Basic Information

Symbol
hsa_MACF1_0042100
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-MACF1_0193
Host gene
MACF1
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
1:39826465-39851601 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
1:39360793-39385929 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-655.40 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -694.11 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 375.49
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((..((((((((((...(((((.(((.(((..........((((.((..((.((((((((((.....))..((((((.....(((..(.((((((....)))))).)..)))((((.((((((((((.............(((((.........))))).((((((.((((((..(..(((.((((((..(((((.(((.(((........))).(((((....))))).)))..))).))..)))))))))..)..))))))))))))))))))......)))).)))).(((((((........)))))))..))))))...)))))))).)))))))).(((((((((.((((((((..((.(((......(((.......)))......))).)).....)))))))).)))))))))(((((((((((((((((.((((((((.(((...............(((((((((((((...(((......(((((...((((......(((((.(((((..((((.(.((((((((....(((....)))..(((....)))....((((((.(((((..((((.((((((((..((.((((((((((((.(((..((.(((....))).))..))).)....((((((......))).))).))))))))))).)).))))).............((((((...))))))(((((......(((((.....)))))...))))))))))))..(((....)))...............((((((.((((......))))))))))....))))).))))))........)))))))).).))))...((((........))))(((((.(((..(((((.(((..(((((..(((.........))).)))))........(((..((.(((.(((((.......))))).))).))..))))))))))).))))))))))))).)))))((.((((((..(((((......)).))).)))))).))((((((((..(.((......))).)))))))))))).)))))....)))....))))))).....((((((.......((((.((((....)))).)))).......))))))...........((((.....))))((((((((((((((((..((((..(((....(((((((...(((((...)))))...(((((((((.....(((..((((..........))))..))).....)).(((((((..((((((((........((.(((..((((((....((..(((....))).))))))))..))).))......))))))))))))))).......)))).)))...)))))))....)))..(((((...))))).(((((((..((....)))))))))(((...((.((((.(.(((.((((((.........(((((....))))))))))).)))))))))).))).((((((((((........((((((((((((((..(((((...(........).))))).(((((((..(((......((..((((((((((....)))...)).)))))..))......))).)))))))...........((((((.((((((((..........))))).))).))))))(((((.(.........).)))))....)))))....)))).)))))....((((((((.(........).))))))))))))..))))))..)))))).)))))))))....)))))))))))))).)))))))).)))..)))))))))).))))))))))..)))))....))))))))))..)))(.(((...)))......((((..(((((...)))))..))))....((((.(((......(.(((((((......)))))))))))..))))..((((((...(..(((((.(..((((((((((((..(((((..((((......))))..))))))))).)))...)))))..))))))..)...)))))).((((((((...))))))))..)
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((..((((((((((...(((((.(((,(((.....,,,,,((({.{(..{{.((((((((((.....))..((((((.....(((..(.((((((....)))))).)..))){(((.(((({(({({.............(((((.........))))){((((((.((((((..(,.(((.((((((..(((((.(((.{{,........,}|.(((((....))))),)))..))).))..)))))))))..),.)))))))))))))))}})......)))).)))}.(((((((.,....|.))))))),.))))))...}))))))).}))))))).(((((((((.((((((((..,{.{{{......,(({{,,,{|},,...,..))).)).,,..)))))))).))))))))){{{((((((((((((((.((((((((.(((.........{{{.{{(.(((((.,{(({....,,})))))}}..}}}.......{(((((((({.(((({{((((.{.((((((((....{((....)))..{((....)))....((((({.((((({,((((.((((((((..{({{(((((((((({.(((,.((.(({,,.,)},.}}..)}).),...{{{(((......))).))).))))))))))).,,.))))).............((((((...))))))|{{{{......(((((.....)))))..,))))}}}}}}}|..{{{....}||{{.......|||.,.((((((.((((......))))))))))....))))).})))))........)))))))}.}.)))}...((((........}})),,.,...,...}},.,)))).}))))))))).........{(((((((((((((....(((((({.{((,(((((.......)))))})||,{(((.((((.({,.(((((((..((((((.(({..((.((((((..(((({......))},}}.)))))).)).))).})))))...)))))))}}.))))...)))...}}}}..}.))))))..)))))))))))))))..{{{{{,{{{(({.{(((,...)))}.||||{.......,,},)),,)))},...{{{(.....)))}((((((((((((((((..((({..(((....(((((((...(((((...)))))...{((((({{{..,..(((..((((..........))))..))).....}|.(((((((..((((((((........((.(((..(((((,...,((..(((....))).))))))))..))).))....,.))))))))))))))),......})))},))...)))))))....)))..(((((...))))).(((((((..,,....},)))))))(((...((.((((.(.(((.(((((,........{(((((....))))))))))).)))))))))).))).((((((((((........((((((((((((((.{(((((......,,....).)))),.(((((((..(((......((..((((((((((....)))...)),,))))..))......))).)))))))...........((((((.((((((((..........)))))}})).))))))(((((.,.........).))))).,,.)))))....))))},))))....((((((((.(........,.))))))))))))..))))))..)))))),}))))))))....)))))..,}}.))).)))))))).)))..))))))))))}})))))))))..)))))....))))))))))..)))(.(((...|||..,...{{{|..(((({...))))).,||||....,,||,||{....,{(.(((((((......))))))).},),,)})}..((((((...{..(((((.{..((((((((((((..(((((..((((......))))..)))))))))},))...)))))..})))))..}...)))))).((((((({...})))))))..)
Forensic Context

No forensic context available.