Basic Information

Symbol
hsa_LRP6_0005600
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-LRP6_0122
Host gene
LRP6
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
12:12291259-12318229 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
12:12138325-12165295 UCSC (hg38)
External Database
circbank

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-606.00 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -649.11 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 663.72
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((.......))((....((((((..........))))))((((......(((((........((((((((((..(((((((.(((.((((((.((((((..((..(((.(......).)))..)))))))))))))).)))(((((((((.(..(((((...)))))..).)))..((....))(((....))).........((((...)))).(((((.((.(((((((..........))))))).)).))))).))))))........(((((((..(.(((((((((.((((((....((((((.....(((((((((...(((...(((((((((.(((((((..((((((((((((((...)))))))))....))..)))..)))))))............)))))))))...)))...))))))))).....))))))((((((.(((.((((((.(((((((....((((.....)))).))).....)))))))))))))..))))))(((.........)))(((((((((((..((.((((........)).)).))..)))))....((.(.(((....))).).)).........)))))))))))).)))))...))))..)..)))))))......(((((.((.....)))))))......((((((((...(((.......))).(((.(((...(((((((..((.((((.((....((((..(((((((((...((((.....))))..........((((((...((((((........))).)))...))))))(((..((.((((.(.....).)))).))..))).(((.(((((((((((((.....((..((....))..)).................(((....((((..((((((....)).))))..))))..)))...)))...)))))))))).))).))))).))))...))))....))...))).).))..)))))))))).)))...(.((((.(.......))))))....))))))))..((((.((((...(((((((..((((.((((......)))).))))...(((((((.((((((((((.......((((..(((....))))))).....)))))).((((..((((((((((((.(((((((((((.((((..((...))))))..(.(((((...(((((...(((((.((((((.....))))))...)))))....)))))...))))).).((((((.(((...))).))))))...)))))))))))...........(((((((((((((((...(..((((((((.(((.....))).)))...)))))..).((((....(((((((((((((((...((((((.((....(((.((......))...)))..))..))).))).)))))))).))))))).))))(((...)))(((((((((((((...(((.((((...........((((.(((((.((((((((.(((.(....(((....((((((....))))))....)))..).))).)))).)))))))))))))...(((..(.(((.....))))..))))))).)))............)))))...))))))))..((((.((.((((......)))))).))))...))))))...)))))))))((((((((..((((((.....((((.((((.((((((.....)))))).)))).))))..(((((((..(((((.....(((((((((...(((((.(..((.........)).).))))).))))((((((......))))))........)))))...))))))))))))))))))..)))).))))..)))))))................)))))))))...((((.....))))....))))..)))))))((......))..))))))))))))))).)))))))..))))).)))))........)))))......)))).......))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((,.,...{||((,,{{{(((((,...{,{{,.}}|||{((((,{....|(((({{{,{,..{{({{{{(((,,(((((((({((,((((({,(({{({..{{..|||,|||,,,}),))}..}}}))))}}}}}}}.}|}{((((((((,{,,(((((...))))).,).)))..,|}}.,|((((....)))}.,....|,{{{{,,.||||,(((((.((.(((((((..,.......))))))).)).})))}})})}}}}|,{{{{{((((((({{({,,(((,((({{(((((..,,(((((({,.,.({((((({{...{,,..{(((,,((({{(((((({{(((((.{((((((((,.|||||}}.{,........},,,})))))))}}}}},,.....,,,,}||||...,})}},}|||||,||{{,.,||}|||((((((.(((.((((((.((((,{,.,,.((((.....)))).,)).....)))))))))))))..))))))||{}}}.},,.,),)||||,.(((((..{(.{(((.,....,.))},}.}}..))))).,{{(,.(.{,,....)}}})}}}|}}}}..}},,,.)))))))).,,)))}..,,,,....,))))})},)}}}}}}||},|}}})}})}}|{{..,{{{||((|,{{{...,{|}.,.,..||}}}||}|||.,.|||{{||.}||}|,,,.}||.|}||||..{((({((({.{{((((.....,))},...,||.{,,.{{{|{,.,{,,{({,{{{{,..,},}},}},}}||}}||...,||||||{{,,...},})))..,{{{{{{(((.(((((((((((((..,.,{(,.,{....||,.,,}}}.,.....,|,....,|.....,{{|,|{{{{{,.,,.,}|{|||{{,,,,.})))}},))),..}))))))))).))).))))),||||{{{...))))..)}}.|||.,.}}.,)))}})),}}.,,},}}||{|||||,.,.{{{{||||{......,,.,,..,,,,,.,}}))),}}}),,},)))}}.))}|,,....))))}))))|,.(((((((.((((((((((...,...((((..(((....)))))))...,.)))))).{(({..((((((((((((.(((((((((((.((((..{{...}})))),{({((,((...(((((..,(((((.((((((.....))))))...))))).,..))))).,.,))))}).((((((.(((...))).))))))...))))))))))).......,{..(((((((((,,(((((((({.((((((((.(((.....))).)))...)))))..|,,.{(...,||{|||,|{{{,{,{....,.,|,}}|},,,)}|.........,|({{{{{.,||{{||,{,||{||||||||.|||||.|.||||{|.,..,|{({{{{{{{{{{{{.,,|{{,|{|{,,,,,..,||,||{||{((((.(({{{{{{.{{{,||,,,|{{....((((((....))))))....}}}.||,|||,|}}}|||||}}}}}}}}}.,.(((..(.(((.....))))..))),}}}.)}}..,,{{......}))))...)}}}}}}}.}||,,,||}||{{..,,,,)))),..,}}}...,)))))},.))))))))).,},.(,((((((((({{...((((.((((.((((((.....)))))).)))).)))).,|.|||(((((,,(((((....))))),.}}}||}||}}}.|,...{{{{,.(((((((((((.(((((((.....{({{{,,....,....,},...}}))},))}})))).)))).))))))).}))},.})))))){{,,,,,....,,,..))))))))}...{,{{.....}}}}....))))..)))))))||}}.,,,))..})))}}}))}}},.}}))))))),,))))}.})))),,},|||.}||}),||...}}}}.....,.))
Forensic Context

No forensic context available.