Basic Information

Symbol
hsa_LRP1B_0027600
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0117467 hsa_circLRP1B_053 hsa-LRP1B_0124
Host gene
LRP1B
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
2:141607671-141660734 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
2:140850102-140903165 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-375.10 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -405.85 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 511.31
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((.((((....(((((.(((..((....))..))).))))).((((.((((((...((((((.....))))))..))...))))...)))).........(((((((..((((......))))..))))))))))).))))((...((((.((((......)).)).))))..((.(((((.((.((((((.((((.(((.(((((((.((((((.((((........(((((((((((.((((((((((((((.....((.((((..............))))))))))))))))))))........(((((((....)))).)))(((.((......)).))).((((.(((((..((((((((((((...(((((((.(((...(((.....((((......)))).......)))))).))))))).)).))))))))))...))))).))))....(((((.(((((.((((.((((...(((((((..((((.(.(((.....))).))))).........(((......))).....(((.(((........))))))......(((((((((((.............)))..))))))))((......)).((((((......))).)))((((........)))))))))))..((((((((((((..(((((.(((((((((.(((((((........((.((((((.(((....(((((...................((((((((....((..(..(((((....(.((((....))))))))))..)..))...)))))))))))))...))).))))))))(((((.(((.......))).)))))........(((((.......)))))((((((......((...))......))))))(((..((((.((((.....)))).))))...)))..((((((...........)))))))))))))...)))))))))....)))))....)))......((((((...)))))).....)))))))))))))))))...)))))))))))))))))))))......(((....))).))))..)).)).)).)))))))..))).)))).)))))))).))))).))((((((..((((((((((((((((((((..........(((.(((((..((((...))))...))))))))...(((..((((...((((..((((((.......)))))).))))...))))..)))(((((...((((..(.(((.((((...)))).))).)..))))..))))).)))))))))((((((...(((...................))).))))))))).)))))))).))....))))..((((......))))...))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((({((((,,..((({{,({(,.((,,,.||,,|||,||||}.((((,(((({{...((((((.....))))))..}},,.)})),..}}}}.........(((((((..((((......))))..))))))).,,..,|{{((,..,(,({(((..,,{{{{|{||{||||..{{.,...|....|))))|}||||}|,,.|||||,|.,,}}}}}|.|||}||}|..,|||||||{||},||,||,,||||||,}}}}||}|{.({{{.,,,,..{{{{||}||{||||,,||||||}|,,..,...{{(((((....)))).})}||{,(({{{{{{|,.,||{((,,.(((({,{((((((((((((...(((((((.(({,.,{((.....((((......}))).......)))))).))))))).))}}}))))))},}}}))))),||,,..}}||{(({((((({,((((({((((.(((((..(((......)))..)))))))))))).........(((((((((.(((,{((({({((...{(((((((((({...,,,(((((((((({.,.......,,..}))..)))))))){{....{{||{(||{{{,.,,,,))).}}}{{{{...,,...,}}|||||||...{{,,,(((((....{(((({(.((((({..(({{,,,,,..}},|||}}},}}}}}}}...,))}}}.....,.,,.,,...,}}}||,{(((({....)).}}}},,,))).)))))))))..........({((,.....}})),.))))))))))).)))))))))...(((((.(((.......))).)))))..{{,|..,,||,.,}},..,||||{.(((({.....(({{{|.{......{{{{{((...{{...((((.{.({{(((.{{,,.......,|||||,...{{,.....)))}}}|||},||,{{||||{{||,....,........}}})}.}.}||||{,,,,}}}}}}....},}}))))))))))),,},..))))))),,..,,)))))))....)}))),,}}})})},))))),)))}}))|),,.,))}}))},},}}|))||||,,.}}})),||||{,,|,,|((((((((||,(((((.,....}}}}}..(((.{{(((,.(({....}))).},}))}}))}.}...{((((....}}}||{.((((((.......)))))).},,,..}}}}||||,}|}}}...}}}}}}}})}}.,},))))}),,,.,||||||}}}||||,},|,}}}}}}},.((((((...(((...................))).))))))}})}}}}}}|||,}},..,}})}}.|||,}},,,.,,,},}}))
Forensic Context

No forensic context available.