Basic Information

Symbol
hsa_MACF1_0020400
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0011798 hsa_circMACF1_037
Host gene
MACF1
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
1:39761459-39793025 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
1:39295787-39327353 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-700.70 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -747.85 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 635.34
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((...))).(((((((((((....((((....(((((((.(.((((...(((.((((((((((((..(((........)))))))))).(((((((((((..(((...))))))))))))))....(((((((....)).)))))(((........)))...((((((((.......(((((((((..(((((((.((.((.((((...)))).)).)).)).))....)))..))))....((((((((((((((....(((..((((((((((.(((........))).))))))....(((((....(((.......(((((....))))).((((((((...((((((((((....)))))))).))..((((((((((((..............((.((((((((.....)))).)))).)))))))....)))))))..(((....)))...(((((..(((((.(((((((.(((((((((((((......(((((..((..(((.....((((.((((.((((((((((..(((....)))..))).)))))))))))))))(((((((((((....((((.((......)).))))......((((((.(((...((((((((........((((...))))....(((..(((((((........(((.(((((.(((.....)))....(((((((((..........((((.(((...))).))))((..((((((.((((((((.((((((.((((...(.(((.......((((((((..((((...))))))))))))))).).))))..)).)))).)))))).)).))..))))...)).((((((..(((((...(((((....))))).))))).))))))))))))))).........(((((.(((..........))).))))).....(((((.(..(((.(((......))).)))..)...(((........))))))))..).)))).)))..)))))))...)))....)))))))).)))..)))))).........)))))).))))).(((((((((((.....((.(((((.(((((.........)))))..)))))))....)))))))))))(((.(((((((....))))))).)))(((((....((.....))......)))))..(((((((.....))))))).(((..((((....((((((.(..((.(((......))).))..)))))))...))))...))).((((.((...)).))))..))))))))))((.((((((((((....)))..)))))))))(((((.(((((.....)))))..)))))))))))))))..(((((..((....))..)))))..(((((((.((((((((...(((((((....(((((((..(((((.((..........)))))))........((.(((.((((.....)))).)))))(((((.(((((....)))))))))).......)))))))..))))))).......((..(((((((.(((..((.(((((((((((.((....)).)))))..((....))...))))))))))))).)))))...))...((.((((((((...))))).))).))...))))))))..))))))).....((((.(....((((......)))).....).))))......(((..((((((......))))))...))).........)))))))))).))).))..)))))((((....)))))))))))).....((((.(((....))).)))).(((((((((((((((((((((......((((((..(((((((..((((((........))))))))))).......))..)))))).......)))))).......))))))).)))))))))))....)))))............(((......))).)))).)))....)))))))))))))))))))........)).))))))))))))))...)))).).)))))))...........((((......))))...))))...)))).)))))))((((((((.(..((((((((..................((((((((((.......(((((((((.(((..((((((....)))))).)))..((((((...................)))))).........(((........)))...........)))))))))(((..((......))...)))))))))))))...))))))))..).)))))))).....
Thermodynamic Ensemble Prediction
{{,...,}}.(((((((((((....((((....(((((((.(.((((...(((((((({(((((((..(,{........)),))))))}.,((((((((((..(((...)))))))))))))}....((((({(,...}},,)))},||,.......,,....,{((((((.......(((((((((..(((((((.((.((.((((...)))).)).)).)).))....)))..))))....((((((((((((((....(((..((((((((((.(((........}}}.|||}}}....{{(((,,{,((({({....(((((....))))).,,,||||,...||||||((((,...}}}|||}|{||,.,,{{,(((((((..............((.((((((((.....)))).)))).))))}))))..,.))))).,}|{|,,,|}}...{((((..{{(((.(((((((.(((((((((((((......{{.....||,,{{,,..{{(((,(((((.((((((((((..(((....}))..))).)))))))}))||}||{((({{{{{{{....{{{,.{{,..,.,}|,,|||,...,,(({(((.,{(,,,(((((({{{,.,,,.,((((...|}}}....(((,.(((((((....,{.,(({.(((({.(((.....))}.,..(((((((((.,.....,..((({.(({...))}.||||,{..((((((.((((((((.((((((.((({{,{,{,{,.}.,,},(({({(((,,(({,...,}))}})))))))}).},)))).,}).)))).)))))).)).)),.})))..}}},((((((..(((((...(((((....))))).))))).))))))))))))))).,,.....,{{{({,(({{|....,...|||,||}||,(,,,{{{||.|,.|||.|||,,..,,)))}}}},.|..{(((........))))..}}..,.)))).))).,)))))))...)))...,})))))}}.}))..}))))),}}|},.},}}})}},}}})}|(((((((((((.....{{,(((((.(((((.........)))))..))))))}....))))))))))){((.(((((((....))))))).))}(((((.,,.((.....)).,,...))))),|||||||{.....))))}}}.}}|}|||))},|,{{{{||||,.||}|||,}}|},,,|{|||{|}},},,...,||...,))}}}..,}}})}})))}.||,.{(((....)))}.,||((((({(,,,,}}}.,)))})))},(((((.|(((|.,...}}}))..))))))))))))))).,(((((..((....))..))))),.(((((((.((((((((.,.((((({{....|||||{,..(((((.{{..........}}))))).,{,,,,.((.(((.((((.....)))).)))))(((((.(((((....))))))))))....,,.}||||||..}}))))).......((..(((((((.(((..{{.(((((((((((.((....}).))))).,({....))...))))))}})))))}}))))...)).,.{{.{{{{||||,,.}))))}))).}}..,)))))))).,,)))))).....((((.{....((((......)))}.,...).)))}..,,,,|{{,.((((({......})))))...)))....,....)))))))))).))).))..)))))||||,..,))))}}}},..,.,.}}|(((.(({....))).)))|{(((((((((((((((((((((...{{{(((,({..,,{|,||}}||{{{,,,,,,{..||||}},}},,....,..}),.))))},.....,.)))))),......})))))))))))))))))}....)))))...,.,,,,...,{,......})),)))).)))....)))))))))))))))))))........)).))))))))))}}))...)))).).))))))}...........((({......}))}...})))...)))),,))))))((((((((.{..((((((((................{.((((((((((.......(((((((((.,,{..((((((....)))))).,}|,{((({{,....,,,............)))}}|{........{{(........)))...,,,,,|,.}))))))))||,..({......)}...,)})))))))))),,.))))))))..}.)))))))).....
Forensic Context

No forensic context available.