Basic Information

Symbol
hsa_MACF1_0033800
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-MACF1_0224
Host gene
MACF1
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
1:39801592-39815299 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
1:39335920-39349627 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-460.90 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -489.06 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 500.75
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((...((....((((...(((((....(((.........))))))))......)))).....))...))))((((.(((..((...((..((((((.........((((..(((((((((((((((.......((((((............)))))).......)))).))).............((((.(((.((((((((......)))))))))))...)))).....(((.(.(((((((((((...(((....))).((((((....(((.((((...(((((........(((((((...(....)....))))))).....))))))))).)))...))))))....((((((.(((..(((.(((((((....)))))))...))).....)))..)))))).))))))))))).))))......(((((.((((((...(((((((((((((....)))))).)))))))(((...(((....)))...)))(((((((.....))).))))..((((......)))).)))))))))))..((((((.((((....(((((((..((((((((((.((((((....((((((......).))))).(((((....((((...((.(((........)))))(((......))).((((((.(......).)))))).(((((...(((.(.......))))...)))))...(((...(((..((((.((((..(((.....)))..))))))))..)))...)))....))))...))))))))))).)).)))))).......((((((.((((((((((((((....(((((((((((...((.((((......))))))...))).)))).))))..)))).)))...)))))))......)))))).(((((((((.(((((((((((.........))))...(((((.........(((((.(((((((((((.((((...((((.(((((.......)))))....((.(((((((.((((((((((...(((((....))))).)))).))).........((((((....(((......)))..(((((.....))))).))))))..((((.....)))).))).))))))).))((((((.((((....((((..(((.......................)))..)))))))).))))))....)))))))).))))))).)))).........(((((...)))))..)))))......)))))))))))).)))))))))..))..))))))))))))))))).))))))))))))...((((((((...((....))))))))))))))))..))(((((((((((((((.((((......((((.((((.(((((.....))))).....((((((((...((((((.((...((.((.....)))))).))))))))))))))..............))))..))))...)))))))))))))))))))((((.((.(((((.......)).)))....(((.....)))....))))))....((.(((.(((((...)))))))).))...))..)))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((({......,,,((((,,.(((((....(((.........))))))))......}}}}......|...}|||(((,,{{(,.{{...{{..{{{|{{.........{,,|}}||||||{({,,(((,.......((((({............}}}}}|,,,...,|||,.}},........||,,.((((.{((.((((((((......))))))))))}...})))......{{.|.(((((((((((...{((....)}}.{(((((.,..(((.((((...{{{{,..{{....(((((((...{....}....}))))))....))))}))))}.)))...))))))....((((((.(((..(((.(((((((....)))))))...))).....)))..)))))).))))))))))).||||{{.{{{({,,,,((((,,((((((((((((((({....}))))).)))))))..,.}}}..}}}})))}}.))}(((((((.....)))},)))..((((......)))).|||||}||||(({{{{,.|||.|||,|}||,........||{||||{}||||||,...((((((,,,..,}.|||||.,{{{{...,(((,...(({{,{....,,}})))||{({,.....}}}.((((((.(....,.,,)))))).{((((...(((.(,,....,))))...))))),.,(({...{{{..{{({.{{{{..{(({,..,|})..}|||}}}}..}}}..,||},{,.|||,...||}}||||||,.||..|}|}}...,},},.}}.}}}}}|,,|,.{{{{{,,..(((((((((((.{,,{,((((......))))))}..)))}}))).)))),})))|||}}...,{{.(((((({...)))))))||.,({(((((..{({({{(......}}.,))),,.))))}}))..,..,|}}}}}|||,(((((((.((((..,((((.{(((({{{,,..,}}||{{{..({({(((({.{{{{||||{|,,.{||||....|||||,|,|||,},,{,,,....((((((....,{(.....,|},..{{{||.....}}}}}.))))))..((((.....)))).}}}.}})))))}))}}||||}||,,.....|||}.}}|||...,,,.,{{,.{|{{,{{.......,,,))))}.,,,})},...})}})))).))))))).||||..|||....(((((...)))))....}}}.,}}}}||})}}})))},.))))))}}}..}},}))))},}...}}))}..,)))}}))}}})),,.((((((((...((....))))))))))})))))..},.||||||||||||(((((((,.{,{{((((.,{,{.(((((.....|||||.,{{{{(((((((...((((((.(,...((.((.....))))}}.)))))))))))))}.............,||||{.||,,,{{|||}||}}}})))})))))||||.{|,||||{.......,,.}}),},.{||,,,..))),}..}},}|},...||.{{(.(((((...)))))))).)),,,))}.)))))))
Forensic Context

No forensic context available.