Basic Information

Symbol
hsa_MACF1_0002900
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-MACF1_0396
Host gene
MACF1
Type of circRNA
Intron-Intron
Location (GRCh37)
1:39585577-39586930 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
1:39119905-39121258 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-364.10 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -391.54 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 363.33
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((...)))(((((((.(((((....(((.((((....))))..))).(((((.(((((...((((..((((((...............((((.((((....))))))))))))))...))))..)))))....(((((((..(((((((((((((((..((.(((((((((..((.((.....(((.(((..(((.....)))))).)))...)).))..).)))))))).))....)))))))).)))))))))))))))))))......))))).))))).(((..(((((((((((((((((..((((((...)))))).........((((((((.....(((((((((((....................((((((......))))))(((((((((......(((((((..((((((...))))))...............(((....))).))))..))).....((((((((((((...))))))))))))..)))).)))))((((((((.((.......)))))))))).....((((((((((((((.(((((...(((((((((........)))..)).))))...((((((((......))))))))(((((..........)))))...(((((((...(((((.((((((..((((((((.(((..........))).)))))))).)))((((((((((((....)))))).....((((((......)))))).))))))....(((((.....((((((((....))))))))...))))).((((((.((..((((.....(((((.((((((....(((((((((((((((((.(((.(((((((.(((.((((.((((.....)))).)))).)))...))..)))))))).))))))))).)))).))))...))).))))))))............(((((((((.......)))))))))..))))..))))))))...((((((((((......))).))))))).........(((((....))))).))).)).)))....))))))).((((....))))....))))).........((((.((((.......)))).)))))))).))))))))))..........)))))))))))....)))))))).....................))))))).....))))))))))..)))....((.(((....))).))........(((.((((...(((((((..(((((.((((......))))))))).........((((........))))..)))))))...)))).))).....))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((...)))(((((((.(((((....(((.((((....))))..))).(((({.(((((...((((..((((((,,....,,|......((({{((((....))))))))))))))...))))..)))))...,(((((((..((((((,((((((((.,({.(((((((({..((.((.....{{{,(({,.({{.....,),})}.))).,,}}.)}..).)))))))).}},,..)))))))).})))))}))))))))))))......))))).))))),(((..((((((((((.,{{,{{,.((((((...)))))).,,..,...((((((((.....((((((((((({{.......,,.,{{{.....||||,,,....}}},}|(((((((((......(({{{,{,.{(((((...}))))}..........,...,|||,,..}},.)))}..}}}.....((((((((((((...))))))))))))..)))).)))))|(((((((.({.......))}))))))}.....((((((((((({(({{(({{,.,(({((((((,,,.....}})..)},)))}...((((((((......)))))))){{{{{..,,,,,,..}}}}}.,|{({{(((,,,{{{{,{(((((((.((((((((.(((..........))).)))))))).||..{{||.((((({....}))))).....((((((......)))))).)))))))}.,|,|||,.....,,((((({{{{..,,))))}}})),||{(((((({{,..{{{{}|||||||||,||||||.,,,{{{(((({{{{{(((((,(((,{(((((,.,,,.{(((||{{{,....}}||{|||,.|}}.,,,},.|||},,,,.}}})))))}.}})),,}}}.,,||}.}},||||,...,,,,....,|{(((((((.......))))))))),.)))),,.,)))))),..((((((((((......))),}))))))........,(((((....}))))},..,))}))),,,.}}}})))}{(((,...)))}....,}}}}|.|||||,.{{{{.((((.......)))).})}))))),)))))))))}.........})))))))))))....))))))))......,,,,,..{(({...}))).}))},...))))))))))..)))..,{(({(({....|,..,,,.}}.,}}|||.((({...(((((({..(((((.((((......)))))))))....,....((({........)))}..}))))))...)))}.}}}.....})
Forensic Context

No forensic context available.