Basic Information

Symbol
hsa_LRP1B_0025200
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0056637 hsa_circLRP1B_051 hsa-LRP1B_0059
Host gene
LRP1B
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
2:141571226-141665646 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
2:140813657-140908077 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-558.10 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -598.98 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 467.74
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((...((.(((.((.(((.((((((.((....((((.((((.((((.......(((((........))))))))))))).))))......))))))))(((((....)))))...(((......)))..((((..((.((((...))))))..))))....((((...))))....))).)).)))..))..)))((((((((..(((((...))))).(((.(((((((((.((((((((((.(((((((((.....))))...(((((((((..(((((((.....((............(((((((..((((......))))..))))))).....(((((((..((...((((.((..((((((((((..(((((........)))))..)))).....((((((..(((((..(((((((((.....((((..(((.((((((((((((((.....((.((((..............))))))))))))))))))))))).)))).....)))...)))))).((((.((......)).))))((((.(((((..((((((((((((...(((((((.(((...(((.....((((......)))).......)))))).))))))).)).))))))))))...))))).))))(((((((((((...((((((((.((((.(((((..(((......)))..)))))))))............(((((((((.((((.((((.(((...((((((((((((......(((((((((((.............)))..))))))))......(((((((((((......))).))).(((........)))((((((.........(((((....(((((((.((((((..((.........)).)))))).)))))))....))))).......)).))))..))))).((((((....)).))))...))).)))))))))..........((((......))))..))))))))))).)))))))))...(((((.(((.......))).))))).........)))))))).....(.(((((((......((...))......))))))).).....((((((.....(((((..((..(((..((((((....(((.....)))...))))))..)))..))....)))))....)))))))))))))))))...................)))))..))))))...(((.((((((((...(((.((((....))))..((((....((.(((...((((..........))))....))).)).))))(((.(((((......((((((((...(((((......)))))..(((.(((((..((((...))))...)))))))).....(((((....)))))..((((((.......)))))).......)))))))).))))).)))(((((((((((((((((.((((...((.....))...)))))))).((((..((((((...(((...................))).))))))..))))...((((........))))....(((.(((((....)))))..))))))))))).))))).)))..)))))))).)))...(((((((...)))))))..(((........)))..((((......))))(((((((....(((((..((((...((............))..))))..)))))....))))))).))))))(((((.((((.....))))))))).....((......))....)).))))..)).)))))))((((((.(((..(((((((...)))))))........(((..(((((((....)))))))..))).......)))))))))))....)))))))...))))).......)))))))))..)))))))))).................((.(((.........))).))....))))))))))))..))))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((.,,((,(((.((.{((.((((((.((.,,.((((.{{{(,{{{{......{(((((........))))))},,)))),))))..,}..))))))))(((({....)))))...(((......))),.((({,,(.{((((...))))))..,))),...{(({...)))),,,,||},}}.}}}.,)),,))){{((((((.|{((((...)))),.(((.(((((((((.((((((((((.(((((((((.....))))..,{{,,(((((..(((((((.{{.{((,...........(((((((..((((......))))..))))))).....,((((((..,{...((((.((..((((((((((..(((((........)))))..)))).....((((((..(((((((({{,,.,,({({.{(({{..{((.((((((((((((((....,{{,{,{{...........,..}})))})))))))))))))))}}.}},,,{{((((....)))).)}|(((.((......)).})),((((.(((({,{((((((((((((...(((((((.(({,.,(((.....((((......)))).......)))))).))))))).))}}})))))),,,}}))))).))))(((((((((((.,,({((((((.((((.(((((..(((......)))..))))))))),|}.........(((((((((.(((,{((({{(((...((((((((((((...{,,(((((((((({,,.......,,..}))..)))))))),,....{{(((((((((...,,,))).}}|{{{{...,,...}}||{{{{{{.,,.,...(((((....{((((((.(((({...{(,,.......)),}))))).))))))}....))))).......,..,,,..,))))).{(((((....)).)))},,.))).)))))))))..........((((......))))..))))))))))).)))))))))...(((((.(((.......))).)))))........,||||}}}}...,,}}|{||{{{,,,,,.{{,.,||,,,...,}))))},},,|,,{{((((,,,..((({,..,{...,{,.{{((((....{{{.....))),},)))))},.))),,}}}},.))))}....))))),))))))))))),}}.}))}....,,.}))})))))..))))))...(((.((((((((...(((.((({....})))..((((....(({((,...((((..........))))...})))}),.))))(((.(((((......((((((((...(((((......)))))..(((.(((((..(((,...}))).,.}))))))).}...,((((....))))|{.((((((.......)))))).,,....)))))))).))))).)))(((((((((((((((((.((((...((.....}}...}}}))})),((((..((((((...(((...................))).))))))..)))}..,((((,,......))))}...|||,||{,,....,)}}}.,))))))))))).))))).)))..)))))))).)))..,{{{{{{,..,|||}}},..|||,...,,,.,,,..((({......))))(((((((....(((((..((((...((............))..))))..)))))....))))))).))))))(((((.((((.....))))))))).....{(......,.....)).))))..,}.))))))}{,{{,,.,||..(((((((...)))))))....,...(((..(((((((....)))))))..))).......}))}}}))))}}}..)))))))...))))).......,,,,)))))..)))))))))).............{{...,..............,,.......)))))))))))).,))))))))
Forensic Context

No forensic context available.