Basic Information

Symbol
hsa_MACF1_0040200
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-MACF1_0613
Host gene
MACF1
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
1:39818679-39847824 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
1:39353007-39382152 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-832.80 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -879.77 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 698.31
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.......(((........)))(((..((.(........).))..)))..(((((((..((((....(((((((......(((.....))))))))))...))))))))))).(.(((((((((....))))).)))).).....((.((.((((.((((.((.(((....))).))))))..)))))).)).......((((((.((((((......(((((......)))))......))))))(((((((((.....((((((((((..(...(((.((((((..(((((((((((((((((((........(((((....)))))........))))).........((((((.(((.((.((........)).)).)))))))))((((((((...((((.((((((...((....)).)))))).((((.(((((((....)))))))..))))......))))....))))))))...)))))))))).(((((((.((...((((....((((((((..(((..((((..(((((....((((....))))...)))))..))))...(((((.(.(((((......)))))((((((((........)))))))).......(((((((...((((...(((((((..((((..((.....(((........)))...((((((.....(((..((((.(((.(((..............)))..)))..))))..))).....)))))).((((.(((......((((((.((((((((((.....(((((....(.(((((.((((..(((((((((....)))))))))(((((...(.(((((((.((((..(((((..(....)..)))))....))))))))))).).....((((((((.........)))))))).((((.(((((((((((....(((...((((.....))))....)))....))).....((((((.(((.((..((((..(((..........)))..))))......)).))).)))))).)))))))).))))...)))))............((((.((..((.((((((((((.....))..((((((.....(((..(.((((((....)))))).)..)))((((.((((((((((.............(((((.........))))).((((((.((((((..(..(((.((((((..(((((.(((.(((........))).(((((....))))).)))..))).))..)))))))))..)..))))))))))))))))))......)))).)))).(((((((........)))))))..))))))...)))))))).)))))))).(((((((((.((((((((..((.(((......(((.......)))......))).)).....)))))))).)))))))))(((.....)))..))))))))).)...)))))...........))))))))))(((((.......)))))..((((...........))))....(((..(((((.((((((.........((....((....))....)).........)))))).)))))...)))..(((((((((.((((((.(((.(((..((.(((....))).))..))).))).))..(((......)))..)))))))))).)))..)))))).....)).).))))((((((...)))))).((((......)))).))..)))).))))))).(((((((.((((.....(((((...((..((((..((((((.((((......))))))))))(((((..((((((((.((.....(((((((...((((...(((((((..((..((......))..))..)).))))))))).....))))...))).....)).)))))))).....)))))..(((.(((((.......))))).))).(((..((((.((..(((((((..((((((.(((..((.((((((..(((((......)).))).)))))).)).))).))))))...))))))))).))))...........((((((((...............)))))))).....)))((((.((((....)))).))))...(((.((((((..(.(((.....))).)...)))))).)))))))..))..))))).....)))))))))))....(((((...))))).....)))).))))))).....(((((...((((...((((((((..(((...(((((((..((((((((........((.(((..((((((....((..(((....))).))))))))..))).))......))))))))))))))).......)))..)))...)))))...........(((((...))))).)))))))))((((..((.(((((..((....))))))).))..))))....).))))))))))))))))....))))...))))))))).))))..))))))))).)..)))).))).))).....)))))))))....(((....))).......(((((..(......)..))))).))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
.({......||...{{,.{{((((..({.{.......,|,||,.}||(((((((((,,((((....((({(((.....,|||.}}|,||.|||||}}...}|||||||||,.,|}|||(((((,,.,|}|||.|(((,,.....{|,||((({(.((((.((,(((,,,.}}|,|||}|,...,,),))))},.,...||((((,,(((((.,..{.(((((......))))),),.,.})))))||}},,}||||,..........((((....))))(((((.((((({(((((((((({({{(,,......,((({....|)}}}{{{{....,)))).,....,..((((((.(((.((.((........)).)),))}))))))((((((((...((({.((((((..,((....}).)))))).((((.(((((((....)))))))..)))).....,})))....))))))))...)))))))))}.|.((((.....)}.}},,.,(((((((.(((.(({.((((..(((((,{..((((....))))..,)))))..)))).).)).)))..{((((......))))}(((((((({{((..((((.{((((((.....))))))),.))))...)))))))))))..((((,.....(((........)))...|||.,,...{{{,,.{((((.,(({(({,,,,.....{{{{{{,,..,,,......}})))},....{((((......))))}..,,(((|...,,,,,))))}.)))}})))..,((((((((((..(((((((((((((....))))))))).))))....{.((((...)))).})))).)))))))))))(((..((((((....))))))..)))((((((((.........)))))))).((((.(((((((((((..,,(((.,.((((.....))))....))}.,}.))).....((((((.(((.{(..((({..(((..........)))..))))......)).))).)))))).)))))))).))))...)))))})})...)))))))))},||||}|}}|}||||||.....||..,|}||,|,,}}|||.,|,|{{(({....)))})),)|||||||,|,.,,,.{{{{{{..{{,,......,||||||,}},.,,}}|{||{((,(({((((((,,{..(((.((((((..(((((.(((.({,........,,|.{((({....}))))|)}}..}}).))..))))))}}}..},.||||}}|||}}}}}}}|||||{|||},,,,,...(((((((.{....,.))))))){{((((...(((((........)))))..(((((((((.((((((((..,{.{{{......,(({{,,,{|},,...,.,))).)).,,..)))))))).))))))))).((((((((((..(((((((({((((((({.........(((.(((.(((((...{{.....}}))))))))..))).......((((((((((.(((({{((((.{.((((((((....{((....)))..{({....)))....((((({.((((({,((((.((((((((..{({{(((((((((({.(((,.((.(({,,.,)},.}}..)}).),...{{{(((......))).))).))))))))))).,}.))))).............((((((...)))))){((((......(((((.....))))}...))))})})))}}..{{{....}}|,,......,,}}.,.((((((.((((......))))))))))....))))).})))))........)))))))).}.)))}...((((........)))),..,.......,},..)))).))))))))))..........(((((((((((((....(((((({.,((,(((((.......)))))})||{{(((.((((.((..(((((((..((((((.(((..((.((((((..(((({......))},}}.)))))).)).))).))))))...))))))))).))))...)))...}}}}..}.))))))..))))))))))))))))))))))..{(((,.,((({{{.}|}}.|||{(.......,,|||}}}}||,....}}}}})...})))}))))))))).)))))}......,))))..}|||}}...,,|||}}}}.}}}}||||||||||......{{{{.,.(((({...((((...((((((((..({{.,,(((((((..((((((((........((.(((..(((((,...,((..(((....))).))))))))..))).))....,.))))))))))))))).......)))..))}...))))),,.....,,..(((((...))))).)))))}))}...},.})))||||{(((...((.((((.{.(((.(((((,.,....,,|(((((....))))))))))).)))))))))).)))).)))),,)))))}..,..})}})}))))}}})),))),})},}}}}}...,,.)))}}.,.|||||..{|{......)))})))}))).,
Forensic Context

No forensic context available.