Basic Information

Symbol
hsa_LRP1B_0005200
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-LRP1B_0419
Host gene
LRP1B
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
2:141079532-141202248 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
2:140321963-140444679 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-698.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -751.56 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 600.50
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Forensic Context

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