Basic Information

Symbol
hsa_MACF1_0039300
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-MACF1_0605
Host gene
MACF1
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
1:39816457-39824545 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
1:39350785-39358873 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-363.20 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -382.59 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 349.03
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((....((((.(((.((((..(((((((((.(((((..((((..((....)).)).)).)))))))(((......)))..((((......))))(((((((((.........((((((.(((...(((((((...(((....)))...)))))))..)))..)))))).)))))).)))((((......)))).((((((((((..((((((......)).))))(((......)))....(((........)))(((..((.(........).))..)))..((((..(((((((...((((((.......((((((((...(((((((.((..(((((((....))))((((.((((.((..((..((((((....((...(((((.((((.((.(((....))).))))))..)))))))((((.....))))........((((((((......((((.((..((((((((((((((....)))))))...........((((..............)))))))))))....))..))))...)))))))).(((.(.((((.....)))).)..)))..((((((.(((.((.((........)).)).)))))))))((((((((...((((.((((((...((....)).)))))).((((.(((((((....)))))))..))))......))))....)))))))).....))))))..))..)).)))).).)))...)))..)))))))))(((((((..(((((....((((....))))...)))))..)))).).)).((((.(((((......)))))(((((((((.((..((((.(((((((.....)))))))..))))...)))))))))))...)))).....)))))))).)))))).)))))))..))))...((((.......)))).........))))))).)))............))))))).)))).)))))))...((((((......)))))).......))(..(((((((((((..(((((((((((((....))))))))).))))....(.((((...)))).))))).)))))))((..(((..((((((....))))))..)))...)).........)
Thermodynamic Ensemble Prediction
,,....((((.(((.((((..{{(((((,(,(((((..{{((.,,,..,,,,.)).}}.))))|||((({{{{..,,,,.,,...|||.,{|||}}||,(.(((((((((.,((((((.(((...(((((((...(((....)))...)))))))..)))..)))))).,..{.(((({{{((((,(({.,(((((......,..))))){(((....,({({{{(((......})}....{{{........}}|(((..((.(........).))..)))}}|||||,,..||||...,((({(((.....{|||.}}},..{||||||,,{,||||||||,,..|,||(((((((....))))).))||,|.....||,||,{{|{.((((.({.{{(,,..}}|,|||}|}..,}})}))))|......||((((,,(((((.,..{.(((((......))))),},...))))))))}}}))}}}).....))).)))))))))).,.))))))))).)..{{{{|||{|||||.||}.,....||||,...{|||||(((,.....}}}|,|.......((((((,(((.{{.((........)).}}}))}))})))(({{((((...{{{{.((((((...((....}).)))))).((((.(((((((....)))))))..)))).....,}})}....)))))))}...}}))))))},.|||}|{{{||,|.,{{,...|((,(({,|,|}}||}((((..((({{||.,({((....)))).,,)))))..)))),}.}},||||.||(((,.....))}},((((((((,,{{..{{||,|({((((.....)))))}}|.,}}}...}||||||}}}},,.{{,......||{}}.,,.,,))}...|||.||..,}}}},.{{{(...,,,|}},}.........,.,)}}}}))}}|}}...})),.))))))).}))}.})))))),..{{((((......}})))}.......,,,...,{{{{{{{{{..(((((((((((((....))))))))).))))....{.((((...)))).}))}).)})))||||.,(((..((((((....))))))..)))...)),,,......}
Forensic Context

No forensic context available.