Basic Information

Symbol
hsa_LRP1B_0035800
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-LRP1B_0336
Host gene
LRP1B
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
2:141747101-141819842 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
2:140989532-141062273 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-480.40 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -514.14 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 478.08
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
..........((((((((...(((.(((((((((...(((((.(((((((........((......))((((((......))).))).......((((((((.......((((((....(((((((.(((......))).))))))).........(((((.....((((.(((.(((..((((..........)))).)))))).))))))))).(((((((((((..(((....)))...))))).))))))..(((..((((((((((.....(((((((........((((.....)))).......((((((((..(((...)))))))))))......((((......((((.....)))).....))))..................)))))))....)))))))))))))..(((....))).))))))..)))))))).))))))).)))))(((.((((........((((((..((((((..((((.((((.(((...((((...))))...))).)))).))))...)))..)))..))))))(((((((((((.((((........)))).))).....))))))))...((((.....))))...)))).)))..((..(((((((((((....(((((....(((((.(((.(((..(((((.....)))).......((((((((((((((......((((((....)))))).)))))).)).))))))..........(((...((((......)))).))))..))).))))))))(((((.(.(((...((((((....))))))...))).).))))).((((((((..((.....))..))))))))((((......)))).(((((((((....))))))....)))(((((......))))))))))....)))))).)))))..))...(((((((((((....(((((.((((((((...........(.(.(((((((..((((...((((((.((((((((......)))))...)))...))))))...))))....))))))).).)....(((((((((((......((((((((...........))))))))..((((((.(((..(((((.....)))))..))))))))).(((((.(............).)))))..)))))))))))..)))))))).))))))))))((((((.(((((((.((......)).)))))))....))))))....)))))).(((((....)))))..))))))))).)))(((..((......))..))).((((((..(((......))).)).))))..((((((((((((.(((.((.((.(........).)).))))).)).))))))).)))(((.((((((((....(((((((((.((((.(((...(((........))).....))).))))..)))))))))..)))))).)))))....(((((...........((((..(((((((.(((....(((..(((((..........)))))....)))....))).))).))))..))))..........)))))..))))))))..((((((.(((((((((((((...(((((((....((......))....)))).)))....)).)))))))..))))))))))......(((((.(((...(((...((....)).)))..))).)))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
,,,.....,,{{{,{((,{{,(((.{((((({{(..{(((((.(((((((...{(,,({(,.,...||,..|,.}|....}}.}))),......((((((((.......((((((....(((((((.(((......))).))))))).,,,{{...((((({....{(((.(((.(((..((((..........)))).)))))).))))))})).(((((((((((..(((....}})...))))).)))))).,||||.{(({((((((.....(((((((........{{{{,,..,}}}}...,.,.((((((((..(({...}))))))))))......{((({..,..((((,...,))}},,,,.}}},.......,,,........)))))))....))))))})))}}}..{{{....))}.)))))),.)))))))).))))))).)))))}{{,({{(........((((((..((((((..((((.((((.(((,{.((({...})))},.))).)))).))))...)))..}))..))))))(((((((((({.((((........)))).})).....))))))))...((((.....))))...)))).,|{,(((((,(({{{{{{{({..,(((((,...{,((({(((.,,,,..{(((.....}}},.,.....((((((((((((((...,,,(((({(..,.}}}))).|)))}}}}}.))))))}}}|.},}.,.,...,||{{......)}},.}}})}}},}}}}}}..})}})),}}}}}|{{{(((((.{..{{{|||||,.||||.,}},,..((((((((..{,.....}}..))))))))((((......)))){((,((((((....))))))...}))|(((((......)))))))}))))}}}))),,),)}))))))...{|||{|||||||||,(((((.((((((((...........,.{.(((((((..((((...{(((({.((({((((,,,...,)))).,})))...}))))}...))))....))))))).).,....(((((((((((...{{,(((({{{(..,........|}}|||||..((((((.(((..(((((.....)))))..))))))))).{||||,,..,,..,,)}....)))))}})))))))))))..)))))))).))))),}|}|||||..}}})))|||||{((({({{(({{..|||||,,,}))},,.{{{{......|}},..,||.((({(({|,|||,.{{|{(((,,{{{,{.....,,|,.,,}}})}}}}}}....}))..,.....,{{(({{{(((((((.(((.((.((.(........).)).))))).)).))))))),))}(((.((((((((....{((((((({.((((.(({.,..(((.{,...}).)))..,))).))))..,)))))))}..)))))).)))))..}})))}}}...}}}..,{((((..((({{{{,(({....{((..((({{...,...,..}))))....)))..,,))).))).}})),.}}}}.|({{{{{.,{{|,|{..|||,,..}}|,,||..||||,|||,|||,.,}|||||||.....,.}}},,)),.,,|}||{}||{{|,||.}}|||||{{},,,}))))),,.,..|||{|}|||},.|||.,}||.,}}))})))..}}}.}})))
Forensic Context

No forensic context available.