Basic Information

Symbol
hsa_LRP1B_0020400
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-LRP1B_0338
Host gene
LRP1B
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
2:141457819-141641590 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
2:140700250-140884021 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-769.60 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -828.94 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 758.59
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((((((((.(((...((((((((((((.(((.((((.(((.(((((..(((......)))..)))))))))))).........(((((((((.((((.((((.(((...((((((((((((......(((((((((((.............)))..))))))))......(((((((((((......))).))).(((........)))((((((.........(((((....(((((((.((((((..((.........)).)))))).)))))))....))))).......)).))))..))))).((((((....)).))))...))).)))))))))..........((((......))))..))))))))))).)))))))))...(((((.(((.......))).)))))......(((.(((((((.......(((((((..((((((....((((.....)))))))))).....(((((((..(((....))).....)))))))...(((((......((((((((...((((......((((((.......(((((((((.((((((...))))))........(((((...........(((.((((((((...(((.((((....))))..((((....((.(((...((((..........))))....))).)).))))(((.(((((......((((((((...(((((......)))))..(((.(((((..((((...))))...)))))))).....(((((....)))))..((((((.......)))))).......)))))))).))))).)))(((((((((((((((((.((((...((.....))...)))))))).((((..((((((...(((...................))).))))))..))))...((((........))))....(((.(((((....)))))..))))))))))).))))).)))..)))))))).)))...........)))))......(((........)))..((((......))))(((((((....(((((..((((...((............))..))))..)))))....))))))).......(((((.((((.....))))))))).((...(((((...(((((.((((((...........((.......))..(((((((...))))))).((((((((((.(((((((..(((((((((.(((.....))))).)))))))((((.((((((...(((..(((.....(((((((.(((.....))).)).)))))..(((((((.(((((((..................(((((...((((..(((((((((........))))))))).....((...((((..((((((((((.......((((((.((((.((......))((((((((((.(((((......))))))))....(((((........))))).......((...))..(((((......))))).........)))))))....))))...))))))..(((....(((..(((((((....))))).))...))))))((((((.(((((((..(((.(.((((((.((((.((((((.(((.(((((.((.((((((..(((((..........(((((....))))))))))..))).))).)).))))).))).))))))......((....((((((..((((((((....))))))))....))))))..))........)))))))))).).))).......(((((...)))))............)))))..)).))))))....))..)))).))))..)))))).)))).)))))))))))).))))))))))..)))...)))))).)))).......((((((.....))))))..)))).))))))))))))).))))))))))).)))))...))..((((((......))))))..)))))))))((((((.(((....))).)))))).))))))...))))..)))))))))))))....(((.((..((((((((.......))))))))..)).))))))))))...)))))))...))))))))))).)))))))..........))).))))))((((((...))))))...((((...((.....))...))))..((((((((((.(((.(...(((((((.((..((((.(((((((((..(((((((((((..((.((((.(((.....(((..((((((((((((.(.(........)).)))))))).....))))..))).....))).)))).))..))))..))))))).(((((((((((.(((((.....)))))............(((..((((.(((.....((((.(((((.......))))).)))).(((...)))...))).))))..))).(((...)))..((((((((...(((.((((...........)))).)))...))))).)))((((.........))))............(((((((((...(((((....)))))...)))))))))..............))))).....))))))........))))))))).))))..))..((((......))))((((((......)))))).......))))))).)))).)))))).)))).....))))(((.((....(((..(((....)))....(((......)))....)))....)).)))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((((..,(((((((.(((((((((((((((.(((((,{(((.(((((..(((......)))..)))))))))))).........(((((((((.(((,,((({{(((...((((((((((((...{{,(((((((((({,,.......,,..}))..)))))))),,....{((((((((((...,,,))).}||{{{{...,,...}}}|{{{|{{.,,,....(((((....{((((((.(((({...{{,,.......)),}))))).))))))}....))))).......,..},,..,))))).{{((((....)).))),...))).)))))))))..........((((......))))..))))))))))).)))))))))...(((((.(((.......))).)))))..{{{{....,,..}}}}...(((((.(((((.....((((({.{......(((((((...{{...((((.(.((((((.((,........,{||||,...,,,.....)))})|{((,.({{((,{.{((({.,..........,.})))),}.)}|}}|.}}}},,||,...,,.,,)))))))))))..}}..)))))))......}})))))....))))).))))).)).))))).)))}((((..........)))).,(((((((((((((.(((((((((((,{.((((((((...(((((......)))))..(((.{{(((,.(((....}))).,,})))}))).}...,((((....))))|{.((((((.......)))))).},....)))))))).}(((((((((.(((((((.((((((,..{(((((((.{(...(((((((((.((((((...({((({...{{(,,,,...............||}.}}}}}}..{{,,,.,{{{{||...||..}))}...))))),....,}},}...})))))))))).))||{{{{|{{({{(((((.((...}).}))}}..,))))..}))))}|,.,{{{{{.,....,{||}}}}..,||}(((((((....(((((..((((...((............))..))))..)))))....))))))).,,.,,,(((((.((((.....))))))))).{(,{((.............||||,....,,}}.}).))))))))..}..(((((((...)))))))........(((..(((((({....|))))))..)))....|||..,,,,))).))))))))))))).))..........)))))))..,,.(((((((((....,,.....,..{{...,..............,,.......(((.(((..((..(((((((((........)))))))))..)).......((((((...))))))...))).})).........{{......}})))))))))...||{,......,}})))))....(((((.{,...}}))))).......)))).))))))))))},)))))))),,))...))))))).)))))(.((((((((((({.((..,.(((((.,{.,({{((((((,{,,{.(({(((,((,({.,,.{(({{{...{{{,(.({((((,((((.,((((({(((.{{{||||..{||||{.|{{{{|,|,.{{..{({{{{{....})))}))),),.,))}}}}.,|||||,{{{((,(({{||..,,||{{,,,|{{{({(({(((((({{....|}|||||||,,,.||}|||,{{.|{|.||{|}||}}||||||,|||..........(((.(((((....,{,{{....((((,{,{{.....)).)).)))}.(((((((((({{((.,.,{,....,||(((,{{{{(....))}}}}}}{(({{.{(((.((((((((((({((((((.....))))))..})))},.))))}})).)))).)))))..,,.}))))))))}))((({{{..,,,.))))),))))).)))..((((({.(((....))).})))))......|||||}...,,.)))))))),,,..})),)),}}))..,)..))))),,.}||||||,||{{{,|||||||,||..{{{,{{({,|{|||,|,{||,|{}..,,}))))}.......,{((.((,{(((((...)))))))))))|{,{,{{|,,.|||.||}|||...{{||{|||,||||,..}}}|}}|)}.||,,{{{{,||{||{|||..(((({((((((,.((,((((,{((..,({(({..((((((((((((.(.(........)).)))))))),...{||}}..}},.})..))).)}}}.}}..}}}}..}}}}}}}.{{(((({{,{{,..{{{...,,.((((((,...,)))))).,...,,,.,....||,{|||.|||{{}|.}}}})))),.}}))||||,,|}))|.})})}))||,.|((.(({...)))))||||,{,{.,,|||,{|||}|,,......})))).}})}}}))))).))}|{{,.,)))}}.})))).,,}},}}}}..(((((((((...(((((....)))))...))))))))).,............,,,})},,..}}}))),,,}}},.})))}}))}.))))..)}.,{|{{.{{{,,|,)}|,{|||,.....}}},|{{{{{...|||....}))...)))))}..||||,,...))}}|||}...,...}}}|||,,..,,),,,,|||},.}}})))}.........))))).)
Forensic Context

No forensic context available.