Basic Information

Symbol
hsa_chr1_0858000
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-MACF1_0105
Host gene
MACF1
Type of circRNA
Intergenic-Intergenic
Location (GRCh37)
1:39883481-39884298 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
1:39417809-39418626 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-199.39 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -213.23 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 176.58
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(.((((((((((((.((((((((((((((((((((.((((((.(((((((....)))......(((((.......)))))......((((((.((.....((((((((.(((((((((((((((.......)))))..))))).))))).))))))))(((((..(((((((.((.......(((..............(((((...........(((((((((((........)))).........((((.(((..((((...........))))..)))))))............(((.................)))......(((((...((((.......))))....)))))........((((((.....................................................))))))..................((((....)))).................)))))))((((((...(((((.....)))))................................((((............)))).............((((.((.....)).))))....(((((.......))))).........))))))............)))))..............))).......)).)).))))).)))))..........)).))))))(((........)))...(((((((((.......))))))))))))).)))))).)))))))))))))))))))).)))))))))))).)(..(((...........)))..)
Thermodynamic Ensemble Prediction
(.((((((((((((.((((((((((((((((((((.((((((.(((({((....}}}......((({{.......|||||,.......{,{,.({,....((((((((.(((((((((((((((.......)))))..))))).))))).))))))))|||||}}|||||||}.........................,|{({{...........,..(((((,{,........}}))))}..,,..((((.(((..((((...........))))..)))))))...{{,......|||............,,,.{|||......(((((...((((.......))))....))))).....{{,,.((((.....)))},,,........................,,,,,..............{{|}......,}}.........{{,....,||||.....,,|..{,,....,,.{(({{,,{{{,,.{{.,,,,||||||,..........,,...,....,,,..........|{{{..,.........))}}.............{((({((....})),))}}....{{{{{.......}}}},..,..,,,,|||||,,..{{{..,,.{||,..........}))}}))))..,,}}}.)}),.})),}..)))),,........,,}))))))|{{.,,.....)))...(((((((((.......))))))))))))).)))))).)))))))))))))))))))).)))))))))))).)(..{{{..{,.....,.)))..)
Forensic Context

No forensic context available.