Basic Information

Symbol
hsa_MACF1_0052400
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0011838 hsa_circMACF1_114
Host gene
MACF1
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
1:39889700-39896580 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
1:39424028-39430908 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-368.40 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -391.67 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 387.05
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((..(((((((((((((((((((((...(((((((((......(.((((.....)))).)(((......)))((((((((...)))))))).(((.(((....((.((((((((.(((.(((((..((((........(((((.....)))))..(((....)))((((.....((((((.......((.(((..(((......)))..))).))..)))))).)))).)))).))))).))).))))).))).)).....))).))).........))).)))).))....((((.........))))..))))))..(((((..((((((((.................(((((......(((((.((((.((((......((((((.((((((((((((((.......(((((((....((((...(((((......))))))))).))))))).(((((((((((...........))))).)))))).((((((((......(((........)))........)))))))))))))))).)))).))...)))))))))).))))(((((.(((....))).)))))..............(((((.((......)).))))))))))....))))).(((((.(((..((((((............(((((((...((..........))...)))))))...((((..(((((((((...((...((.(((((((.(((....((((.(((.((......)).)))))))......))).))))...(((......))).((((((((..(((.(((.........)))...))).)).))))))(((((.((((((..((.......)))))))).....)))))))).))...))...)))))))))....))))((((.(((...))).)))).((((........)))).(((((....)))))........)))))).))).))))).(((((((.((((.((.(((..((...))..))).)).))))))))))).)))))))).))))))))).)))))........))))))..))((((((..(..((......((((((........((((((..(((((((........))))).))..))))))))))))...))..)..))))..))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((.(((((.(((({{{.({,,.||....||||...,,.....{{((((.....}}}}.,(((......)))((((((((...))))))))...,.{{.....}}.)))}}|||(((..{.(((((({{,,,,,....(((((.....)))))..((({{,,|||(({,.....{,||||,..,,{,{||((|,{{{(((({{{((((((..((((..(((.((((.,.(((((({(.........))).,}))))....)))))))..))))))),})))))))...,,||{{|||........|||{({,{{(,,,,,((({..(({((((,.......,.,,},...||.|||..,.,,},))),,{{|,|||||,...{((((((.((((((((((((((,......(((((({....((((..,(((((......))))))))).))))))).(((((((((((...........)))))},))))).{(((((((,{{,..(((........)))....}.,})))))))))))))))).)))).)},..))))))),))|}}}||||{{.{((,,..}}}.)))))||||||{{((....,||||.{{...,,}))})))||{{,|.,||}}}.|}}||{|{.{((||(({{,,.........{{.{({{{{{..,((,{,...,.,,||,..}}}}},,..,)}||}|,||||||||...,,...,,...,((((.(((.,..((({,(((.((......)).)))))))......))).)))).,.{{{....{{|||.{(.,(((((.,,((((({,........,,,..{((({{{{|||{{{{,||,{(({{(,,{{..,....}.)))}))).)}})))}})))})))...)}}}),}))))))},...,,.(((({({....}))})))).((((........)))).(((((....)))))........,}}}}}.))),)})),}}})))},.,}|||||||{{|||||{{{...|,,,.|.|||{}|{|||||||||,||,.,,))}}}})}})))|.....,.}))).}....}|||}|||}|||||}},,,,{{{(((,,...,,.||{{||..{{{||||..,,....))))).)),.,))),))))))).}}},,,)}}..,..)))
Forensic Context

No forensic context available.