Basic Information

Symbol
hsa_LRP1B_0013900
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-LRP1B_0430
Host gene
LRP1B
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
2:141214024-141291709 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
2:140456455-140534140 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-627.80 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -675.73 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 610.67
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(.....((((((........)))))).((((((........(.((((.((((((.((((.(((.....))).)))).))..))).).)))).)((((.(((((....))))))))).....(((((((........))))))).....(((((((((.((.(((((((.(((((((((.(((((((...............))))))).))).))).............(((........))).((((((((((((.(((((.((((..((....))..)))).)).)))))))))...((((((((((.((.(.((((((((..(((((((..(..((((((....)))).))..)..)))))))...((((((((((.....(((...(((........)))...)))...)))))))))).(((....)))....((((.((.(.....).)).))))..))).)))))).)).)))))).))))..(((.((((((((((..((((.(((((((((.(((.((((...((((...(((.((((...((.(.((((((.(((.......)))..))))))).))...)))).)))...((((........))))))))....)))).)))...((((.((.(((((.....))))).)))))).(((((((((((((..(((........)))((((.((((((.......))))))))))(((((((.....)).)))))..))))))((((((..........(((((((...........))))))).(((((..((((.(((........)))))))..))))).((((.......(((((((...((((((....)))))))))))))))))...(((.(((.(((((.((.......(((((...))))).(((((((((((((...((((((....).)))))...))))))....)))))))))))))).))).))).((((.(((......)))))))...))))))((((.(((..((.(((((.(((((((..((((((((...(((...(((.......)))...)))))))).)))..)))))))))))).))))).))))..)))))))((((...(((....)))...))))))))))))))))))))))).)))))))...((((((...(((((.(((((((.............)))))))(((...)))...))))).))))))........))))))..((((((((.((((((.((((.....)))).))..)))).).))))))).......)))..))))))).))))))))))).(((((..................))))).))))))((.....))((((((((((((((..........))))......))))).)))))...((..((...((((.(((((((.(((((((.....((((...(((((((((((((((((((.(((......(((((....))))).((((((.((((...)))).))))))..((((.((((((((((((((((.......))))).........(((((.((((..((..(((........)))...))..))))))))))))))).))))).)))).....(((......)))(((...)))....(((..(((((((.((......)))))))))))).((((((.....(((..(((((.....)))))))).....((.(((((((((..((((((((((...(((((((((((.(((.....))).))))))))))).....))))((((((((((.(((......))).))(((((...(((.((((((......)))))))))((((((...(((((........))))).))))))))))).(((((.(((((.......)))))..)))))))))))))..))))))...)))))...)))).))...............))))))...))).)))))))))))).(((.....))).(((((((..(((.....)))))))...))).((((((........((((((((.((.....))))).)))))........)))))).......(((((((.((((...((.........))..)))))))))))......))))))).....)))).....))))))).))))))).))))...))..))...(((......(((....)))....)))............)(((((.((((......(((........))).......))))..)))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
......((((((........)))))).(((,.,}}}.....(.((((.((((({,((((.(((.....))).)))),),.,))).).)))).}((((.(((((....))))))))).....{((((((.,......))))))}....(((((((((.{(({,,,,(((.(((...((({((,,,,({,..,{{{,...{{{|,|||||{|,|.|{({....,,...,..|||,,......}}}.||||||((((((.(({((.((((..((....))..)))).)).})})))))}...((((((((((.{(.(.((((((((..(((((((..(..({((((....)))),}},.}..)))))))...{((({{{(({....,(((,..{{{..,,....})),..}}}...}}))))}}}|,(((....))}.,,.{{{{.||.{.....},)),)}}),.))).)))))}.)).)))))).))))..(((.((((((((({,.{(((.(((((((((.,.((((((..,,,(({.((((((((((((((((........)))))...)))))).)))))}}}(((((((({(((((({({{(,,{({{,(({.{{{(({,{,,(({,|,...,||((.((.(((({.....))))).))))||{,...(({((((((..(((........)))((((.((((((.......)))))))))){((((((.....))))))))..)))))).)}),.}}}.......{|{|||{||.....,}}}))))|}},|{{{......|}}|)))}}}},,{{{{|{|.||||||,{{{{{,{{.{{(((((((...((((((....))))))))))))}||.,...}),.}}.,)))))}||},.,}},{{{{|..,}))},.(((((((((((((...((((({....}.)))))...))))))....))))))),,}}}}|||},..,,.((((.((({.((.....)).)))).))))...)))))))}((.(((({{(((((((..((((((((...{((...,,{,{{,,..}}),,.))}))))),}))..)))))))))))).))}}))))))..,,,..,,{{{{...(({....}))...)))}))))))))))))))))))).))))))).{.((((((...(((((.(((((((..,........,,))))))){((...))}...))))).)))))),......,|||||}..(((((((..(((({{.((((.....)))).))..)))).}.)))))))...,,.{||{{.|||||||{,,},|||,||}.(((((((.,.........,.}).}))))..})|||{{.....}}((((((((((((({..........,}}}......))))).)))))...{{..,,...((((.(((((((.(((((((.,,..(({{...(((((((((((((((((((.(((....,,(((((....}}|||,.,.{({{{((({{,{{||{|||||}.,(({,.|||||}}|,((.((.(((((..{{((((,{{..,,{,{,,{{,{||,..,|,,,|}},,....((((((((.((((((({.|{({(|.(({,|||.,,{{.....,{{......))|(((...))),...,{{..{((((({,((......))))))))},},.,,.,,..,,,,,.}}).})))}|(((((..{((((((...))))))})))))}..((((.......)))}...|)))))))...)))))))).||{.,,,)}}.,{{{{{((,,{{{{({.(((......))).}},,((({{{(((.((((((......))))))))),,,,||}}}|{{((.,,,,,{,||}}}.}))))},,)))},,}))))}}}}..,}.)}))))..))))))).))}))))}}))))),,,})},.},,}}}|{({..............,)))},,,,.))).)))))))))))),{{{.....}}}.,,{((((..(((.....)))})))...,,|.((((((........((((((((.((.....))))).))))).......,)))))).......(((((({{((((,,.,,.........,),.)))))))))))......,))))))..,..}))}...}}))))))).))))))).))))...,}..))..{((......))}}}}}})))...))))).......}}}})|||||}||||}}....|}}..}}}...)))}.}))))))))..)},,,
Forensic Context

No forensic context available.