Basic Information

Symbol
hsa_MACF1_0035700
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-MACF1_0390
Host gene
MACF1
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
1:39806174-39838268 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
1:39340502-39372596 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-965.60 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -1015.27 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 774.21
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((.((((........))))...))(((....((((((..(((((((.((((((.(.(((((...(((((....(((((((...((..((((.(((((.(((((((((...(((....((((..(((((.....(((((......((((((((((((((((((....((((((.(((...(.(((((...(((((....((((((....(((......)))..(((((.....))))).))))))..((((.....))))....(((((((...(((((..((.............(((((..((((((((....(((((..........)))))....)))....((((((((((.......((((..(((....(((((...)))))....)))..))))((((..(((((((((((((....(((((((((((.((((....(((((((......(((((...((((((....(.((((((..(.((((((((((((..(((...(((((((((.(((.((((((((......(((((.....(((((.((((((((((((...((((((.((...((.((.....)))))).)))))))))))))).............(((((((((..((((((.((.....)).)))))))))..)))))).............))))..)))))..)))))......((....)).(((.(((((...)))))))).)))))))).)))))))))))).))).....)))))))))....))).)..)))))))..))))))....))))).....)))..))))...))))...........(((.(((((((((.........((((((.(((...(((((((...(((....)))...)))))))..)))..)))))).)))))).))).))))))))))))))))))))......((((((......)).))))......)))))))...))))...)))...))))))).......(((((((((..(((((((((((..((((....(((((((......(((.....))))))))))...)))))))))))...))))(((((....)))))..(((((.((..((.(((((...((((.((.(((....))).)))))).........((((.....))))(((.....))).........))))))).)).)))))..(((((((....))))))).........((((....))))(((((.(((((.(((((((((((((((........(((((....)))))........))))).........((((((.(((.((.((........)).)).)))))))))((((((((...((((.((((((...((....)).)))))).((((.(((((((....)))))))..))))......))))....))))))))...))))))))))...((((.....)).))...((((((((.(((.(((.((((..(((((....((((....))))...)))))..)))).).)).)))..(((((......)))))(((((((((.((..((((.(((((((.....)))))))..))))...)))))))))))..((((......(((........)))............(((...(((((..(((((..........((((((.............)))))).....(((((......)))))....(((....)))..))))).))))))))..(((((((((((..(((((((((((((....))))))))).))))....(.((((...)))).))))).)))))))))))(((..((((((....))))))..)))((((((((.........)))))))).((((.(((((((((((....(((...((((.....))))....)))....))).....((((((.(((.((..((((..(((..........)))..))))......)).))).)))))).)))))))).))))...))))).)))...)))))))))).))))))))).)))))))))).))....))))).)))))))...((((((....))))))((((.(((((((((.(((((((((.((........(((((.........)))))(((((((.((((((..(..(((.((((((..(((((.(((.(((........))).(((((....))))).)))..))).))..)))))))))..)..)))))))))))))((.......)).....((...(((((((........)))))))....))...(((((........)))))..(((((((((.((((((((..((.(((......(((.......)))......))).)).....)))))))).))))))))))).))))))))).))))))))))))).))))).......(((.(((((((((.(((((.......)))))...(((...........)))((((.((((((((((((((((.(((((........(((((.((((((..........))))))......))))).))))).)))))))))).)).))))...)))).....)))))))))..))).)))))).))))))))).....)).))))))))))................))))))....)))))))))).)))))))...))))))))).......((((...)))).))))).))))..))..))))))).....(((.(.((((((.((((......)))))))))).).))).((((((((.((.....(((((((...((((...(((((((..((..((......))..))..)).))))))))).....))))...))).....)).))))))))..)))))..))))).)..)).)))).))))))).)))))).....)))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((.,{,,........}),,...))(((.,..((((((..(((((((.((((((.{.(((({.({((,((.,..(((((((...((..((((.(((((.{((((((((...(((....((((..(((((.....(((((,.....((((((((((((((((((....((((({,(((,,{({(.{(({..{(((({,..((((((....{{(.....,|},..{{{||.....}}}}}.))))))..((((.....))))....,{{(((|,||{{{(({{{{,{{,.....,||.|{(({..((((,{((,.,|{{{{{..........)})))....))}....((((((((((..{(({.((((..(((....(((((...)))))....)))..))))||}}..{((({((((((((....((((((((({{.{{{{....{{((.,,.(({..,,|||((((((((...{{....}})))))))).(((((((((..(((...(((((((({,(((.((((((((......(((((.....(((((.(((({(((((((...((((((.(,...((.((.....))))}}.)))))))))))))}.............((((((,{{..((((((.((,...,)).))))))}}}..)))))).............))))..)))))..)))))..,,..{,....)).{{(,(((((...)))))})).)))))))).)))))))))))).))).....))))))))).,,,(((.(((((..{{((.{{{..,,,,.)).}}.)))))))}.)}))...}})}.,,,,......(((,(((((((((.........((((((.(((...(((((((...(((....)))...)))))))..)))..)))))).)))))).))).}}}||}|}}}||||||.,.},,,..}||||{{,,....)},))}}|||,..,}})))},,,}}})...)))...)))))))....,{.,{{{{{{{{.{(((((((((((..((((....(((((((...,.,|||.,}},|,,)))))))...)))})))))),..,))))|((((,..,|}|||.{((({{.,,..{|,||((({(.((((.((.(((,,..}}|,|||}|}..,,.),))))|,.,...|||{{{,.{{{{{,|,.|.{{{{{,,,,,,)}))}})},}.}|||||||,,,,)}}}}}..........((((....))))(((((.(((((,(((((((((({{{,{,,......{{{{,...,||}||{{{,....,)))).|.......((((((.(((.({.((........)).)}}))}))))))((((((((...{{{{.((((((...((....}).)))))).((((.(((((((....)))))))..)))).....,})))....))))))))...)))))))))}.,.(({(.....)}.}}...,(((((((.(({.{({,((((..(((((,{..((((....))))..,)))))..)))).).)).})}..{((((......))))}((((((((,,{{..(({{,|((((((.....)))))))..)))}...})))))))))),.{(((,..,..(((........)))...{{{.,,...{,{,,.|((({.,(({((|,|,......{{{{{|,,..,,,......}})))},....{{{((......)))}}...|{|||,,.,,,||))))}.}}},}}}}..,{(((((((({..(((((((((((((....))))))))).))))....{.((((...)))).})))).)))))))))))(((..((((((....))))))..)))((((((((.........)))))))).((((.(((((((((((..,,(((.,.((((.....))))....))}.,}.))).....((((((.(((.{(..((({..(((..........)))..))))......)).))).)))))).)))))))).))))...)))))})})...)))))))))).}}}}})))}}||||}}}},,,)}..,|}}||}.}}}|||,,|,((((((....)))))){||,|||(((({((.((((((({{.{{........{((({..,,,,.,.)}||}(((((((.((((((..(,.(((.((((((..(((((.(((.{{,........,}|.(((((....))))),)))..))).))..)))))))))..),.)))))))))))))}},.}}}.,|},,.,.||,,.{{(((((.{....,.})))))),.},))...(((((,.,,,...)))))..(((((((((.((((((((..,{.{{{......,(({{,,,{|},,...,..))).)).,,..)))))))).)))))))))||,}}})))))}.))))))))))))).}|}},.......(((.((({(((((,{((((......,)))))..,{||...........}}}|{{{.{{{{{((((({(((({.{||||...,||..|{||{.((((((..........)))))).,..||}}}||.|}}}}.})}}}}}}}}.))}))}}.,||||,,..,.))))))})),,))).)))),,.))})))))).....))}})))))))))................))))))..,.}))))))))).)))))))...))))))))|.......((({...)))).))))).))))..))..)))))))...,,|||}|.((((((.((((......)))))))))).|{||,.((((((((.{{.....(((((((({.{{{(...{{{{(((,(({,,{,.{{...,..,}..,)}.}}))))))),,.....)))))))).....}).))))))))...,,))}}))))).}..)).)))).))))))).))))))...,.)))
Forensic Context

No forensic context available.