Basic Information

Symbol
hsa_LRP1B_0020000
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-LRP1B_0157
Host gene
LRP1B
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
2:141457819-141609352 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
2:140700250-140851783 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-579.50 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -627.17 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 568.92
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.(((((.((((((.(((((((....))))...((.((((.(((((...((((..........)))).((((((((((((((.(((((((.............(((..(((((......)))))...)))..(((((......)))))((((((((.((((((.(((((((...((((..((((((.......)))))).))))...)))).....(((((((((.(((((((.(((((((..((((((((.((...(((((((((.((((((...((((((...(((...................))).))))))..(((((..((((((..(((...)))...))))))....)))))...))))))))))).))))(((((((((((((((.((...)).)))))..)))))..)))))(((........)))..((((......))))(((((((....(((((..((((...((............))..))))..)))))....))))))).......(((((.((((.....))))))))).((.(((.............))))).........)).))))))))..)..(((((((...)))))))........(((..(((((((....)))))))..)))....(((......))).))))))))))))).))..........))))))).(((((((((((((...........................................(((.(((..((..(((((((((........)))))))))..)).......((((((...))))))...))).))).........((......)))))))))))..(((((......))))))))).........))).)))).)))))))))))))).)))))))))).)))))))((..(((..(((.(((.(((.(((((...((((((((((....(((((..(..(((((((((......((((((.((.((.((.((((((...(((.(.((((((.((((.((((((.(((.(((((.((.((((((..(((((..........(((((....))))))))))..))).))).)).))))).))).))))))......((....((((((..((((((((....))))))))....))))))..))........)))))))))).).)))..........(((.(((((.............((((((.((.....)).)).)))).((((((((((((((...((......))((((.((((....))))))))(((((.((((.((((((((((((((((((.....))))))..)))))..)))).))).)))).))))).))).)))))))).)))((((((......))))))))))).)))..((((((.(((....))).))))))......)))))).)))).)))))))).....))).)).))))...)..)))))...)))..((((((((..((((((.((..(((......)))..)).))))).)..))))))))...............((((((...)))))))))))))...))))).))).))))))....)))..))...(((......)))((.(((((..(((((.((((......))))))))).(.((((((((((....(((..((((((((((((.(.(........)).))))))))....(((..((....))..)))............))))..)))...)))))))))).)..))))).)).(((((((...)))))))......)))))..)))).))........)))))))))....(((.(((...))).))).((((((((..(((...(((.(((((((((((...(((.((((...........)))).)))...)))))...((((...)))).....((...((((((((.(((((((((...(((((....)))))...))))))))).......................((((((..(((((.(.((.............)).).)))))))))))...(((((......)))))(((((...(((....)))...))))))))))))).))...)))))).)))......)))..))))))))..))))).....(((((....)))))....
Thermodynamic Ensemble Prediction
.(((((.,{{,(((((((((,....||||,..(({((((.(((((...((((..........)))).{{{|||((((((((.(((((((((((,{.((((((((...(((((......)))))..(((.{{(((,.(((....}))).,,})))}))).}...,((((....))))|{.((((((.......)))))).},....)))))))).}(((((((((.(((((((.((((((,..{(((((((.{(...(((((((((.((((((...({((({...{{(,,,,...............||}.}}}}}}..{{,,,.,{{{{||...||..}))}...))))),....,}},}...})))))))))).))||{{{{|{{({{(((((.((...}).}))}}..,))))..}))))}|,.,{{{{{.,....,{||}}}}..,||}(((((((....(((((..((((...((............))..))))..)))))....))))))).,,.,,,(((((.((((.....))))))))).{(,{((.............||||,....,,}}.}).))))))))..}..(((((((...)))))))........(((..(((((({....|))))))..)))....|||..,,,,))).))))))))))))).))..........)))))))..,,.(((((((((....,,.....,..{{...,..............,,.......(((.(((..((..(((((((((........)))))))))..)).......((((((...))))))...))).})).........{{......}})))))))))...||{,......,}})))))....(((((.{,...}}))))).......)))).)))))))))),||||||,{{,.,,...(({.(((.(({.(((((...{{((({{{((..,.(((((..(..(((((((((......((((((.((.((.{{.((((((...(((,(.((((((.((((.{(((({,({(,(((((,{,.{{{{{{..(((((,{..((..(({{{{|....))))})))}),.}))}})),||{|||}}.|||{|||,,,.,}}}}||...,||||||(,{(((((({....})))))))}}},,}))))}.,,.},},}}.))))))))))}).)))..........(((.(((((....,,,,,....{(((,{,{{.....)).}).)))}.(((((((((({{((.,.,{,....,||(((,{{{{(....))}}}}}}{(({{.{(((.((((((((((({((((((.....))))))..})))},.))))}})).)))).))))).,,,.}))))))))}))((({{{..,,,.))))),))))).)))..((((({.(((....))).})))))......}))))).,,)).)))))))).....))).)).))))...)..)))))...)))..{(((((({.,{(((({.,,..{((,{,{..}|)|,,},})))).).,))))))))...,...,{{{.{{.((((((...)))))))))))),.,.))))).})).)))})),,..})).})),||{,,.,{{{{,,{((.({((({.(((((.((((.....,})}||)))).{||||{|.|||...|}|||..{{{(((((((((.(.(........)).))))))))},,}||)),..,,..}},,))}.|||...,..,.,}|,,,}}}.,.||||||||,|,}..|||.,.}}.((((((,...}))))))......}}}}}..}}}},||,.{||{{.|}}}}}))}},.}|||,{{|.,,|}},||},|{((({{,.{(,({,...|}|||{{{{{{{(...(((.((((,{........})))).))),,,))))).}}|{({|..)))},..,,|}...{(((((({.(((((((((...(((((....)))))...))))))))).,.................,,...{{(((..{((((.{.{{...,......,..)).).)))))))))))),,{{(({......)))}}(((((...(((....)))...))))))))))))}}))})}}}|||}.,,.......||}..}}))),,...))))).....(((((....)))))....
Forensic Context

No forensic context available.