Basic Information
Symbol
hsa_MACF1_0008100
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-MACF1_0283
Host gene
MACF1
Type of circRNA
Intron-Intron
Location (GRCh37)
1:39704889-39706206
UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
1:39239217-39240534
UCSC (hg38)
External Database
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-351.80 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-376.11 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
277.76
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((.....((((.((..((((....))))))))))....)))))((((.((((((((((((.((((((.........................((((..(((((((((((((.((.(((((((..(((....)))..)(((..(((((((...)))))))..)))......)))))).)).(((((........)))))..........(((......))).((((((((..(((((((((....)))))).............((((((((((((((...((((.((((((((((((....))))).......(((((((.........))))))).......(((....))).....))))))).)))).))))))..........(((..((((((((((((((...)))....(((((((.(((((((((.(((..((((....))))..))).))))).)))).....)))))))..((((.(..(((((.((((((.(........).))))))..)))))..).))))......)))))).)))))..))).............((((....))))....((((((...))))))..(((((.(((.....))).))))).....(((((((..(.(((((((.(((((((....((..........................((((.(.(((((((((..(((((((........))))))).((((.((((((((((.(((((..((((((((((((((((((((..((((.........)))).)))))).)))).....(((....))).(((....)))........................)))))))))).)))))..))))))))))))))....((((..((((((...((((((..((((..((..((((((....).)))))..))..))))(((........))).(((.....((((.......)))).....))))))))))))))).))))))))))))).))))))).....))))))).)))).))).)..)))))))))))))))..))).))))))))((((...(((((......))))).....)))).)))))))))).))).))))..(((((((((...(((((((..........)))))))......)))))))))...((((((........((((((((((...((...(((........)))..)))))))))).)).))))))....(((((((((((...))))).)))))))))))).)))))))))))).))).)
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((((.....((((.((..((((....))))))))))....)))))((((.((((((((((((.(((({,.........................{{((..(((((((((((((.{..{{{(({,,.,,,,....}|||}(((..(((((((...)))))))..))),,|,..}})))}{{{{((,,(((,.{{{{||,||{...{{{,..,,({{{{{,,||((,{((({{.,{{{((((((....)))))).,,,..}}|,...,(((((((((,{{,...{{{{.,|||||{{|||,..,.|}},,.}}}...(((((((.,.....,.))))))).......{((....))),,,,}))),)))}))),.,,}}},.,,}},....|||..||||||,||||||}}}}.{{{{{,{{|||{{.(((((((((.(((..((((....))))..))).))))).)))),,,,,,.||}}}}}|(((.{..(((((.((((((.,.,......),))))))..)))))..},)))),.....,|||||,|||}}.|||{.{{{{{{{(.....,{,....||||{{{{((((((...)))))}..{((((,(({....,))).})))}.....(((((((..{.(((((((.(((((((...,(,.........................,((((.(.(((((((((..(((((((........))))))).((((,((({((((((.(((((..((((((((((((((((((((.,(({,.....,,..}}}).)))})),}))}.....(({....}}}.,,,..,,))),.......................)))))))))).)))))..)))))))))))))).,{,,,,,},|(((((...(((((({.((((..((..((((({....}.)))))..))..))))(((........))),{{{.....{{{{.....,.}}}}....,},)))))))}}}}))})))}))))))))).)))))),.....))))))).)))).))).}..)))))))))))))),..)))})))),)))}|||}}}|||||{,,{,,||,,,.}}}}))))})))))))))).))).)))}..(((((((((...(((((((..........)))))))......)))))))))...((((((........({((((((((...({...(((........)))..)})))))))).)}.))))))..,{(((((((((({...))))).)))))))))))).)))))))))))).)))}}
Forensic Context
No forensic context available.