Basic Information
Symbol
hsa_MACF1_0049700
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-MACF1_0609
Host gene
MACF1
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
1:39888046-39898827
UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
1:39422374-39433155
UCSC (hg38)
External Database
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-543.10 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-576.31 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
394.19
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.(((((......)))))..((..(((((((((.(((.........(((((......)))))(((((((((((((((...((((..........(((.((((.(........).)))).))).......((((.....((((((.....)))))).......))))))))...)))))((((((((......)))((((((((((((((.....((((.(((.((((((((((....))))..(((((((((..((...(((...))))).)))))))))...(((((.((((((((((((...(((((.........((((.......((.((((((....)))))).))....)))).....))))).......))))))..)))))).))))).......(((((((((((...))))))))............((.((((((((.(((.(((((..((((........(((((.....)))))..(((....)))((((.....((((((.......((.(((..(((......)))..))).))..)))))).)))).)))).))))).))).))))).))).)).......(((((((.........)))))))....((((((............)))).))....))).))))))))).))))....)))).......))))))))))))))).((((.((((......((((((.((((((((((((((.......(((((((....((((...(((((......))))))))).))))))).(((((((((((...........))))).)))))).((((((((......(((........)))........)))))))))))))))).)))).))...)))))))))).))))(((((((((((..((((((.(((((...........(((((.((......)).)))))(((..((((((.((((((((.(((..((((((............(((((((...((..........))...)))))))...((((..(((((((((...((...((.(((((((.(((....((((.(((.((......)).)))))))......))).))))...(((......))).((((((((..(((.(((.........)))...))).)).))))))(((((.((((((..((.......)))))))).....)))))))).))...))...)))))))))....))))((((.(((...))).)))).((((........)))).(((((....)))))........)))))).))).))))....(((....)))(((((((((((((((........(.((((.((((((((.((.((....)).)))))))))......).)))).)....)).)))))))))))))....((((((........((((((..(((((((........))))).))..))))))))))))......................)))).))))))..))).))))))))))).....(((........)))...(((.(((.(((((.(((..(((.....)))..))))))))))))))))))))))))).....(((((.(((.((((((((.(((............))))))))))).))).)))))..((((....)))))))))))))).))).)))))))))(((......)))....)).
Thermodynamic Ensemble Prediction
.(((((......)))))..((..(((((((((.(((.........(((((......)))))((((((((((.,{((...((((.,......,{({({,,,{.|}.,|||,....},|,||,,.,,,,,{,{(..,,.((((((.....)))))).......|||}|||}...,,,,|||{{{(((......))){(((((((((((((.....((((.{((.((((((..(((..{({{,.((((,(((((((...,.(((,.{{{,..}))},.,|||...(((((.(((((((((({{...(((((.....,...((((.......{{.((((((....)))))).}}....)))).....)))})..}....,)))}}|.}))))).))))),......}},((((((((...)))))))).....,,.....||.||||{{{|,||{|{{{||,,|,,|||,,.,..(((((.....)))))..(((....))){(((.....{{{{{(.......{|,{||,,(((,,,...|||,,|}},||,.}|||}|,||}}.||||,|||,,,},..}}))).))),))....})}||||{,|,,,,,,..})))))),}}).}.)))))).....}))))))}||....,,))).)))))))))}))),....)))).......))))))))),|||||.((((.((((......((((((.((((((((((((((,......(((((({....((((..,(((((......))))))))).))))))).(((((((((((...........)))))},))))).{(((((((,{{,..(((........)))....}.,})))))))))))))))).)))).)),..)))))))))).))))(((((((((((..((((((.(((((...........(((((.((......)).)))))(((..((((((.((((((((.(((..((((({.........{{.(({{(((...((,,......,,||...}}}}}},..,}||||,,|{||||||...,,...,,...,((((.(((....((({{(((.((......)).)))))))......))).))))...{,{....,,|||.((.,(((((...((((({{........,|...{({{{|{||}|||{{,||,{(({{(,,{{,.,....}.))}}))).)}})))}})))})))...)))})}}))))))),...,,.(((({((....}))})))).((((........)))).(((((....)))))........}))))).))).)))),...{{{....)}|(((((((((((((((...,....(.((((.{(((((({,((.((....)).)))))))))......}.)))).}.,..))}})))))))))))),...(((((({,,,....,((({{..((((,((.....,,.))))}.)),.})))})))))))....................,,)))).))))))..))).))))))))))).{({.{{{........)}}..,|((.(((.((({({(((..(((.....)))..)))))))))))))}))))))))))),,,},((({|.||{,((((((((.{{{.,,.......,.))})))))))).))},))))).,|(((....)))))))))))))).))).))))))))),|,.....,|||...,)),
Forensic Context
No forensic context available.