Basic Information

Symbol
hsa_MACF1_0016900
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-MACF1_0725
Host gene
MACF1
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
1:39752958-39784287 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
1:39287286-39318615 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-772.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -814.44 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 651.68
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.......(((((.(.((.(((((((.((..(((.((........(((((....))))))).)))(((..(((((.((((((((((((.((((((((((((.................((((....))))..((((....))))..........(((..((.(((((.(((.(((..(((((.......))))).......((((((.((((((((((...........((.(((((.((((((((.....(((((......))))).....))))))))....((((((((.((......(((((......))))).(((((((..(((.(((........))).)))..)))))))((((.(((.....))).)))).....((.(((...(((((((((((((((..(((.((((((((..((((((...((((...)))).......)))))).)))).))))..............((((....))))(((.(((((((((((((........((((((((......))....))).))).(((((((((..((((.((((..((.(..((.(((.(((((...((((..((((((((((.......)))))).....(((((..((((((.....))))))..))))).((((((((((((((.((((((.....))))))(((((((.........)).)))))....(((.((((((((..((((((((..(((..((.((((((.(((((.(((((((..((((.(.(((((((..........))))))).).))).).....))))))))))))..(((((((.....)))))))...)))))).)).)))....).))))).))..)))))))))))))))).)).)))))))...........((((((((.....................(((((((((((..((..(.((((((..(((((...(((......))).....))))).)))))).)..))..)))).((((((.(((........))).))))))...............((((....(((((....)))))....)))))))))))(((((((....)))))))(((((......(((((((..............((.((((((((.....)))).)))).)))))))))....))))).....))))))))....((((....))))))))...))))))))).))))))))..))))..))))(((((....)))))(((.((((((((((..(((....)))..))).)))))))))))).)))))))................)))))))))...)))))))(((......))).)))..))))))))).))))))..))).)).(((((((.(.((((..(.(((((.(...((.(((((.((((..(((((...((((..(((......((((.(((...))).)))))))..))))....)))))..))))))))).))...).)))))..)..))))).))))))).....)).))).)))))......(((.....)))))))).)).......))))))).))))))))).(((((...(((((....))))).))))))))....))).)))))))...))).)))))))))...))).)))((((((.((((......))))))))))..((((..(((((((((....((((........))))..((....))...(((((((.(((((.((.....)))))))...(((((((((..(((((........((.(((((.(((((((((((.....((.(((((.(((((.........)))))..)))))))....)))))))))))(((.(((((((....))))))).)))(((((....((.....))......)))))..(((((((.....))))))).(((..((((....((((((.(..((.(((......))).))..)))))))...))))...))).(((((..((((((((((..((((....))))..(((((((((..((((............(((((.(((((.....)))))..))))).............))))..)))...)))))).))))))...))))..)))))...(((((......)))))....(((((.((..........))))))).)))))))((.(((.((((.....)))).)))))(((((.(((((....))))))))))))))))))))))))...)))))))...........))))))).))...)))).))))))))).)))))..))).(((((..((.((...........))..))..)))))..((.((((...)))).)).)).))))))).)).).)))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
,.{{.{{{(((((((((((((((((((.....((.((((((.{.(((((....))))),((((..(((((((((..(((..((..{(((((((.((((((.{((((((((.,,((((((((.,((({,,..((((....}}}|.....,..,,(((((((((..(((((((((...(((((.......))))){{(((((.((((..((((((.((((....,....{{...(((((((((((((.....(((((......))))).....)))))))).....)))))...)).,.,,,(({{{.....,))))).(((((((..(((.(((........))).)))..))))))).....)))).))))))))))))))).}}..))),})))))..))).)))))}..|.{(((((((..((((((...((((...)))).......)))))).)))).)))|,.....|},....,((((,...}))),.|}||.}}}}})))|{..,||{{{{{{{{(|{......})}.,.))).))).,,,})))),,}...))))))},.,,}..))))).),.)))))))}))..))).))))))))).....))))......(((((..((((((.....))))))..))))).((((((((((((((.((((((.....))))))(((((((.........)).)))))....(((.((((((((..((((((((..(((..((.(((((({(((({,(((((((..((((.(.(((((((..........))))))).).))).).....)))))))))))}..(((((((.....))))))).}.}))))).)).)))....}.))))).))..))))))))))})))))},).)))))))....,,.....,}}})}.)))))....)))))))))))).....))))))){{{((((((((((({.((((({....,..((((({.....,||||,.|,((.((((((((.(((((..((((.(((((....((((.((((.(((.....{{{(((.{{((((....(((((....)))))....)))),{..{{((((((((....)))))))).}},.||,,.,({(({,,..,,}}}..},.)}}}))|.{{{{,....}))),)))))))...))))....)))))...))))..)))},)..)))))))).)),,|{||{||||{(({((((({......{{.....|},,{{,,,.,,(({,{((((.((((((((((..(((....}))..))).))))))))))))}}}{((({{{{{{{....{{,,.{{,..,,,}|,,|||,,..,,(({(((.,{{,.{(((((({{{,.,,,.,((((...})}}....(((,.(((((((....,,.,({{.{{((,.(({.....))}....(((((((((.,.....,..((({.(({...))}.||||,{..((((((.((((((((.((((((.((({{,{,{,{,.}.,,},(({({(((,,(({,...,}))}})))))))}).},)))).,}).)))).)))))).)).)),.})))..}}},((((((..(((((...(((((....))))).))))).))))))))))))))).,,.....,{{{{{,|||,|.....,..|||,||}||,(,{{{{{{|,||.|||.|{{}}..,,}))}}|},.|..{(((........))))..}}..,.))}).))).,)))))))...)))...,))))))}}.})),.}))))),|}||,.},,}})}},}}})},(((((((((((.....({,(((((.(((((.........)))))..))))))}....))))))))))){((.(((((((....))))))).))}(((((.,,.((.....)).,,...))))),|{||{{|{.....)))))}}.}|||||||||,|,{{{{||||..||||||.,,,,,},|{|||{|}},},,...,||...}))}}}.,}}}})}}))}},||,.{(((....)))}.,||(((({{(,,,,}}}.,)))})))}}{{{{|.||{{|.,.,,}}))}..))))))))}})))}..,(((((..((....))..)))))}}))}}})}}.|({{{{|.,.(((((,|....)))))|,..(((((.{{..........}}))))).}}}}}}.((.(((.((((.....)))).)))))(((((.(((((....))))))))))......})))))))..))))))),.,....((..(((((((.(((..,{.(((((((((((.((....}).))))).,({....))...)))))),})))))},))))...))..,((.((((((({...)))))}))).))..))))},}
Forensic Context

No forensic context available.