Basic Information

Symbol
hsa_LRP1B_0031100
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0117472 hsa_circLRP1B_047 hsa-LRP1B_0047
Host gene
LRP1B
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
2:141660489-141709509 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
2:140902920-140951940 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-260.20 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -276.39 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 181.03
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
......((((.......(((((....((.......))....)))))..((((((((....(((..((.(((((.((((((((....((.(((.(((.(((((((((..((.....))....))))))))).))).))).))...))))).))).))))).))..)))(((.((((((....)))))).)))((((.((((((.(.((((..(((((....))))))))).))).))))))))......((((((((((.((((((.....)))..)))))))))))))((((((((......((..........))......))))))))...............(((((....)))))............((((....((((..(((((....)))))))))...)))).....(((((((......)))))))))))))))......((.((((((.((....((((.((((.((((.......(((((........))))))))))))).))))......)))))))).))...(((((((.(((..((((...((((((.(.(((((((((...)))))...........((((...))))((((((.((.....)))))))).((.((.(((((.......(((((.(((..((....))..))).))))).(((.(((..((...((((((.....))))))..)).))).)))....))))).)).))(((((((..((((......))))..)))))))..(((((.(((((.(((.((((..(..((((.((.......)).))))..)..).)))))).))).)).)))))...)))).).))))))))))...)))))))))).))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
......((((,,{{,.,(((((...,,,.,,,...||,...}}}}}..,,{((||,.}},(((..((.(((((.((((((((..,,((.(((.(((.(((((((((..{(,....))....))))))))),))).))).)).}}))))).))).))))).))..))){((.((((((....)))))).))|(((,{((((((.(.((((,.(((((....))))))))).})),}))))))),.....((((((((((.((((((.....)))..)))))))))))))((((((((......((.,,,...,,,))......)))))))),...,,.........{{{{{....}}))),}},........((((....((((..(((((....)))))))))...))))..{(((((((((......))))))))))})})),,},..((.((((((.((.,,.((((.{{{(,{{{{......((((((........))))))}},)))),))))..,}..)))))))).))...(((((((.{{{..((((...((((((.(.(((((((((...)))))....,{{,...{{{,...))))((((((,{{.....}))))))).,{.,({(((.(,,|.,,.(((((.(((..((....))..))).))))).((({{(({{((...((((((.....))))))..}}.,,)}))}..}}}},,,.,...,(((((((..((((......))))..))))))),}}|.}}}}}....{(,(((((..{,{{((({(({,|,,..{{.,...,,...})))))))},,}},..))))).,.)))).).))))))))))...}},))))))).))))
Forensic Context

No forensic context available.