((.(((((.....))))).))))}|{....{{{((((((..(((........)))((((.((((((.......)))))))))){((((((.....))))))))..)))))).)})}.}}}.......|||||||||.....}})))))),}}}|||,......}}}})}})))}..||||}||.|}}||}}||||,.,,.{.{({{(((,,,((((((....))))}||||||}|{|.{...,).}}}.})))))}}||,,|||,,{{({{{{,,|,,.((((((({(((((...{({(((..,.|,|||}}...}}}}}}....}}})))}|{||,,|{||,.,,..((((.((({.{{.....)),)}}}.)))),|,}}})))}|((.(((({{(((((((..((((((({...{((...,|{,{,,,.,}}),},))}))))).}))..)))))))))))).))}}}}}}}},..,,,,,,,,||,}}|||....,}}...||||||}}}}}}}||||}}}})}.}})))},.|.((((({...(((((,(((((((..,........,,))))))),||,..||,...}}})).))))))|.....,{(((({,..{((({{(,,{((({{,((((,,.,,|}||,||||}}}}.,.)}}}}}||||,}.((,(({,,,,|||,}},.||},,{,,((((({(.,.........,.}}.}))))..))||}||,....,}(((((((((({{{,..........,}}}......))))).))))}...||,.....,||{{,|{{(({{.{{{{{{{.,,..{{,,...{{|{{{{{({{((((((((.(((,,{,{,(((((....}}|||.,,,{{{,{((({{,||||{|||||}.,(({{.{{{{||||,((,((,({{{{..,{|||||{,..,{{,{{,{{,{||,..,|,,,|}},,....{{((((((.((((((({.|{({(|,{{{,|||.,|||.....,{{,,,...}}|(((...))),...,{{..{(((((,,((......))))))))},},.,,.,,..,,,,,.}}}.}})}}{(((((..{((((((...))))))})))))}..((((.......)))}...})))))))...)))))))),|||,,,,)}}.,{||||((|||||||{.{||,,....))),)}||{{{{{{(((.((((((......)))))))))||||}))),||||{...{{,{{||,}}.})}}}},,})))}}}))})||||...,.}|)))),.,}}}},},}||||||||||}||..|||||{||.|||{({{..........,|,,|||||||||,|||,|}}|||||||}},,{{.....}}}.,,{((((..(((.....)))})))...,,|.((((((..,.....((((((((.((.....))))).))))).......,)))))).......(((((({{((((,,.,,.,.......,),.)))))))))))......|}}}}}}..,,.}))),,,})})))))),)))))},.}}}}...,,.,))}}|||,.....}|||}}}})))...|||||{{..||,,,}|||}{||,|||{{{,.,,{|||,,}}.||||||.{{((((({,{.,,{{{{{({({((({{||{{.{{,..,|,...{{{,..}}}|(|{{,||||,},,|||||,,,||.,({(,{({((.(({{..||,||{{||{||.||||||....,,},)))))}}{{{||}|||...|||}}}}}}),)}},}.|||}{||||{,|,,,|||||||,,},}},}}}},.,},,{||}}}}))).|||,,..}},.}},..,}}|,|}}}}}}))}})}}})|}||||||.|||,.,|,{{{{,...,,(({..{{.{..((((....{{.......})..))))..}.))..})))))),.},,),.,.,,},,,}},}}})}))},,..})))}})))),,))))))))),))),,||.,..||}}}.,}..))))))}}}}},|,|}}.))))))})}))}}},}}}}).})))}))))))))))..)).))).))))))..
Forensic Context

No forensic context available.