Basic Information

Symbol
hsa_MACF1_0058400
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-MACF1_0186
Host gene
MACF1
Type of circRNA
Intron-Exon-Intron
Location (GRCh37)
1:39899660-39905372 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
1:39433988-39439700 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-429.70 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -459.35 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 442.61
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(.............)(..(((((((((((((.(((((((.((((((((.((((.(((((((((((((.((.(((((...((((((((((((.....................(((((.(((((........))))).)))))((((((..((((((((.((((........(((..((((((..((.((((((((.........)))))))).))..))))))..)))........)))).))))))))....))))))...((((.((((((((((((((((((((...((((...)))))))).)))))..(((((...)))))(((((((..(((((((((............................)))))))))....)).)))))..........))))))))))).))))...........)))))))))))).....((((((((.((..((.((((....((((.(((.....((..(((..((((.((((((((..((.(((((((...(((....)))...)))....)))).))..)))).((((..((((.((((.(.((.......)).)))))..))))))))(((((.....))).)).)))))))).))))).....))).))))....)))).))..))))))))))..........................(((....))).(((....((..(((........))).))....)))...(((((.........)))))...(((((((((((.....((..(((((((((..(((((((..((((((((....))))...(((((((..(((...((((......)))))))..)))))))........((.((.(((((.((.((....(((((...)))))..)).)).))))).)))).(((((((.(((.((((..(.....)..))))..)).).))))))).....((((((((((...((.(((((((....((((.....(((((.((((((...((((.((.......)).))))...))....))))))))))))).......))))))).))......((((((......))))))....)))))))))).((((((((..((((.(((.(((((......((((((((...)))))))).((((.((((.((((.((((..(((.((......)).)))..)))).))))......)))).)))).(((((.(((.....))).)))))..))))).))).))))))))))))...........(((.......)))(((.(.((((.((..((((..(((((((((((.(((.......)))..))))))))((((((........)))))).))).))))..)).)))).)))))))).))))))).....)))))))))..))...))))))))))).))))).)).))))))))))))).)))).)))))))).))))))).)))))))))))))..)
Thermodynamic Ensemble Prediction
(........,....,|,.(((((((((((((.(((((((.{(((((((.((((.(((((((((((((.((.((((((((((((((((((((.......,{{{,,,,,.....{{{{{.{{{{{.....},,))))),}}}}}((((((..((((((((.((((........((({,((((((,.{{.((((((({..,,,....}})))))}.},,,)))))),,})),,.},,,,)))).))))))))....)))))},,,((((,{{(((((({{(,(({,,,.....{{{.,,.|}|||||}.||||,..,.,,..|{{.(((((((.{..{{(({...}}))).}.))))))).))},,|||,,,.,,))))}},}},...}},}}})),},,,.,,,,}}))}}}}})},}}}}.....,,,,..)))))))))))).....((((((((.((..((.{(((....((((.(((.....{{..(((..((((.((((((((..((.(((({((,..(((....}))...))),,,.)))).))..)))),((((..((((.((((.{.((.......)).)))))..))))))))|{(({.....})).}}.)))))))).)))}}.....))).))))....}))}.))..))))))))))...,,,.(((((({.{{{{.......,,,..,.|||,({{....((,.(((,.....,,|||,{||,{||||...(((((.........}}|||,..,((({..,,,.,,{.|||({.......}}.{(.,((((((,,(((((....(((({...,,|||}|}((((({{({({......}}},||{.,{,|{|{,........}))),)}.)))))).))))).(((({...})))),}))}},,))))}},}}..((((((({{((.((((..{.....,..)))).,}).).))))))).....{(((((((((...{{.,{{,,,,....,((({(({{((((({{{{{(({{{({((,((....,,.}}.})))...)).,..}})))))),}).,..,}}},},)))))}))......((((((......))))))....)))))))))).{(((((((.,((((.(((.(((((......{(((((({...})))))))||({(|{{{,..{{.{((({..,|}}||.}},..,|{|||{{.,,|,))).},,...}}}..,,,...|}||},,},,{|||,,.,,}}},.))))).))).))))))))))))...{{,..,..,,|,}},,.,)))}}}}))},||||||||{{,..,||||||||||}|||.,,...}))).})),,,,,)|{||||......,})),)))}}}}.}}}....{(((((((...)))))))}|||...,))},,,,,,,,,,.,,,.,.......))))}}))).)).))))))))))))).)))).)))))))).))))))).)))))))))))))}.)
Forensic Context

No forensic context available.