Basic Information

Symbol
hsa_MACF1_0006200
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-MACF1_0398
Host gene
MACF1
Type of circRNA
Intron-Intron
Location (GRCh37)
1:39663774-39664570 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
1:39198102-39198898 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-282.20 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -296.43 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 171.40
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((.....))))(((..((((((((((.(.((((((((.(.....((..(((((((((((..((((((((((.((...((((((..((((((((((.....(((((..........)))))..(((((((((......))))).))))......(((...(((((((...)))))))...)))....((((((....((((((((((....(((((.....)).)))....)))))))))).................((((((((.((..((((((((.(.((.(((.((((...((((((....))))))((..((((((((.(..((((.((((.(((.(((...)))...))).)))....).))))..)))))))))..))..................)))).))))).)..))))))))..))))))))))))))))....))))))))).)..))))))..))))).(((((((((..(((((((.((((....)).)))))))))(((..((((.(....))).))..))).....))))))))).....................))))))).)))))))))))))))))))))).))))))))))).....((((((((.((..((((((...((.(((.....((((.(((((.(((......))).))))).))))...))).)).....))))))..))))))))))............((((((((((.(((((.(((.............))).)))))...)))))))))).....)))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((.....))))(((..((((((((({{(.((((((((.(.,...,,..(((((((((((..((((((((((.((.(,((((((..{(((((((({.....{({((.,.......,}}}}},,(((((((((......))))).))))....,{(((...{{{||||,,,||||||}.,.}}}.||.||||,{|||.((((((((((....((({{,....)).)))....)))))))))).................{(((((((.,{||{(((((((.|.{(,(((.(({{...((((({....})))))((,.((((((((.,.{((((,,(((.(((.(({...}))...))).)))..,})})),,..)))))))))..}}...............,}|)))).))))).|,.))))))))},..)))))))}||}}|,.,.}))))))))).}..)))))),.})))}.(((((((((..(((((((.((((....)).)))))))))|{|..(({{.|||..}}}.)).,)}),....))))))))).....................))))))).))))))))))))}))))))))).)))))))))))....,((((((({{((..((((((...,({(((....,((({.(((((.(((......))).))))),)))}...))).)).....))))))..)))))))))}............((((((((((.(((((.(((.............})).)))))...))))))))))....,)))
Forensic Context

No forensic context available.