Basic Information

Symbol
hsa_LRP1B_0042600
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-LRP1B_0342
Host gene
LRP1B
Type of circRNA
Intron-Intron
Location (GRCh37)
2:142488156-142489036 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
2:141730587-141731467 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-220.50 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -238.37 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 231.39
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((...))))(((..........(((((........))))).....(.(((((((((((.((((.....(((((((((....((((..((((((((((((.....((((...((((...(((....(((((((((((....((.(((((((.(((.(((((....))))).))).))))..(((((.(((...))).)))))........))).)).)))))).)))))...)))........((((((((......)))))))).........(((((((.((((((........................(((((((........)))))))..)))))).)))))))...))))...))))))))))))))))....))))......)))..)))))))))).)).)))))))))).....(((..((((((((.(((((....)))(((......)))......(((....))).....((((((((((.(((...((.....)).))).))))))))))(((((((((....(((((..(.((((....)))))..)))))))))))))).(((((....)))))(((...)))........((((.......))))..((((((........)))))).)))))))))).)))(((((......)))))..(((((((((((.(((...(((((((....((((((..((((....))))..))))))....))).)))).....)))..))).....)).)))))).......(((((....))))).....................((((((...((((((((..((((((...))))))....)))).)))).....))))))....)))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((({...})))(((..,,,,...,{,,,,.....,..,.,})},...{.((((((((({{.((((.....(((((((((....((((.,((((((((((((,....(({{...{||{...(((....((({{((((((...,{{.((({({({(({.{{||},,..,,}},.,,}.}}},..(((((.(((...))).))))),,...}},))).)).)))))).)))))...)))........{(((((((......)))))))}.........(((((((.((((((.........,,.{,,{{.,,,...(((,,,,,}}}},.}))))}}},.)))))).)))))))...,}}}...}))))))))))))))).,..))))....,.)))..)))))))))).}).))))))))),.....{{{..(((((({{.{{{{,....))),|,.{{{{.........}))}.,,.{{((((((..,,..((((((({,(((,..{((((.,,.,((|{{....,(((((((((....(((((..(.((({....}))))..)))))))))))))).(((((....)))))(((...)))........},||,,,}.}}))),..)}}))))))))...,..)))))))))))))).}})(({{{..,..,|}|}}..(((((({{(((.(((,..(((((((....((((((..((((....)))),.))))))....))).)))).....)))..))),....,,.)))))).......(((((....)))))...,,,.,......,{{{,..,{{||||,.{((({(({..((((((...))))))...,})},.)))).,,..}}))))....)))
Forensic Context

No forensic context available.